2020 Fiscal Year Annual Research Report
Examination of the persistent infection mechanism of Helicobacter pylori by phage lysogenization
| Project/Area Number |
18K07127
|
|---|
| Research Institution | Azabu University |
|---|
Principal Investigator |
内山 淳平 麻布大学, 獣医学部, 講師 (20574619)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
松崎 茂展 高知大学, 医学部, 客員教授 (00190439)
林 俊治 北里大学, 医学部, 教授 (40260765)
阪口 義彦 北里大学, 医学部, 講師 (70403491)
三室 仁美 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 (80396887)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
|
| Keywords | ピロリ菌 / ファージ |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
１．KHP30様ファージのピロリ菌内在化に関する遺伝的解析：研究分担者（林俊治 氏）が保有するピロリ菌 約300株からKHP30様ファージ保有に関してPCRスクリーニングを行ために、研究を行った。共同研究者 林 俊治 氏より菌株の譲渡を行った。その中の菌株を現在、培養を行っている。また、PCR用の試料の調製を行った。PCRを行ったものの、ファージの配列は検出されなかった。
２．KHP30様ファージが脱落・再内在化した菌株の網羅的mRNA発現解析：平板寒天培地を使用し、ファージ保有ピロリ菌からファージ脱落ピロリ菌、再度ファージを内在化させたピロリ菌を分離した。ピロリ菌株には、ファージを内在化するKMT83株とNY43株を使用する。種々の培養条件で分離菌を培養し（嫌気培養あるいは微好気培養）、高速シークエンサー（Illumina社MiSeq）による網羅的なmRNA発現解析（RNAseq解析）用の試料調製を行なった。今後、RNA抽出を行い、RTPCRを行った後、高速シークエンサー用のサンプル調製を行いたい。
３．「KHP30様ファージ内在化によるピロリ菌の持続感染能力の検討」に関しては、２の研究が終了しておらず、現在準備中である。
|
-
-
-
-
-
-
-
-
[Journal Article] Taxonomy of prokaryotic viruses: 2018-2019update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee2020
Author(s)
Adriaenssens EM, Sullivan MB, Knezevic P, van Zyl LJ, Sarkar BL, Dutilh BE, Alfenas-Zerbini P, Lobocka M, Tong Y, Brister JR, Switt AIM, Klumpp J, Aziz RK, Barylski J, Uchiyama J, et al.
-
Journal Title
Archives of Virology
Volume: 165
Pages: 1253～1260
DOI
Peer Reviewed
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
