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2006 Fiscal Year Annual Research Report

溶液内素過程の化学反応ダイナミックス

Research Project

Project/Area Number 18066008
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

加藤 重樹  京都大学, 大学院理学研究科, 教授 (20113425)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 武志  京都大学, 大学院理学研究科, 助手 (30397583)
Keywords化学反応 / ダイナミックス / 溶液 / 励起状態 / 酵素反応
Research Abstract

平成18年度は、以下の研究を行った。
(1)9H-アデニンの水溶液中での励起状態の極めて速い無輻射失活の機構を明らかにするため、水およびアセトニトリル中での基底状態および4個の励起状態の間の円錐交差の構造とエネルギーをRISM-SCFに基づく線形応答自由エネルギー法を用いて求めた。
(2)プロトン移動と結合した電子移動反応の速度を求める理論的方法を開発し、アセトニトリル中でのユビキノールとフェノキシラジカルの反応に適用した。
(3)QM/MM法に対する線形応答自由エネルギー法を開発し、水溶液中での化学反応および酵素反応(chorismate mutase)に適用した。酵素反応については、水溶液中での反応と比較することにより、タンパク質酵素の役割について論じた。
(4)3D-RISM-SCF法に対して効果的な計算方法を提案し、水溶液中での励起エネルギーの溶媒シフトを求めた。この新しい方法の有用性を示した。
(5)RISM-SCF/MP2自由エネルギーに対する解析的エネルギー勾配法を開発し、エーテル中でのGrignard反応に適用した。

  • Research Products

    (6 results)

All 2007 Other

All Journal Article (6 results)

  • [Journal Article] An efficient implementation of three-dimensional reference interaction site model self-consistent-field method : Application to solvatochromic shift calculations2007

    • Author(s)
      N.Minezawa, S.Kato
    • Journal Title

      J.Chem.Phys. 126

      Pages: 054511(15)

  • [Journal Article] Solvent effect on conical intersections in excited state 9H-adenine : Radiationless decay mechanism in polar solvent2007

    • Author(s)
      S.Yamazaki, S.Kato
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 129

      Pages: 2901-2909

  • [Journal Article] Analytical RISM-MP2 free energy gradient method : Application to the Schlenk equilibrium of Grignard reagent2007

    • Author(s)
      T.Mori, S.Kato
    • Journal Title

      Chem.Phys.Lett. 437

      Pages: 159-163

  • [Journal Article] Transition state determination of enzyme reaction on free energy surface : Application to chorismate mutase2007

    • Author(s)
      M.Higashi, S.Hayashi, S.Kato
    • Journal Title

      Chem.Phys.Lett. 437

      Pages: 293-297

  • [Journal Article] Geometry optimization based on linear response free energy with quantum mechanical/molecular mechanical method : Applications to Menshutkin-type and Claisen rearrangement reactions in aqueous solution2007

    • Author(s)
      M.Higashi, S.Hayashi, S.Kato
    • Journal Title

      J.Chem.Phys. 126

      Pages: 144503(10)

  • [Journal Article] Ab initio calculation of proton-coupled electron transfer rates in the external-potential representation : A ubiquinol complex in solution

    • Author(s)
      T.Yamamoto, S.Kato
    • Journal Title

      J.Chem.Phys. (in press)

URL: 

Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

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