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2007 Fiscal Year Annual Research Report

タンパク質分解における糖鎖修飾系とユビキチン修飾系のクロストークの構造的基盤

Research Project

Project/Area Number 18390016
Research InstitutionNagoya City University

Principal Investigator

加藤 晃一  Nagoya City University, 大学院・薬学研究科, 教授 (20211849)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山口 芳樹  名古屋市大学, 大学院・薬学研究科, 講師 (90323451)
栗本 英治  名古屋市大学, 大学院・薬学研究科, 助教 (90234575)
Keywordsタンパク質分解 / 糖鎖 / ユビキチン / NMR / 構造生物学
Research Abstract

前年度までに構築した糖鎖ライブラリーを利用して、(1)糖タンパク質特異的なユビキチンリガーゼ、(2)小胞体でミスフォールドした糖タンパク質を認識している分解レクチン、(3)プロテアソームの分解標的となる糖タンパクから糖鎖を切り出す酵素など、糖タンパク質の細胞内分解の関与する様々なタンパク質による糖鎖認識の特異性を明らかにすることに成功した。これにより、細胞内における糖タンパク質の品質管理システムにおいては、タンパク質上に発現した高マンノース型糖鎖のトリミング中間体の構造に依存して分解標的の認識が行われていることを実証することができた。
一方、NMRを利用して、PNGaseのPUBドメインの立体構造を決定するとともに、安定同位体を施したポリユビキチン鎖の作成技術を基盤として、PNGaseとポリユビキチンとの相互作用部位を明らかにした。さらに、この相互作用はユビキチン鎖の鎖長に依存していることも見出すことができた。
こうした方法論を応用して、小胞体関連分解に関与するユビキチンリガーゼであるgp78のユビキチン認識機構の研究を行い、gp78分子上のユビキチン結合部位を同定した。さらに、その結果に基づいて知見に基づいてgp78によるユビキチン鎖伸張メカニズムに関わるモデルを提唱した。
本研究により、細胞内の糖タンパク質分解における糖鎖修飾とユビキチン修飾のクロストークの構造的な基盤を明らかにすることができた。

  • Research Products

    (13 results)

All 2008 2007

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Molecular basis of sugar recognition by the human L-type lectins ERGIC-53, VIPL and VIP362008

    • Author(s)
      Y. Kamiya
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 1857-1861

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Neural complex-specific expression of xylosyl N-glycan in Ciona intestinalis2008

    • Author(s)
      H. Yagi
    • Journal Title

      Glycobiology 18

      Pages: 145-151

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deletion of 3 residues from the C-terminus of MCFD2 affects binding to ERGIC-53 and causes combined factor V and factor VIII deficiency2008

    • Author(s)
      B. Nyfeler
    • Journal Title

      Blood 111

      Pages: 1299-1301

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 920 MHz ultra-high field NMR approaches to structural glycobiology2008

    • Author(s)
      K. Kato
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta. -General Subjects 1780

      Pages: 619-625

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of a chaperone complex that contributes to the assembly of yeast 20S proteasomes2008

    • Author(s)
      H. Yashiroda
    • Journal Title

      Nature Struct. Mol. Biol. 15

      Pages: 228-236

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development and application of high performance liquid chromatography map of glucuronyl N-glycans2008

    • Author(s)
      H. Yagi
    • Journal Title

      Open Glycoscience (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Direct interactions between NEDD8 and ubiquitin E2 conjugating enzymes uprequlate cullin-based E3 ligase activity2007

    • Author(s)
      E. Sakata
    • Journal Title

      Nature Struct. Mol. Biol. 14

      Pages: 167-168

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fbsl protects the malfolded glycoproteins from the attack of peptide: N-glycanase2007

    • Author(s)
      Y. Yamaguchi
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 362

      Pages: 712-716

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ultra-high field NMR studies of antibody binding and site-specfic phosphorylation of α-synuclein2007

    • Author(s)
      H. Sasakawa
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 363

      Pages: 795-799

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 翻訳後に多様化するタンパク質への構造生物学的アプローチ2007

    • Author(s)
      加藤晃一
    • Organizer
      CBRC2007
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2007-12-20
  • [Presentation] NMR structural biology of protein quality control in cells2007

    • Author(s)
      Koichi Kato
    • Organizer
      第46回NMR討論会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2007-09-12
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Presentation] 糖タンパク質の細胞内運命を決定するシステムの構造的基盤2007

    • Author(s)
      加藤 晃一
    • Organizer
      第27回日本糖質学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2007-08-03
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [Book] Comprehensive Glycoscience2007

    • Author(s)
      N. Takahashi
    • Total Pages
      283-300
    • Publisher
      The two-/three-dimensional HPLC mapping method for the identification of N-glycan structures

URL: 

Published: 2010-02-04   Modified: 2016-04-21  

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