2020 Fiscal Year Annual Research Report
Systematic re-estimation of polymorphism of T. pallidum genome from wider range of specimens including T. p DNA of lower copy numbers
Project/Area Number |
18K09184
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Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
Principal Investigator |
中山 周一 国立感染症研究所, 細菌第一部, 主任研究官 (80280767)
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Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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Keywords | 近縁系統株を細分可能なSNP |
Outline of Annual Research Achievements |
課題目標に沿って、2018年以前の検体群とも合わせ、従前から継続している分子型別、耐性サーベーランスの2017~2018年の集計結果をまとめた。また、2014~2018年の国内梅毒トレポネーマDNAのゲノムシーケンス解析結果を投稿論文で公表した。この論文において、課題の目標の1つとしていた近縁関係にある株群、今回は日本株と中国株とをほぼ細分化できる1塩基置換を同定した。 またこれとは別に2020年初頭から、Washington大、L. Giacani主導の、梅毒ワクチン開発を目指した世界各国の梅毒トレポネーマゲノム解析プロジェクトに参加して2019年1月~2020年2月までの日本国内陽性例82サンプルを共有し、共同でデータ解析を行っている。
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Research Products
(3 results)
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[Journal Article] A novel peptide nucleic acid-and loop-mediated isothermal amplification assay for the detection of mutations in the 23S rRNA gene of Treponema pallidum.2020
Author(s)
Tarumoto, N., Imai, K., Nakayama, S., Itoda, I,, Sakai, J., Murakami, T., Maesaki, S., Hayakawa, S., Ohnishi, M., and Maeda, T.
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Journal Title
J. Med. Microbiol.
Volume: 69
Pages: 1339-1345.
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Epidemiology, Molecular Strain Types, and Macrolide Resistance of Treponema pallidum in Japan, 2017-2018.2020
Author(s)
Nishiki, S., Arima, Y., Kanai, M., Shimuta, K., Nakayama, S., and Ohnishi
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Journal Title
J. Infect. Chemother.
Volume: 26
Pages: 1042-1047
DOI
Peer Reviewed