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2020 Fiscal Year Annual Research Report

アスパラギン酸経路・鍵酵素の複合体形成機構および活性調節機構の構造学的解析

Research Project

Project/Area Number 18H02138
Research InstitutionKagawa University

Principal Investigator

櫻庭 春彦  香川大学, 農学部, 教授 (90205823)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywords超好熱菌 / アスパラギン酸キナーゼ / ホモセリン脱水素酵素 / アスパラギン酸経路 / Thermotoga maritima / アスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素
Outline of Annual Research Achievements

必須アミノ酸であるスレオニン・メチオニンはアスパラギン酸経路により合成される。植物では、本経路の活性調節によって上記アミノ酸含量が決まるため、調節をうける鍵酵素の改変による作物の栄養価改善が期待される。しかし、この経路の第一段階のアスパラギン酸キナーゼ(AK)と第三段階のホモセリン脱水素酵素(HseDH)の活性調節機構は不明な点が多い。この二つの酵素は融合して二機能型酵素(AK-HseDH)として機能する例が多いが、なぜ第二段階の酵素であるアスパラギン酸セミアルデヒド脱水素酵素(AsaDH)が含まれないのか未だに謎となっている。また、AK-HseDHは不安定なため構造解析例が無い。本研究では、超好熱細菌Thermotoga maritimaに見出した安定性の高いこれら酵素の構造解析を通して、活性調節・複合体形成機構の解明を目指す。これにより、作物のアミノ酸栄養価を高める技術開発に繋がる研究基盤を構築する。
80℃付近の高温で生育する超好熱細菌T. maritimaに超好熱菌で初めて二機能型AK-HseDHを見出し、大腸菌における大量生産に成功している。また、このAK-HseDHがリジン非感受性であるがスレオニンにより阻害を受けることを明らかにした。一方、T. maritimaには単一機能型AKが存在し、スレオニン非感受性であるがリジンにより阻害を受けることが判明した。この点からAK-HseDHと単一機能型AKで役割分担がなされている可能性が示された。T. maritima 由来の二機能型AK-HseDHおよび単一機能型AKの構造解析を進め、スレオニンおよびリジンとの共結晶を作成し、阻害剤の結合様式の解析を行っていく。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

大腸菌で生産させたT. maritima の二機能型AK-HseDHの良質な結晶は、まだ得られていないが、その酵素化学的性質を明らかにしている。一方、T. maritimaには単一機能型AKが存在することを見出した。単一機能型AKは、スレオニン非感受性であるがリジンにより阻害を受ける。アスパラギン酸経路ではホモセリンから必須アミノ酸であるスレオニン、メチオニン、イソロイシンが生合成される。経路中のアスパラギン酸セミアルデヒドからはリジンが生合成される。これまでの研究において、T. maritima の二機能型AK-HseDHのAK活性はL-スレオニンにより強力に阻害を受けることが判明し、L-スレオニン生合成系に関与していると考えられる。一方、単一機能型AKはL-リジンに対する感受性が高いことから、L-リジン生合成系に関与している可能性が高い。今回、単一機能型AKの精製法を確立したので、その酵素化学的性質を明らかにするとともに結晶化条件のスクリーニングを行っている。

Strategy for Future Research Activity

大腸菌で生産させたT. maritima の二機能型AK-HseDHの精製方法を確立している。酵素化学的性質を解析し、スレオニンにより強力に阻害を受けることを明らかにした。本酵素の良好な結晶は得られていないため、引き続き結晶化条件のスクリーニングを行う。
単一機能型AKのスレオニン、リジンに対する感受性を調べたところ、スレオニン非感受性であるがリジンにより阻害を受けることが判明した。この酵素の精製法を確立したので、結晶化条件のスクリーニングを行う。また、酵素化学的性質の詳細を明らかにする。単一機能型AKと上記AK-HseDH(リジン非感受性であるがスレオニンにより阻害を受ける)の構造と比較することにより感受性・非感受性の違いを明らかにする。またリジンとの共結晶化を行い、これらが結合した構造を解析し、結合様式を明らかにする。
AK-HseDHまたはAK-HseDH/AsaDH複合体とスレオニンとの共結晶化を行い、これらが結合した構造を解析し、結合様式を明らかにする。すでに構造解析に成功しているP. horikoshii HseDHはスレオニン非感受性であるため、構造比較によりスレオニンによる阻害メカニズムを明らかにする。これに基づき、阻害を解除した変異体酵素の作成を試みる。また、単一機能型AKとリジンとの共結晶化を行い、これらが結合した構造を解析し、結合様式を明らかにする。

  • Research Products

    (5 results)

All 2020

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Structural and biochemical characterization of an extremely thermostable FMN-dependent NADH-indigo reductase from Bacillus smithii.2020

    • Author(s)
      Kazunari Yoneda, Misa Yoshioka, Haruhiko Sakuraba, Tomohiro Araki, Toshihisa Ohshima
    • Journal Title

      International journal of biological macromolecules

      Volume: 164 Pages: 3259 - 3267

    • DOI

      10.1016/j.ijbiomac.2020.08.197

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of dye-linked d-amino acid dehydrogenase from Sulfurisphaera tokodaii expressed using an archaeal recombinant protein expression system.2020

    • Author(s)
      Takenori Satomura, Shin Emoto, Norio Kurosawa, Toshihisa Ohshima, Haruhiko Sakuraba, Shin-Ichiro Suye
    • Journal Title

      Journal of bioscience and bioengineering

      Volume: 130 Pages: 247 - 252

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2020.04.008

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Bacillus smithii由来FMN-NADH依存性高度耐熱性インジゴ還元酵素の機能と構造解析2020

    • Author(s)
      米田 一成, 櫻庭 春彦, 荒木 朋洋, 大島 敏久
    • Organizer
      日本ビタミン学会第72回大会
  • [Presentation] 超好熱アーキア由来ヘテロ4量体型L-proline脱水素酵素とL-prolineの生合成2020

    • Author(s)
      櫻庭 春彦, 大志田 達也, 川上 竜巳, 米田 一成, 大島 敏久
    • Organizer
      第460回ビタミンB研究協議会
  • [Presentation] 好熱菌由来色素依存性L-グルタミン酸脱水素酵素の酵素化学的性質の解析2020

    • Author(s)
      伊藤佑衣, 里村武範, 岩田峻弥, 櫻庭春彦, 大島敏久, 末信一朗
    • Organizer
      極限環境生物学会2020年度 (第21回) 年会

URL: 

Published: 2021-12-27  

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