2019 Fiscal Year Research-status Report
転写・翻訳後修飾による植物生殖細胞の分化調節メカニズムの検証
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18K06285
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
山岡 尚平 京都大学, 生命科学研究科, 准教授 (00378770)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | 生殖細胞分化 / 配偶子形成 / 転写因子 / 陸上植物 / ゼニゴケ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
陸上植物の生殖細胞分化の制御には進化的に保存された転写因子BONOBO (BNB)が関わる。本研究では、BNBの転写・翻訳後調節に関わる因子を同定し、BNBの機能発現に重要なメカニズムを検証するとともに、ゼニゴケとシロイヌナズナを比較することで、生殖細胞分化のメカニズムの進化的保存性と多様性を明らかにする。
本年度は、昨年度に行ったゼニゴケにおいてbnbノックアウト変異株の相補に十分と考えられるゲノム領域に基づき、そのプロモーター領域を部分的に欠失させたベクターを作成し、ノックアウト変異株に導入することで、BNBの発現調節に関わる領域の特定を試みた。その結果、プロモーター領域にはBNBの発現を恒常的に活性化、あるいは抑制する領域があることが見出された。
また、シロイヌナズナBNBの機能相補に十分な領域のうち、プロモーター領域のレポーター株を作成した。その結果、葯発生の早期でのBNB発現の可能性が示唆された。そこで、このプロモーター領域を部分的に欠失させたレポーター株を作成し、現在その解析を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
BNBのプロモーター領域に、発現調節に重要な役割を果たすシス配列が複数あることを見出すことができた。また、シロイヌナズナBNBのプロモーター解析の見通しも立った。しかし結合転写因子のスクリーニングとその機能解析には至っておらず、全体として当初の計画よりもやや遅れが生じている。
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| Strategy for Future Research Activity |
ゼニゴケ・シロイヌナズナともに、BNBプロモーター領域にある重要なシス配列の特定を目指す。シロイヌナズナにおいて、そのシス配列に結合する転写因子を特定し、機能解析を行う。ゼニゴケのオルソログについて、ゲノム編集による機能解析を行う。両者の比較により、BNB発現調節メカニズムの進化について示唆を得る。
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| Causes of Carryover |
当初計画していた結合転写因子のスクリーニングおよびその遺伝子機能解析に至っておらず、またそれに伴って研究発表の機会も減ったため、次年度使用額が生じた。今年度はこれらの解析を達成するとともに、成果発表を行う予定である。
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[Journal Article] Chromatin Organization in Early Land Plants Reveals an Ancestral Association between H3K27me3, Transposons, and Constitutive Heterochromatin2020
Author(s)
Montgomery SA, Tanizawa Y, Galik B, Wang N, Ito T, Mochizuki T, Akimcheva S, Bowman JL, Cognat V, Drouard L, Ekker H, Houng SF, Kohchi T, Lin SS, Liu LYD, Nakamura Y, Valeeva LR, Shakirov EV, Shippen DE, Wei WL, Yagura M, Yamaoka S, Yamato KT, Liu C, Berger F.
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Journal Title
Current Biology
Volume: 30
Pages: 573～588.e7
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Presentation] Chromosome-level genome assembly of liverwort Marchantia polymorpha and updates of the genome database MarpolBase2020
Author(s)
Tanizawa Y, Yagura M, Sakamoto M, Mochizuki T, Montgomery SA, Galik B, Yamaoka S, Nishihama R, Yamato KT, Kohchi T, Berger F, Liu C, Nakamura Y.
Organizer
第61回日本植物生理学会年会
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[Presentation] Analysis of the Mechanism How Antisense lncRNA SUF Represses the Female Promoting Factor MpFGMYB in Marchantia polymorpha2019
Author(s)
Kajiwara T, Okahashi K, Hisanaga T, Miyazaki M, Iwasaki M, Yamaoka S, Nishihama R, Shimamura M, Yamato KT, Nakajima K, Kohchi T.
Organizer
Marchantia Workshop 2019
Int'l Joint Research
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[Presentation] Update of MarpolBase to accommodate ver. 5.1 gene annotation2019
Author(s)
Tanizawa Y, Yagura M, Sakamoto M, Mochizuki T, Montgomery SA, Galik B, Yamaoka S, Yamato KT, Kohchi T, Nakamura Y, Liu C, Berger F.
Organizer
Marchantia Workshop 2019
Int'l Joint Research
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