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2020 Fiscal Year Research-status Report

Super resolution microscopy for long term observation of intravital nano-structures

Research Project

Project/Area Number 18K06591
Research InstitutionCenter for Novel Science Initatives, National Institutes of Natural Sciences

Principal Investigator

大友 康平  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究, 生命創成探究センター, 助教 (40547204)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywords二光子顕微鏡 / 超解像顕微鏡 / ライブイメージング / 補償光学 / ナノ薄膜 / 深層学習
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題の目的である生体内微細構造の長期的可視化を実現するために、本年度も継続して低毒性かつ高精細なイメージングを実現する顕微技術開発、生物学応用研究を実施した。
まず、高速撮像による低毒性イメージング手法である多点走査型二光子励起顕微鏡法について、新規ネオジミウムファイバレーザー光源をシステムに導入することにより、通常のモードロックチタンサファイヤレーザー光源よりも 30 倍高輝度な緑系発色団のイメージングを達成した。本成果については原著論文を第一著者、責任著者として発表した (K. Otomo et al., Biochem, Biophys. Res. Commun. (2020))。また、本法をモデル植物の葉における細胞小器官のライブイメージングにも応用し、成果として原著論文を発表した (S. Nakamura et al., Plant Cell Physiol. (2020))。
さらに、関連要素技術として、補償光学技術、ナノ薄膜の生体イメージング応用、深層学習による多細胞自動追跡プログラムの応用を行い、それぞれについて原著論文を発表した (K. Yamaguchi et al., PLOS ONE (2020); K. Yamaguchi et al., ACS Omega, (2020); T. Takahashi et al., iScience (2020); W. Chentao et al., eLife (2020))。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

当初の計画と比較すると、多くの関連技術開発に関する成果を報告できた。しかしながら、コロナ禍により、一部実験が遅延しており、超解像顕微鏡法および低侵襲高速多色イメージング技術開発に関連する成果の発表に至っていない。

Strategy for Future Research Activity

超解像顕微鏡法および低侵襲高速多色イメージング技術開発について、予備実験を実施し、成果として原著論文を発表する。

Causes of Carryover

コロナ禍により一部実験が遅延したため、一年の期間延長を行った。次年度使用額は予備実験および論文投稿費用に充てる。

  • Research Products

    (18 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] KU Leuven(ベルギー)

    • Country Name
      BELGIUM
    • Counterpart Institution
      KU Leuven
  • [Int'l Joint Research] Columbia University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Columbia University
  • [Journal Article] 3DeeCellTracker, a deep learning-based pipeline for segmenting and tracking cells in 3D time lapse images2021

    • Author(s)
      Wen Chentao、Miura Takuya、Voleti Venkatakaushik、Yamaguchi Kazushi、Tsutsumi Motosuke、Yamamoto Kei、Otomo Kohei、Fujie Yukako、Teramoto Takayuki、Ishihara Takeshi、Aoki Kazuhiro、Nemoto Tomomi、Hillman Elizabeth MC、Kimura Koutarou D
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 10 Pages: e59187

    • DOI

      10.7554/elife.59187

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] High-peak-power 918-nm laser light source based two-photon spinning-disk microscopy for green fluorophores2020

    • Author(s)
      Otomo Kohei、Goto Ai、Yamanaka Yumi、Hori Takashi、Nakayama Hiroshi、Nemoto Tomomi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 529 Pages: 238~242

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.05.213

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] In vivo two-photon microscopic observation and ablation in deeper brain regions realized by modifications of excitation beam diameter and immersion liquid2020

    • Author(s)
      Yamaguchi Kazushi、Kitamura Ryoji、Kawakami Ryosuke、Otomo Kohei、Nemoto Tomomi
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 15 Pages: e02372300

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0237230

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] PEO-CYTOP Fluoropolymer Nanosheets as a Novel Open-Skull Window for Imaging of the Living Mouse Brain2020

