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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Study for elucidation of the structures and functions of nano-sized membrane domains using glycolipid probes

Research Project

Project/Area Number 18H03942
Research InstitutionGifu University

Principal Investigator

安藤 弘宗  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 教授 (20372518)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 健一  岐阜大学, 糖鎖生命コア研究所, 教授 (50423059)
矢木 宏和  名古屋市立大学, 医薬学総合研究院(薬学), 講師 (70565423)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywords細胞膜ドメイン / スフィンゴ糖脂質 / ガングリオシド / 脂質ラフト
Outline of Annual Research Achievements

1.ガングリオシドとの相互作用に基づいた脂質ラフト親和性蛋白質の同定
本研究によって開発した光親和性GM3プローブを用いて、GM3が標的とする細胞膜タンパク質の同定を検討した。糖鎖の非還元末端糖残基のシアル酸側鎖部分の末端に光親和性基を結合させた糖鎖修飾型と脂質であるセラミドの末端に結合させた脂質修飾型の二種を用いた。その結果、両種と結合する数十種のタンパク質が同定され、光反応性基の修飾部位の違いにより、同定されるタンパク質が異なることが明らかとなった。さらに、プロテオミクス解析での網羅性を向上させるための新たな光反応性基を導入した新たな分子捕捉用ガングリオシドプローブを合成した。新たなプローブは、タンパク質結合の特異性、水中安定性、光安定性に優れていることが機能評価実験により明らかになった。
2.ガングリオシドによるホモリティックな糖脂質ドメイン形成の普遍性および形成因の解明
期間全体で合成を計画している10種の蛍光プローブの内、4種の合成を完了し、計画したすべてのプローブを合成した。脂質部分の構造を改変したGM3蛍光プローブ、シアル酸部の構造を改変したGM3プローブを用いた1分子イメージングによる動態解析により、ホモ二量化の形成寿命が糖残基の水酸基、アセトアミド基、カルボキシル基、脂質部分の脂肪酸の炭素数により影響されることが明らかになった。これらの結果よりホモ二量化は、水素結合ならび疎水性相互作用の複合的な結合力により生じる現象であることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当該年度に計画した研究項目がほぼ達成された段階にあるため。また、申請段階で計画していなかったプロテオミクスを効率化する新たな光反応性官能基の開発に取り組み、本年度で完成することができた。iPS細胞の脂質ドメインの解析が予定よりも遅れている状況にあるが、上述のプローブ開発を考慮して、進捗としておおむね順調と評価した。

Strategy for Future Research Activity

最終年度である令和3年度では、当初の計画通りに研究を実施する。なお、iPS細胞における脂質ラフトの構造解析については、共同研究者と研究の進め方について再検討し、実行可能な範囲での実験を実施する。また、一部計画を変更した光親和性プローブの開発と相互作用タンパク質の同定においては、昨年度実施した従来型の光親和性プローブによるタンパク質同定と同条件で実施し、新規プローブの有用性検証を目的とした比較検討を行う。

  • Research Products

    (21 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] リール大学/CNRS(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      リール大学/CNRS
  • [Int'l Joint Research] アルバータ大学(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      アルバータ大学
  • [Int'l Joint Research] オクスフォード大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      オクスフォード大学
  • [Journal Article] On-Membrane Dynamic Interplay between Anti-GM1 IgG Antibodies and Complement Component C1q2020

    • Author(s)
      Yanaka Saeko、Yogo Rina、Watanabe Hiroki、Taniguchi Yuki、Satoh Tadashi、Komura Naoko、Ando Hiromune、Yagi Hirokazu、Yuki Nobuhiro、Uchihashi Takayuki、Kato Koichi
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 21 Pages: 147~147

    • DOI

      10.3390/ijms21010147

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Systematic strategy utilizing 1,5-lactamization for the synthesis of the trisialylated galactose unit of c-series gangliosides2020

    • Author(s)
      Shirasaki Junya、Tanaka Hide-Nori、Konishi Miku、Hirose Yuya、Imamura Akihiro、Ishida Hideharu、Kiso Makoto、Ando Hiromune
    • Journal Title

      Tetrahedron Letters

      Volume: 61 Pages: 151759~151759

    • DOI

      10.1016/j.tetlet.2020.151759

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient diversification of GM3 gangliosides via late-stage sialylation and dynamic glycan structural studies with 19F solid-state NMR2020

    • Author(s)
      Takahashi Maina、Shirasaki Junya、Komura Naoko、Sasaki Katsuaki、Tanaka Hide-Nori、Imamura Akihiro、Ishida Hideharu、Hanashima Shinya、Murata Michio、Ando Hiromune
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 18 Pages: 2902~2913

    • DOI

      10.1039/d0ob00437e

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Homeostatic and pathogenic roles of GM 3 ganglioside molecular species in TLR 4 signaling in obesity2020

