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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Groval aanalys of the nerve growth using proteomics and superresolution

Research Project

Project/Area Number 18H04013
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

五十嵐 道弘  新潟大学, 医歯学系, 教授 (50193173)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中津 史  新潟大学, 医歯学系, 准教授 (50360607)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords成長円錐 / リン酸化 / 超解像度顕微鏡 / プロテオミクス
Outline of Annual Research Achievements

1.成長円錐のリン酸化プロテオミクス結果をバイオインフォマティクスの系統解析を行ってリン酸化の結果は哺乳動物から脊椎動物では全体的に保存されていたが、無脊椎動物のショウジョウバエや線虫では保存性が低いことがわかった。特にMAPKでリン酸化を受けやすい高頻度部位は、20度数以上の高頻度になるほど、その傾向が強いことがわかった。
2.成長円錐のフィロポディアを超解像度顕微鏡で解析したところ、小胞などが多いC-domain (central domain)にもZ軸方向のフィロポディアが存在していた。このフィロポディアは非常に速いターンオーバーを繰り返すことが示された。
3.成長円錐のリン酸化プロテオミクスから、最も頻度の高いものが神経特異蛋白質GAP-43のS96リン酸化であることがわかった。このリン酸化はバイオインフォマティクスと阻害実験から、MAPK系の1つであるJNKであることが証明された。JNKはこれまで細胞死の誘発因子としてのみ知られていたが、近年神経系の発生において活性化していることが報告されており、われわれの結果もそれを裏付けるものである。S96リン酸化に対する抗体を樹立して免疫染色を行ったところ、すべての伸長中の軸索が染色された。これはS96リン酸化と軸索の成長が密接な関係性を有することを意味し、伸長軸索の分子マーカーと考えられた。一方、軸索再生実験を坐骨神経で行ったところ、再生神経でもS96リン酸化が確認され、軸索再生とも深い関係にあることが証明された。
2018年度繰越で受託抗体作成は予定通りに終了した。これをウェスタンブロッティングと培養細胞での免疫染色で神経細胞での発現を確認し、4件のリン酸化抗体が高い特異性と成長円錐への発現を確認できるものであった。これらは今後の実験に使用できる可能性が高いことが分かった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

2018年度の繰越で検討した内容は、2019年度の予定内容と共に並行して対応できたため、おおむね順調と考えている。

Strategy for Future Research Activity

2018年度の繰越で対応した内容は、予定通り進み、2019年度の研究へとつつがなく、進展した。

  • Research Products

    (20 results)

All 2020 2019 2018

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 4 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 8 results)

  • [Journal Article] Phosphoproteomic and bioinformatic methods for analyzing signaling in vertebrate axon growth and regeneration2020

    • Author(s)
      Igarashi Michihiro、Kawasaki Asami、Ishikawa Yuya、Honda Atsuko、Okada Masayasu、Okuda Shujiro
    • Journal Title

      Journal of Neuroscience Methods

      Volume: 339 Pages: 108723~108723

    • DOI

      10.1016/j.jneumeth.2020.108723

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microtubule elongation along actin filaments induced by microtubule-associated protein 4 contributes to the formation of cellular protrusions2020

    • Author(s)
      Doki Chihiro、Nishida Kohei、Saito Shoma、Shiga Miyuki、Ogara Hikari、Kuramoto Ayumu、Kuragano Masahiro、Nozumi Motohiro、Igarashi Michihiro、Nakagawa Hiroyuki、Kotani Susumu、Tokuraku Kiyotaka
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 168 Pages: 295~303

    • DOI

      10.1093/jb/mvaa046

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phosphorylation sites of microtubule-associated protein 1B (MAP?1B) are involved in axon growth and regeneration2019

    • Author(s)
      Ishikawa Yuya、Okada Masayasu、Honda Atsuko、Ito Yasuyuki、Tamada Atsushi、Endo Naoto、Igarashi Michihiro
    • Journal Title

      Molecular Brain

      Volume: 12 Pages: 93

    • DOI

      10.1186/s13041-019-0510-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] New observations in neuroscience using superresolution microscopy2018

    • Author(s)
      Igarashi Michihiro、Nozumi Motohiro、Wu Ling-Gang、Cella Zanacchi Francesca、Katona Istv?n、Barna L?szl?、Xu Pingyong、Zhang Mingshu、Xue Fudong、Boyden Edward
    • Journal Title