    • Author(s)
      Takahashi Taiga、Zhang Hong、Kawakami Ryosuke、Yarinome Kenji、Agetsuma Masakazu、Nabekura Junichi、Otomo Kohei、Okamura Yosuke、Nemoto Tomomi
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 23 Pages: 101579~101579

    • DOI

      10.1016/j.isci.2020.101579

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Autophagy Contributes to the Quality Control of Leaf Mitochondria2020

    • Author(s)
      Nakamura Sakuya、Hagihara Shinya、Otomo Kohei、Ishida Hiroyuki、Hidema Jun、Nemoto Tomomi、Izumi Masanori
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa162

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Adaptive Optical Two-Photon Microscopy for Surface-Profiled Living Biological Specimens2020

    • Author(s)
      Yamaguchi Kazushi、Otomo Kohei、Kozawa Yuichi、Tsutsumi Motosuke、Inose Tomoko、Hirai Kenji、Sato Shunichi、Nemoto Tomomi、Uji-i Hiroshi
    • Journal Title

      ACS Omega

      Volume: 6 Pages: 438~447

    • DOI

      10.1021/acsomega.0c04888

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 新規パルス光源系を用いた二光子STED顕微鏡の開発2020

    • Author(s)
      石井宏和 , 大友康平 , Jui-Hung Hung , 堤元佐 , 横山弘之 , 根本知己
    • Journal Title

      光学

      Volume: 49 Pages: 232

  • [Journal Article] 二光子顕微鏡の技術開発と生物学応用2020

    • Author(s)
      大友康平、石井宏和、根本知己
    • Journal Title

      光アライアンス

      Volume: 31 Pages: 42-45

  • [Presentation] ヒメミカヅキモにおける蛍光標識CenH3タンパク質の発現による染色体可視化2021

    • Author(s)
      渡辺実咲, 村田隆, 堤元佐, 大友康平, 根本知己, 西山智明, 土金勇樹, 関本弘之
    • Organizer
      日本藻類学会第45回大会
  • [Presentation] 空間光位相変調器を用いた収差補正による生体組織深部の微細構造の可視化2021

    • Author(s)
      山口和志, 大友康平, 小澤祐市, 堤元佐, 猪瀬朋子, 平井健二, 佐藤俊一, 根本知己, 雲林院宏
    • Organizer
      日本化学会 第101春季年会
  • [Presentation] Two-Photon Excitation Spinning-Disk Confocal Microscopy and Its Biological Applications2020

    • Author(s)
      Kohei Otomo, Takafumi Kamada, Ai Goto, Yumi Yamanaka, Tomomi Nemoto
    • Organizer
      Focus On Microscopy 2020
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 二光子励起顕微鏡の機能向上による多次元生細胞イメージング2020

    • Author(s)
      大友康平, 根本知己
    • Organizer
      生理学研究所研究会 「細胞システム理解のためのシグナル応答原理解明の最前線」
    • Invited
  • [Presentation] Two-photon excitation confocal spinning-disk microscopy for real-time visualizations of biological phenomena2020

    • Author(s)
      Kohei Otomo
    • Organizer
      A3 Foresight & 5 Star Alliance Joint Workshop on Organic/Inorganic Hybrid Nano Materials and Bio Imaging
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Improving two-photon excitation microscopy for deeper, sharper and/or faster intravital imaging2020

    • Author(s)
      Kohei Otomo
    • Organizer
      44th Meeting of Australian Society for Biophysics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Origin of mitotic spindle microtubules in plant cells2020

    • Author(s)
      Takashi MURATA, Kohei OTOMO, Tomomi NEMOTO, Mitsuyasu HASEBE
    • Organizer
      第 58 回 日本生物物理学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Measurement of physical properties underlying the chromatin mobility in interphase nuclei2020

    • Author(s)
      Noritaka MOTOKI, Kohei OTOMO, Tomomi NEMOTO, Akatsuki KIMURA
    • Organizer
      第 58 回 日本生物物理学会年会

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Published: 2021-12-27  

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