    • Author(s)
      Kanoh Hirotaka、(この間17名)Komura Naoko、Ando Hiromune、Ishida Hideharu、Kiso Makoto、Natori Yoshihiro、Yoshimura Yuichi、Zonca Asia、Cattaneo Anna、Letizia Marilena、Ciampa Maria、Mauri Laura、Prinetti Alessandro、Sonnino Sandro、Suzuki Akemi、Inokuchi Jin‐ichi
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 39 Pages: e101732

    • DOI

      10.15252/embj.2019101732

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Control of Lipid Bilayer Phases of Cell-Sized Liposomes by Surface-Engineered Plasmonic Nanoparticles2020

    • Author(s)
      Nobeyama Tomohiro、Shigyou Kazuki、Nakatsuji Hirotaka、Sugiyama Hiroshi、Komura Naoko、Ando Hiromune、Hamada Tsutomu、Murakami Tatsuya
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 36 Pages: 7741~7746

    • DOI

      10.1021/acs.langmuir.0c00049

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Indirect synthetic route to α-l-fucosides via highly stereoselective construction of α-l-galactosides followed by C6-deoxygenation2020

    • Author(s)
      Tomida Hirotaka、Matsuhashi Takuya、Tanaka Hide-Nori、Komura Naoko、Ando Hiromune、Imamura Akihiro、Ishida Hideharu
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 18 Pages: 5017~5033

    • DOI

      10.1039/d0ob01128b

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of Fluorescent Ganglioside GD3 and GQ1b Analogs for Elucidation of Raft-Associated Interactions2020

    • Author(s)
      Konishi Miku、Komura Naoko、Hirose Yuya、Suganuma Yuki、Tanaka Hide-Nori、Imamura Akihiro、Ishida Hideharu、Suzuki Kenichi G. N.、Ando Hiromune
    • Journal Title

      The Journal of Organic Chemistry

      Volume: 85 Pages: 15998~16013

    • DOI

      10.1021/acs.joc.0c01493

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stereoselective Synthesis of Diglycosyl Diacylglycerols with Glycosyl Donors Bearing a β-Stereodirecting 2,3-Naphthalenedimethyl Protecting Group2020

    • Author(s)
      Yagami Nahoko、Vibhute Amol M.、Tanaka Hide-Nori、Komura Naoko、Imamura Akihiro、Ishida Hideharu、Ando Hiromune
    • Journal Title

      The Journal of Organic Chemistry

      Volume: 85 Pages: 16166~16181

    • DOI

      10.1021/acs.joc.0c02121

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Defining raft domains in the plasma membrane2020

    • Author(s)
      Kusumi Akihiro、Fujiwara Takahiro K.、Tsunoyama Taka A.、Kasai Rinshi S.、Liu An‐An、Hirosawa Koichiro M.、Kinoshita Masanao、Matsumori Nobuaki、Komura Naoko、Ando Hiromune、Suzuki Kenichi G. N.
    • Journal Title

      Traffic

      Volume: 21 Pages: 106~137

    • DOI

      10.1111/tra.12718

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Stereoselective synthesis of sialo-glycans for accelerating glycobiology2021

    • Author(s)
      Hiromune Ando
    • Organizer
      ACS Carbohydrate Division Young Investigator Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 新規光反応性基「セレノフェン-2-イル置換型α-ケトアミド」を用いた光親和性スフィンゴ糖脂質プ ローブの開発と細胞膜ラフト親和性相互作用の理解に向けた応用2021

    • Author(s)
      浅野 早知、田中 秀則、今村 彰宏、石田 秀治、矢木 宏和、加藤 晃一、水上 大 輝 、平井 剛 、安藤 弘宗
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
  • [Presentation] 脂質ラフトの1分子イメージングに向けたラクト系ガングリオシドプローブの合成2021

    • Author(s)
      高橋 舞菜、白崎 淳哉、河村 奈緒子、田中 秀則、今村 彰宏、石田 秀治、安藤 弘 宗
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
  • [Presentation] 二環性シアル酸を用いたα(2,9)ポリシアル酸の合成研究2021

    • Author(s)
      加藤 雅大、白崎 淳哉、河村 奈緒子、田中 秀則、今村 彰宏、石田 秀治、安藤 弘宗
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
  • [Presentation] A fully stereoselective method for a-sialylation2020

    • Author(s)
      Hiromune Ando
    • Organizer
      Two day International E-Seminar Chemistry, Biology and COVID-19
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Chemical synthesis of sialic acid-containing glycans2020

    • Author(s)
      Hiromune Ando
    • Organizer
      Indian Carbohydrates E-Meetings (ICarE)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 合成化学で糖鎖の未知を拓く2020

    • Author(s)
      安藤弘宗
    • Organizer
      第5回ケムステVシンポジウム 「最先端ケムバイオ」
    • Invited
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      https://www1.gifu-u.ac.jp/~kassei1/index.html

  • [Remarks] 所属研究機関ホームページ

    • URL

      https://www1.gifu-u.ac.jp/~igcore/

URL: 

Published: 2021-12-27  

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