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2007 Fiscal Year Annual Research Report

量子化学計算による生物無機化学の新たな展開

Research Project

Project/Area Number 18350088
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

吉澤 一成  Kyushu University, 先導物質化学研究所, 教授 (30273486)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 塩田 淑仁  九州大学, 先導物質化学研究所, 助教 (70335991)
蒲池 高志  九州大学, 先導物質化学研究所, 学術研究員 (40403951)
Keywords量子化学 / 酵素反応 / 生体分子 / 密度汎関数法 / 分子力学 / 電子輸送
Research Abstract

ヘムや非ヘム鉄酵素による触媒反応において生成する反応性中間体は、生物無機化学や生化学の分野で熱心に研究されている。これらの研究を通じてヘム、非ヘムの鉄オキソ中間体は様々な炭化水素の酸化反応に対して重要な役割を果たすと考えられている。本研究では、Namらとの共同研究により、非ヘム鉄錯体(TPA)Fe(ClO_4)_2を用いたオレフィンの酸化反応に関して実験とDFT計算の両面からその理論的解析を行った。アルキルペルオキソ錯体[(TPA)Fe(^III)-OOtBu]がエチレンを直接酸化する反応経路とO-O結合のラジカル的な開裂を経て生成したオキソ錯体が反応活性種となるふたつの反応経路についてそのエネルギー変化を解析した。計算の結果、反応の初期段階であるO-O結合開裂の活性化エネルギーは24.5kcal/molであり、アルキルパーオキソ種が直接反応する場合の活性化エネルギー44.Okcal/molより低いことが判明した。このため、鉄オキソ種の生成が速やかに進行するものと予想される。つづくエチレンの酸化過程では、活性化エネルギーの高い第一段階目のC-O結合の生成が律速であることが示唆された。この反応経路はP450の反応と類似しており、実験結果も考慮すると非ヘムのアルキルペルオキソ鉄錯体もまた有用な酸化剤となりうると判明した。また、アルキルペルオキソ錯体の第6配位子がO-O結合の活性化に大きく影響を与えることを明らかにした。

  • Research Products

    (13 results)

All 2008 2007 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (2 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Theoretical Analysis of the Reaction Mechanism of Biotin Carboxylase2008

    • Author(s)
      Y.Ito
    • Journal Title

      Journal of Chemical Theory and Computation 4

      Pages: 366-374

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis and Characterization of Novel Ferrocene-Containing Pyridylamine Ligand and Their Ruthenium(II) Complexes: Electronic Communication through Hydrogen-bonded Amide Linkage2008

    • Author(s)
      T.Kojima
    • Journal Title

      Inorganic Chemistry 47

      Pages: 886-895

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Does Cob(II)alamin Act as a Conductor in Coenzyme B_<12> Dependent Mutases?2007

    • Author(s)
      P.M.Kozlowski
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition 46

      Pages: 980-983

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Vibronic Interaction in MetaHoporphyrin π-Anion Radicals2007

    • Author(s)
      K.Yoshizawa
    • Journal Title

      Journal of Physical Chemistry A 111

      Pages: 852-857

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photoswitching of Conductivity through a Diarylperfluorocyclopentene Nanowire2007

    • Author(s)
      A.Staykov
    • Journal Title

      Journal of Physical Chemistry C 111

      Pages: 3517-3521

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Combined Experimental and Theoretical Evidence or NonhemeIron(III)-Alkylperoxo Species as a Sluggish Oxidantin Oxygenation Reactions2007

    • Author(s)
      M.S.Sea
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition 46

      Pages: 2291-2294

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Theoretical Study of Donor-π-Bridge-Acceptor Unimolecular Rectifier2007

    • Author(s)
      A.Staykov
    • Journal Title

      Journal of Physical Chemistry C 111

      Pages: 11699-11705

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Computational Mutation Analysis of Coenzyme B_<12>-Dependent Diol Dehydratase2007

    • Author(s)
      T.Kamachi
    • Journal Title

      Chemistry-A European Journal 13

      Pages: 7864-7873

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DFT Analysis of Cubane-Type Felr_3S_4 Clusters.Dinitrogen Binding and Activation at the Tetrahedral Fe Site2007

    • Author(s)
      P.M.Kozlowski
    • Journal Title

      Bullet in of the Chemical Society of Japan 80

      Pages: 2323-2328

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Methane hydroxylation by transition-metal oxides and metalloenzymes2007

    • Author(s)
      K.Yoshizawa
    • Organizer
      The Third Asisn Pacific Conference on Theoretical & Computational Chemistry(APCTC3)
    • Place of Presentation
      北京、中国
    • Year and Date
      20070922-26
  • [Presentation] Computational approach to catalytic mechanism for alkane hydroxylation by metalloenzymes2007

    • Author(s)
      K.Yoshizawa
    • Organizer
      The 13th International Conference on Biological Inorganic Chemistry(ICBICI3)
    • Place of Presentation
      ウィーン、オーストリア
    • Year and Date
      20070715-20
  • [Book] Yoshizawa, K. Methane Hydroxylation by First Row Transition Metal Oxides Morokuma, K.; Musaev, D.G.Ed.;Computational Modeling of Principles and Mechanisms of Transition Metal-Based Homogeneous Catalytic Processes;2007

    • Author(s)
      K.Yoshizawa
    • Total Pages
      18
    • Publisher
      Wiley-VCH
  • [Remarks]

    • URL

      http://trout.scc.kyushu-u.ac.jp/yoshizawaJ/index.htm

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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