      The Journal of Neuroscience

      Volume: 38 Pages: 9459~9467

    • DOI

      10.1523/JNEUROSCI.1678-18.2018

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Craniofacial abnormality with skeletal dysplasia in mice lacking chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase-12018

    • Author(s)
      Ida-Yonemochi Hiroko、Morita Wataru、Sugiura Nobuo、Kawakami Ryosuke、Morioka Yuki、Takeuchi Yuka、Sato Toshiya、Shibata Shunichi、Watanabe Hideto、Imamura Takeshi、Igarashi Michihiro、Ohshima Hayato、Takeuchi Kosei
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: 17134

    • DOI

      10.1038/s41598-018-35412-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Growth Cone Phosphoproteomics Reveals that GAP-43 Phosphorylated by JNK Is a Marker of Axon Growth and Regeneration2018

    • Author(s)
      Kawasaki Asami、Okada Masayasu、Tamada Atsushi、Okuda Shujiro、Nozumi Motohiro、Ito Yasuyuki、Kobayashi Daiki、Yamasaki Tokiwa、Yokoyama Ryo、Shibata Takeshi、Nishina Hiroshi、Yoshida Yutaka、Fujii Yukihiko、Takeuchi Kosei、Igarashi Michihiro
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 4 Pages: 190~203

    • DOI

      10.1016/j.isci.2018.05.019

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Vesicular movements in the growth cone2018

    • Author(s)
      Nozumi Motohiro、Igarashi Michihiro
    • Journal Title

      Neurochemistry International

      Volume: 119 Pages: 71~76

    • DOI

      10.1016/j.neuint.2017.09.011

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Roles of CSGalNAcT1, a key enzyme in regulation of CS synthesis, in neuronal regeneration and plasticity2018

    • Author(s)
      Igarashi Michihiro、Takeuchi Kosei、Sugiyama Sayaka
    • Journal Title

      Neurochemistry International

      Volume: 119 Pages: 77~83

    • DOI

      10.1016/j.neuint.2017.10.001

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] コンドロイチン硫酸(CS)合成酵素のノックアウトマウス解析2019

    • Author(s)
      五十嵐 道弘
    • Organizer
      先端動物支援プラットフォーム成果報告会
    • Invited
  • [Presentation] 3D analysis of the intracellular structures in growth cones using superresolution microscopy2019

    • Author(s)
      M. Igarashi
    • Organizer
      EMBO Molecular Neuroscience
    • Invited
  • [Presentation] 哺乳動物成長円錐の分子基盤をどう理解するか?2018

    • Author(s)
      五十嵐 道弘
    • Organizer
      生理学研究所シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] New observations in neuroscience using superresolution microscopy.2018

    • Author(s)
      M. Igarashi
    • Organizer
      Soceity for Neuroscience
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] New relationships between F-actin organization and memberance in the growth cone revealed by SIM2018

    • Author(s)
      M. Nozumi, M. Igarashi
    • Organizer
      Soceity for Neuroscience
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 構造化照明による超解像顕微鏡(SIM)で明らかになった神経突起先端の3次元構造2018

    • Author(s)
      野住 素広、五十嵐 道弘
    • Organizer
      日本分子生物学会大会
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 神経細胞の形態形成シグナリングにおけるGPM6aのパルミトイル化と脂質ラフト集積の意義2018

    • Author(s)
      五十嵐 道弘
    • Organizer
      日本神経化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Abnormalities in perineuronal nets (PNN) and behaviors in mice without CSGalNAcT12018

    • Author(s)
      M. Igarashi
    • Organizer
      Glycobiology 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Phosphoproteomics of the mammalian growth cone reveals that phosphorylation of GAP-43 by JNK is specific to the2018

    • Author(s)
      M. Igarashi
    • Organizer
      American Society for Cell Biology
    • Invited
  • [Presentation] Phosphorylation profiles of neuronal growth cones revealed by phosphoproteomics2018

    • Author(s)
      M. Igarashi
    • Organizer
      Gordon Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Growth cone phosphoproteomics reveals that JNK-dependent phosphorylation of GAP-43 is specific to the growing axon2018

    • Author(s)
      A. Kawasaki, M. Igarash
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asaia Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] JNK-dependent phosphorylation sites of GAP-43 is a marker of axon growth/regeneration, revealed by growth cone phosphoproreomics2018

    • Author(s)
      A. Kawasaki, M.. Igarashi
    • Organizer
      Society for Neuroscience
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-01-27  

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