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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Development of solution to nutrition problem with intestinal bacteria

Research Project

Project/Area Number 18J21116
Research InstitutionThe University of Tokyo
Research Fellow 増岡 弘晃  東京大学, 農学生命科学研究科, 特別研究員(DC1)
Project Period (FY) 2018-04-25 – 2021-03-31
Keywords腸内細菌 / 低タンパク質適応 / 肥満 / パプアニューギニア / ラオス / 近代化
Outline of Annual Research Achievements

1.「低タンパク質適応」と腸内細菌叢の関係についての研究
2020年度は、SPFマウスがタンパク質欠乏の状態にある場合に腸内細菌叢がどのような応答を示すのかを調べた研究が学術誌のScientific Reportsに受理され、掲載された。残念ながら新型コロナウイルス感染症対策の影響で十分な動物実験を行うことが困難であったが、パプアニューギニア高地人と日本人由来の異なる腸内菌叢に低タンパク食が与える影響から、タンパク質栄養にかかわる腸内菌群とその代謝的な特徴について考察した。

2. 「肥満」と腸内細菌叢の関係についての研究
2020年度はこれらのサンプルの中から各村落で30サンプルを選出し、NGSによりシーケンスを行い、計90のメタゲノムリードを取得した。各リードからヒト由来の配列を除去し、アセンブルし、コンティグを構築した。各コンティグから遺伝子予測を行い、遺伝子カタログを作成した。その後、ラオスサンプルから作成した遺伝子カタログとpublicの遺伝子カタログであるIntegrated Gene Catalog (IGC)と結合し、遺伝子やタンパク質、代謝、シグナル伝達などの分子間ネットワークに関する情報を統合したデータベースであるKyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)へのanotationを行い、各サンプル中でどのような機能が促進、あるいは抑制されているかどうかを解析した。機能解析の結果、山岳部の農村Cでは酸化ストレスへの応答を示す機能発現が有意に低く、酸化ストレスが低いことが示唆された。今後、酸化ストレスを増悪あるいは抑制させる腸内細菌がいるかどうかをより詳細な解析を行うことで調べることを予定している。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

(2 results)

All 2021 2020

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] The influences of low protein diet on the intestinal microbiota of mice2020

    • Author(s)
      Masuoka Hiroaki、Suda Wataru、Tomitsuka Eriko、Shindo Chie、Takayasu Lena、Horwood Paul、Greenhill Andrew R.、Hattori Masahira、Umezaki Masahiro、Hirayama Kazuhiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1038/s41598-020-74122-9

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] パプアニューギニア高地人の低タンパク質適応:腸内細菌の未知機能の探索2021

    • Author(s)
      増岡弘晃
    • Organizer
      2020年度国立遺伝学研究所研究会「ゲノム医科学とバイオインフォマティクスの接点と集学研究」
    • Invited

URL: 

Published: 2021-12-27  

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