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2019 Fiscal Year Research-status Report

エポキシシクロヘキセンジオン類によるADP/ATP輸送体の凝集メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 18K05458
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

村井 正俊  京都大学, 農学研究科, 准教授 (80543925)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 武範  徳島大学, 先端酵素学研究所(プロテオ), 講師 (80457324)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywordsミトコンドリア / ADP/ATP輸送体 / 阻害剤 / ケミカルバイオロジー
Outline of Annual Research Achievements

ミトコンドリアADP/ATP輸送体(AAC)は、ミトコンドリア内膜上でADPとATPの交換反応を行う分子質量約30 kDaの膜輸送体であり、マトリックス側で生産されたATPを細胞質へ供給する役割を担っている。ウシ心筋ミトコンドリアAACの新規阻害剤を探索する過程で、epoxycyclohexenedione類(ECH類)がAACによる[14C]ADPの取り込みを阻害することを見出した。また、代表者は高濃度のECH類でSMPを処理した場合、AACの顕著な凝集が誘導されるというユニークな現象を見出した。昨年度までに、ECH類はAAC表面上の3箇所のシステイン(Cys57, Cys160, Cys257)のうち、Cys57を強く修飾することを明らかにした。

本年度は、タンパク質修飾剤である4-hydroxynonenal (4HNE)の作用機構について検討した。リノール酸の過酸化分解物4-HNEはその代表例であり、システインなどの求核性アミノ酸残基とマイケル型付加することでタンパク質を化学修飾
する。ウシ心筋AACを4-HNEをインキュベートしたところ、4-HNE は 主に Cys160 を修飾していることが強く示唆された。その一方で、4-HNEによる化学修飾は、ECH類とは対照的にAACの凝集(後述)を誘導しなかった。ECH類と同じくシステイン修飾剤でありながら、凝集誘導をしなかった4HNEについては、ECH類の作用機構を考察する上での重要な知見である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

代表者は、高濃度のECH類でSMPを処理した場合、AACの顕著な凝集が誘導されるというユニークな現象を見出している。ところが、ECH類と同じく、タンパク質のシステイン残基と反応する4HNEではこうした凝集は誘導されなかった。

両者の差を明らかにすることが、ユニークなAAC阻害剤であるECH類の作用機構を明らかにする鍵であると考えている。

Strategy for Future Research Activity

「現在までの進捗状況」で記載した通り、ユニークなAAC阻害剤であるECH類の作用機構(凝集誘導の仕組み)を明らかにすることが必須であると考えている。

Causes of Carryover

ECH類のプローブ分子の合成が進まず、試薬購入費用として計上していた予算に余剰が生じた。次年度は有機合成を重点的に進める予定である。

  • Research Products

    (22 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (13 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Rensselaer Polytechnic Institute(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Rensselaer Polytechnic Institute
  • [Int'l Joint Research] University of Helsinki(フィンランド)

    • Country Name
      FINLAND
    • Counterpart Institution
      University of Helsinki
  • [Journal Article] Oversized ubiquinones as molecular probes for structural dynamics of the ubiquinone reaction site in mitochondrial respiratory complex I2020

    • Author(s)
      Uno, S., Masuya, T., Shinzawa-Itoh, K., Lasham, J., Haapanen, O., Shiba, T., Inaoka, D. K., Sharma, V., Murai, M., and Miyoshi, H.
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 295 Pages: 2449-2463

    • DOI

      10.1074/jbc.RA119.012347

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Defining the mechanism of action of S1QELs, specific suppressors of superoxide production in the quinone-reaction site in mitochondrial complex I2019

    • Author(s)
      Banba, A., Tsuji, A., Kimura, H., Murai, M. and Miyoshi, H
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 294 Pages: 6550-6561

    • DOI

      10.1074/jbc.RA119.007687

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The antibiotic korormicin A kills bacteria by producing reactive oxygen species,2019

    • Author(s)
      6. Maynard, A., Butler, N. L., Ito, T., da Silva, A. J., Murai, M., Chen, T., Koffas, M. A. G., Miyoshi, H., and Barquera, B.
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 201 Pages: e00718-18

    • DOI

      10.1128/JB.00718-18

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Fusaramin, an antimitochondrial compound produced by Fusarium sp., discovered using multidrug-sensitive Saccharomyces cerevisiae2019

    • Author(s)
      Sakai, K., Unten, Y., Iwatsuki, M., Matsuo, H., Fukasawa, W., Hirose, T., Chinen, T., Nonaka, K., Nakashima, T., Sunazuka, T., Usui, T., Murai, M., Miyoshi, H., Asami, Y., Omura, S., and Shiomi, K.
    • Journal Title

