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2008 Fiscal Year Final Research Report

Identification of the cellulose-binding proteins from rumen contents

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 18688015
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Zootechnical science/Grassland science
Research InstitutionIbaraki University

Principal Investigator

TOYODA Atsushi  Ibaraki University, 農学部, 講師 (00292483)

Project Period (FY) 2006 – 2008
Keywordsルーメン / セルロース / セルラーゼ / セルロース結合性タンパク質 / プロテーム / モノクロナール抗体 / メタゲノム
Research Abstract

ルーメン内セルロース分解を効率化するためには、その分子メカニズムについて詳細に理解する必要がある。本研究ではルーメン内でセルロース分解に関与するタンパク質(CBPs)を網羅的に同定することを目的とした。ルーメン内CBPsとしてFibrobacter succinogenesのEndoglucanase F、TPR domain protein、OmpA family protein、Fibro-slim domain protein、Piromyces equiのCel6Aが同定された。ルーメン内セルロース付着菌のメタゲノム解析を行った。ルーメンからセルロースに付着する菌を採取し、ゲノムDNAを抽出後、次世代シーケンサーによる解析を行った。F. succinogenesなどの繊維分解菌由来のDNAと相同性の高いDNAが多数検出された。

  • Research Products

    (18 results)

All 2009 2008 2007 2006 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (11 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Effect of Bacillus subtilis var. natto fermented soybean on growth performance, microbial activity in the caeca and cytokine gene expression of domestic meat type chickens2009

    • Author(s)
      K. Fujiwara, M. Yamazaki, H. Abe, K. Nakashima, Y. Yakabe, M. Otsuka, Y. Ohbayashi, Y. Kato, K. Namai, A. Toyoda, Y. Miyaguchi, Y. Nakamura
    • Journal Title

      The Journal of Poultry Science 46(2)

      Pages: 116-122

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation and identification of cellulose-binding proteins from sheep rumen contents2009

    • Author(s)
      A. Toyoda, W. Iio, M. Mitsumori, H. Minato
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol. 75(6)

      Pages: 1667-73

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of fermented soybean, "Natto" on the production and qualities of chicken meat2008

    • Author(s)
      K. Fujiwara, Y. Miyaguchi, X. H. Feng, A. Toyoda, Y. Nakamura, M. Yamazaki, K. Nakashima, H. Abe
    • Journal Title

      Asia-Aust. J. Anim. Sci. 21(12)

      Pages: 1766-1772

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of fermented soybean "Natto" supplement on egg production and qualities2008

    • Author(s)
      K. Fujiwara, Y. Miyaguchi, A. Toyoda, Y. Nakamura, M. Yamazaki, K. Nakashima, and H. Abe
    • Journal Title

      Asia-Aust. J. Anim. Sci. 21(11)

      Pages: 1610-1615

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biochemical characterization of cellulose-binding proteins (CBPA and CBPB) from the rumen cellulolytic bacterium Eubacterium cellulosolvens 5.2007

    • Author(s)
      M. Yoshimatsu, A. Toyoda, N. Onizawa, Y. Nakamura, and H. Minato
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 71(10)

      Pages: 2577-2580

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Purification, characterization, and Gene analysis of cellulase (Cel8A) from Lysobacter sp. IB-93742006

    • Author(s)
      J. Ogura, A. Toyoda, T. Kurosawa, A. L. Chong, S. Chohnan, and T. Masaki
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 70(10)

      Pages: 2420-2428

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 反芻動物のルーメン内容物に含まれるセルロース結合タンパク質に対する抗体ライブラリーの作製2009

    • Author(s)
      豊田淳、飯尾恒、湊 一
    • Organizer
      日本畜産学会、第110回大会
    • Place of Presentation
      藤沢
    • Year and Date
      20090000
  • [Presentation] 反芻動物のルーメン内容物に含まれるセルロース結合タンパク質に対する抗体ライブラリーの作製2008

    • Author(s)
      豊田淳、飯尾恒、湊 一
    • Organizer
      第81回日本生化学会、第31回日本分子生物学会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20080000
  • [Presentation] 反芻動物のルーメン内容物に含まれるセルロース結合タンパク質の分離と同定2008

    • Author(s)
      豊田淳、飯尾恒、湊 一
    • Organizer
      日本畜産学会、第109回大会
    • Place of Presentation
      茨城
    • Year and Date
      20080000
  • [Presentation] 反芻動物のルーメン内容物に含まれるセルロース結合性タンパク質の分離と同定2007

    • Author(s)
      豊田淳、飯尾恒、湊 一
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会、第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20071200
  • [Presentation] ルーメン内セルロース分解菌Eubacterium cellulosolvens 5のセルラーゼCel9Dの遺伝子解析2007

    • Author(s)
      矢野由梨、吉松美帆、豊田淳
    • Organizer
      日本畜産学会、第108回大会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      20070000
  • [Presentation] Biochemical characterization of cellulose-binding proteins (CBPA and CBPB) from the rumen cellulolytic bacterium Eubacterium cellulosolvens 5.2007

    • Author(s)
      Miho Yoshimatsu, Atsushi Toyoda, Yutaka Nakamura, Hajime Minato
    • Organizer
      The 6th Joint Symposium of Japan-Korea-China on Rumen Metabolism and Physiology. Improvement of rumen function for efficient animal production
    • Place of Presentation
      Sekkoh, China
    • Year and Date
      20070000
  • [Presentation] ルーメン内繊維分解細菌Eubacterium cellulosolvens 5のセルロース結合性タンパク質CBPAおよびCBPBの性状比較2007

    • Author(s)
      吉松美帆、鬼澤直樹、豊田淳
    • Organizer
      日本畜産学会第107大会
    • Place of Presentation
      神奈川
    • Year and Date
      20070000
  • [Presentation] The cellulose-binding proteins in rumen cellulolytic bacterium Eubacterium cellulosolvens 52006

    • Author(s)
      Atsushi Toyoda and Hajime Minato
    • Organizer
      XIIth AAAP Animal Science Congress 2006
    • Place of Presentation
      Busan, Korea
    • Year and Date
      20060000
  • [Presentation] ルーメン内繊維分解細菌Eubacterium cellulosolvens 5セルロース結合性タンパク質CBPBの性状解析2006

    • Author(s)
      吉松美帆、鬼澤直樹、豊田淳
    • Organizer
      日本畜産学会第106大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20060000
  • [Presentation] Eubacterium cellulosolvens 5のセルロース結合性タンパク質Aのモジュール構造が酵素活性に及ぼす影響2006

    • Author(s)
      鬼澤直樹、吉松美帆、豊田淳
    • Organizer
      日本畜産学会第106大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20060000
  • [Presentation] Lysobacter sp. IB-9374由来endoglucanase(Cel8A)遺伝子のクローニング2006

    • Author(s)
      小倉治朗、鐘 愛玲、豊田 淳、長南 茂、正木武治
    • Organizer
      2006年度日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20060000
  • [Remarks]

    • URL

      http://doubutu.agr.ibaraki.ac.jp/siryou/index.html

URL: 

Published: 2010-06-10   Modified: 2016-04-21  

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