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2007 Fiscal Year Annual Research Report

転写制御蛋白質による転写終結領域の構造変化と機能解析

Research Project

Project/Area Number 18370073
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

PENMETCHA Kumar  National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 生物機能工学研究部門, 主任研究員 (80357938)

Keywords転写制御 / RNA / RNA結合蛋白質 / オペロン / モチーフ配列 / L-ヒスチジン / X線解析 / 発現
Research Abstract

In vivoでhutターミネーター(転写終結)領域内のHutP結合部位の重要性を検定するため、2,箇所(5'側と3'側)のNAGモチーフ配列に塩基置換を施したhut-lacZ融合ベクターを作製し、Bacjllus subtilisの1A1もしくはH:UTPN1株のamyEの位置に導入した。H:UTPN1株はHutP遺伝子のコード領域に4塩基の欠落を持つが、1A1株は染色体のhutオペロンからHutpを生成することができるので、この2種類の株を用いて、.誘導可能な発現がHutpによるものかどうかを検討した。形質導入はカナマイシンプレート上で選択し、β-ガラクトシダーゼの活性発現は細胞の対数増殖期の終了前に回収するこ:とにより、L-ヒスチジンの存在、非存在下での成長によって解析した。これには、L-ヒスチジン存在下での測定値を、L-ヒスチジン非存在下での測定値で割算して算出した誘導比を用いた。この結果、1A1株では、約55倍の誘導比が得られたが、NAG配列に塩基置換を施した変異体では発現が見られなかった。また、HUTPN1株でも発現が見られなかった。一方、HutPと2箇所のNAGモチーフをもつ55mer RNAとの複合体の良質の結晶が得られたので、X線解析を行った。その結果、Hutpは6量体の両面の2箇所において、RNAの5'側NAG配列および3'側NAG配列と特異的に結合していることが明らかになった。以上の研究から、anti-terminationを引き起こすhutターミネーターの不安定化にはHutPが必要であり、hutターミネーター内の2つのUAGモチーフがHutPへの結合に関わることにより、元のRNAのstem-loop構造が巻き戻され、不安定していることが明らかになった。

  • Research Products

    (1 results)

All 2008

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results)

  • [Journal Article] Insights into anti-termination re gulation of the hut operonin BaciUus subtilis:importance of the dual RNA-bindingsurfaces of HutP2008

    • Author(s)
      Gopinath, SCB., Balasundaresan, D., Kumarevel, T., Misono, TS. Mizuno H. and Kumar, PKR
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research (In press)

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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