      Journal of Antibiotics

      Volume: 72 Pages: 645-652

    • DOI

      10.1038/s41429-019-0197-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photoaffinity labeling of respiratory complex I in bovine heart submitochondrial particles by photoreactive [125I]amilorides2019

    • Author(s)
      Murai, M. and Miyoshi, H
    • Journal Title

      Bio-Protocol

      Volume: 9 Pages: e3349

    • DOI

      10.21769/BioProtoc.3349

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] コレラ菌Na+輸送型NADH-キノン酸化還元酵素の阻害剤コロルミシンの結合部位の同定2020

    • Author(s)
      桝谷貴洋、佐野祐樹、田中比奈子、伊藤剛、Blanca Barquera、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第45回大会、2020年3月、大阪府立大学(コロナウイルス感染拡大により中止)
  • [Presentation] 抗がん剤候補化合物IACS-010759の呼吸鎖複合体-Iにおける作用機構2020

    • Author(s)
      辻諄人、赤尾拓海、桝谷貴洋、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第45回大会、2020年3月、大阪府立大学(コロナウイルス感染拡大により中止)
  • [Presentation] 人工キノン類を用いたミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iのキノン結合ポケットの構造特性の解明2020

    • Author(s)
      宇野晋平、桝谷貴洋、新澤-伊藤恭子、志波智生、稲岡健ダニエル、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農薬学会第45回大会、2020年3月、大阪府立大学(コロナウイルス感染拡大により中止)
  • [Presentation] コレラ菌Na+輸送型NADH-キノン酸化還元酵素の特異的化学修飾法の検討2020

    • Author(s)
      石川萌、桝谷貴洋、村井正俊、Blanca Bqrquera、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会、2020年3月、九州大学(コロナウイルス感染拡大により中止)
  • [Presentation] コレラ菌Na+輸送型NADH-キノン酸化還元酵素の阻害剤オーラシンの結合部位の同定2020

    • Author(s)
      佐野祐樹、桝谷貴洋、村井正俊、Blanca Bqrquera、三芳秀人、
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会、2020年3月、九州大学(コロナウイルス感染拡大により中止)
  • [Presentation] 人工キノン類を用いたミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iのキノン結合ポケットの構造特性の解明、2020

    • Author(s)
      宇野晋平、桝谷貴洋、新澤-伊藤恭子、志波智生、稲岡健ダニエル、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会、2020年3月、九州大学(コロナウイルス感染拡大により中止)
  • [Presentation] 抗がん剤候補化合物IACS-010759のミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iにおける作用機構2020

    • Author(s)
      辻諄人、桝谷貴洋、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会、2020年3月、九州大学(コロナウイルス感染拡大により中止)
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iの機能解明を目指した生物有機化学的研究2019

    • Author(s)
      村井正俊
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部例会(第508講演会)、2019年6月、京都府立大学
    • Invited
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-I のキノン/阻害剤結合ポケットの構造特性の解明2019

    • Author(s)
      宇野晋平、木村洋則、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部例会(第508講演会)、2019年6月、京都府立大学
  • [Presentation] 出芽酵母ミトコンドリアVDAC1を特異的に阻害するペンテンジオ ール類の作用機構研究2019

    • Author(s)
      運天優歩、村井正俊、山本武範、一丸直哉、篠原康雄、三芳秀人
    • Organizer
      日本農芸化学会関西・中部支部2019年度合同大会、2019年9月、神戸大学
  • [Presentation] 人工キノンを用いた呼吸鎖複合体-Iのキノン結合ポケットの構造特性の解明2019

    • Author(s)
      宇野晋平、桝谷貴洋、新澤-伊藤恭子、志波智生、稲岡健ダニエル、村井正俊、三芳秀人
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第45回討論会、2019年12月、九州工業大学
  • [Presentation] 出芽酵母ミトコンドリアVDAC1を特異的に阻害するペンテンジオール類の作用機構研究2019

    • Author(s)
      運天優歩、村井正俊、山本武範、篠原康雄、一丸直哉、三芳秀人
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第45回討論会、2019年12月、九州工業大学
  • [Presentation] ミトコンドリア呼吸鎖複合体-Iからの活性酸素発生を抑制する化合物群(S1QEL類)の作用機構研究2019

    • Author(s)
      村井正俊、馬場敦志、辻諄人、三芳秀人
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第45回討論会、2019年12月、九州工業大学
  • [Remarks] 所属研究室HP

    • URL

      http://www.biofunc-chem.kais.kyoto-u.ac.jp

  • [Remarks] Google Schalor

    • URL

      https://scholar.google.co.jp/citations?user=I66ybkoAAAAJ&hl=ja

URL: 

Published: 2021-01-27  

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