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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Improvement of the AID technology through chemical biology approaches

Research Project

Project/Area Number 18H02170
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

鐘巻 将人  国立遺伝学研究所, 遺伝メカニズム研究系, 教授 (20444507)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 林 謙一郎  岡山理科大学, 理学部, 教授 (30289136)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords発現制御 / タンパク質分解 / デグロン / 阻害剤
Outline of Annual Research Achievements

オーキシンデグロン技術は、植物由来のユビキチンリガーゼサブユニットTIR1を異種細胞に導入することにより、植物AUX/IAA由来デグロンを付加したタンパク質をオーキシン添加により分解除去することを可能にした。現在のオーキシンデグロン法における問題は、デグロン付加したタンパク質がオーキシン非添加時においても弱い分解を受けることであった。

この問題を克服するため、TIR1に結合する阻害剤を複数合成した。これらは、オーキシンと同様のインドール環を持つため、TIR1に結合するが、デグロンが結合する部分に付加残基を持つため阻害剤として機能する。複数の阻害剤候補を選択したところ、植物でもっとも阻害効果が高いことが知られている、auxinoleが培養細胞でももっとも阻害効果が高いことが明らかになった。培地にauxinoleを添加することにより、TIR1によるオーキシン非添加時の分解を抑制することが可能になった。さらに、分解誘導後オーキシンを除去して発現回復を行う際に、auxinoleを添加すると発現回復が早まることも見出した。これは、オーキシン除去後もTIR1がしばらく継続して分解を続けているが、この継続的分解を阻害することによると考えられる。

auxinoleの利用法とデグロンタグの新たな付加方法などの一連の改良をまとめて、論文投稿をおこなった。投稿論文はすでにbioRxivより公開されており、原稿はMethods誌にアクセプトされた。現在、論文はin pressになっている。auxinoleを広く研究者間で使ってもらうために、その販路を開拓しBioAcademia社との販売合意に至った。作成した一連のプラスミドは全てRIKEN BRCとaddgeneより配布を開始した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

一年目に当初の研究提案の一部を論文として公表するところまで研究を進めることができた。また、作成した化合物やプラスミドを配布共有するシステムを整えることに成功した。

Strategy for Future Research Activity

今後は、オーキシンデグロン技術の分解における機能性を高めるための研究を進める。そのために、新たに合成したオーキシンアナログを利用する。さらにマウスへの応用研究も進める。すでに予備的実験を始めており、この先2年間の間にマウスにおけるオーキシンデグロン技術の確立で一定の成果をあげることを目標としている。

  • Research Products

    (22 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (13 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 10 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Book (3 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Aberdeen(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Aberdeen
  • [Int'l Joint Research] Baylor College of Medicine(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Baylor College of Medicine
  • [Journal Article] Generation of conditional auxin-inducible degron (AID) cells and tight control of degron-fused proteins using the degradation inhibitor auxinole2019

    • Author(s)
      Yesbolatova Aisha、Natsume Toyoaki、Hayashi Ken-ichiro、Kanemaki Masato T.
    • Journal Title

      Methods

      Volume: 164-165 Pages: 73~80

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2019.04.010

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Ligand-induced genetic degradation as a tool for target validation2019

    • Author(s)
      Yesbolatova Aisha、Tominari Yusuke、Kanemaki Masato T.
    • Journal Title

      Drug Discovery Today: Technologies

      Volume: 31 Pages: 91~98

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.ddtec.2018.11.001

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Temporal and Spatial Epigenome Editing Allows Precise Gene Regulation in Mammalian Cells2019

    • Author(s)
      Kuscu Cem、Mammadov Rashad、Czikora Agnes、Unlu Hayrunnisa、Tufan Turan、Fischer Natasha Lopes、Arslan Sevki、Bekiranov Stefan、Kanemaki Masato、Adli Mazhar
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: 431 Pages: 111~121

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2018.08.001

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Chk1-mediated Cdc25A degradation as a critical mechanism for normal cell cycle progression2019

    • Author(s)
      Goto Hidemasa、Natsume Toyoaki、Kanemaki Masato T.、Kaito Aika、Wang Shujie、Gabazza Esteban C.、Inagaki Masaki、Mizoguchi Akira
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 132 Pages: jcs223123

    • DOI

      10.1242/jcs.223123

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Temporal Regulation of ESCO2 Degradation by the MCM Complex, the CUL4-DDB1-VPRBP Complex, and the Anaphase-Promoting Complex2018

    • Author(s)
      Minamino Masashi、Tei Shoin、Negishi Lumi、Kanemaki Masato T.、Yoshimura Atsunori、Sutani Takashi、Bando Masashige、Shirahige Katsuhiko
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 28 Pages: 2665~2672.e5

    • DOI

      10.1016/j.cub.2018.06.037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] TAGing for destruction2018

