Population history of Japan

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 18H02514
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 45050:Physical anthropology-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: Ohashi Jun 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (80301141)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: 縄文人 / 渡来人 / 日本列島人 / 遺伝的多様性

Outline of Final Research Achievements

A phylogenetic analysis for the entire Y chromosome of 345 Japanese males identified a clade that is observed at a frequency of 35.4% in mainland Japanese males, but not in other East Asians. The genealogical analysis indicated a sharp decline in population size of Japanese males from the late Jomon to the Yayoi period.
The analysis of genome-wide SNP allele frequency data of 47 Japanese prefectures revealed that genetic differences among prefectures can be explained by the extent of genomic components derived from the Jomon people and their geographic location. Of particular interest, it was found the modern Japanese people living in the Kinki and Shikoku regions were genetically closer to Han Chinese than people in the other regions were.

Free Research Field

ヒト進化遺伝学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

Y染色体の解析結果は、遺跡数や規模をもとに、縄文時代後期・晩期に縄文人の人口が減少したと推定した先行研究と符合するものであった。縄文時代晩期は世界的に寒冷化した時期であり、気温が下がったことで食料供給量が減ったことが、急激な人口減少の主な要因と思われる。47都道府県の遺伝的多様性解析の結果は、弥生時代以降に大陸から日本列島に移住してきた渡来人の中に、近畿地方と四国地方に進出・増加した人々が相対的に多かったことを示唆している。
本研究の成果は、縄文時代から弥生時代への移行期における日本列島人の進化史の理解に役立つと期待される。