    • Author(s)
      Yesbolatova Aisha、Kanemaki Masato T.
    • Journal Title

      Nature Chemical Biology

      Volume: 14 Pages: 414~415

    • DOI

      10.1038/s41589-018-0024-5

    • Open Access
  • [Journal Article] Seh1 targets GATOR2 and Nup153 to mitotic chromosomes2018

    • Author(s)
      Platani Melpomeni、Samejima Itaru、Samejima Kumiko、Kanemaki Masato T.、Earnshaw William C.
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 131 Pages: jcs213140

    • DOI

      10.1242/jcs.213140

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Replication stress induces accumulation of FANCD2 at central region of large fragile genes2018

    • Author(s)
      Okamoto Yusuke、Iwasaki Watal M、Kugou Kazuto、Takahashi Kazuki K、Oda Arisa、Sato Koichi、Kobayashi Wataru、Kawai Hidehiko、Sakasai Ryo、Takaori-Kondo Akifumi、Yamamoto Takashi、Kanemaki Masato T、Taoka Masato、Isobe Toshiaki、Kurumizaka Hitoshi、Innan Hideki、Ohta Kunihiro、Ishiai Masamichi、Takata Minoru
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 46 Pages: 2932~2944

    • DOI

      10.1093/nar/gky058

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Ki-67 and condensins support the integrity of mitotic chromosomes through distinct mechanisms2018

    • Author(s)
      Takagi Masatoshi、Ono Takao、Natsume Toyoaki、Sakamoto Chiyomi、Nakao Mitsuyoshi、Saitoh Noriko、Kanemaki Masato T.、Hirano Tatsuya、Imamoto Naoko
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 131 Pages: jcs212092

    • DOI

      10.1242/jcs.212092

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Functional analysis after rapid degradation of condensins and 3D-EM reveals chromatin volume is uncoupled from chromosome architecture in mitosis2018

    • Author(s)
      Samejima Kumiko、Booth Daniel G.、Ogawa Hiromi、Paulson James R.、Xie Linfeng、Watson Cara A.、Platani Melpomeni、Kanemaki Masato T.、Earnshaw William C.
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 131 Pages: jcs210187

    • DOI

      10.1242/jcs.210187

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Publisher Correction: Exosomes maintain cellular homeostasis by excreting harmful DNA from cells2018

    • Author(s)
      Takahashi Akiko、Okada Ryo、Nagao Koji、Kawamata Yuka、Hanyu Aki、Yoshimoto Shin、Takasugi Masaki、Watanabe Sugiko、Kanemaki Masato T.、Obuse Chikashi、Hara Eiji
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 9 Pages: 06613-3

    • DOI

      10.1038/s41467-018-06613-3

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Endosomal Rab cycles regulate Parkin-mediated mitophagy2018

    • Author(s)
      Yamano Koji、Wang Chunxin、Sarraf Shireen A、Munch Christian、Kikuchi Reika、Noda Nobuo N、Hizukuri Yohei、Kanemaki Masato T、Harper Wade、Tanaka Keiji、Matsuda Noriyuki、Youle Richard J
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 7 Pages: eLife.31326

    • DOI

      10.7554/eLife.31326

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Dynein?Dynactin?NuMA clusters generate cortical spindle-pulling forces as a multi-arm ensemble2018

    • Author(s)
      Okumura Masako、Natsume Toyoaki、Kanemaki Masato T、Kiyomitsu Tomomi
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 7 Pages: eLife.36559

    • DOI

      10.7554/eLife.36559

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Rapid protein depletion in human cells by the auxin-inducible degron technology2018

    • Author(s)
      Masato Kanemaki
    • Organizer
      NIG International Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] A non-canonical DNA replication important for genome maintenance2018

    • Author(s)
      Masato Kanemaki
    • Organizer
      Okazaki Fragment Memorial Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 生物の科学遺伝 ヒト疾患とモデル生物:ヒト培養細胞を用いた解析2018

    • Author(s)
      鐘巻将人
    • Total Pages
      5
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      9784860435530
  • [Book] 実験医学 2018年 6月号:抗体による内在性タンパク質分解除去2018

    • Author(s)
      鐘巻将人
    • Total Pages
      2
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      9784758125086
  • [Book] 実験医学 2018年 12月号:複製フォークの異常が自己炎症性疾患を引き起こす2018

    • Author(s)
      鐘巻将人
    • Total Pages
      2
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      9784758125147
  • [Remarks] 遺伝子が転写される際のDNAの「動き」を生きた細胞の中で捉えた!

    • URL

      https://www.nig.ac.jp/nig/ja/2019/03/research-highlights_ja/20190305.html

  • [Remarks] 世界初!光で細胞分裂装置の操作に成功 ~体作りに重要な細胞分裂の仕組みの理解促進に期待~

    • URL

      https://www.nig.ac.jp/nig/ja/2018/07/research-highlights_ja/20180709.html

URL: 

Published: 2019-12-27  

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