2019 Fiscal Year Research-status Report
A novel strategy on inactivation of animal RNA viruses by RNA editing system
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18K19264
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
堀本 泰介 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (00222282)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
村上 晋 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (10636757)
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| Project Period (FY) |
2018-06-29 – 2021-03-31
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| Keywords | ウイルス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、新奇の革新的RNA編集テクノロジーであるCRISPR/FnCas9およびCRISPR/LwaCas13aシステムを用いたウイルスゲノムの不活化戦略により、動物のウイルス感染症の制御、特に鳥インフルエンザなどこれまでその制御が困難とされる動物RNAウイルス感染症に焦点を絞り、それらの革新的な制御法の確立を目指す。本来、DNAを標的とするゲノム編集システムであるが、最近、新しい種類のCasである特にFnCas9やLwaCas13aが、DNAのみならずRNAを認識してそれを切断・不活化することが報告された。本研究はその知見をRNAウイルスゲノムの不活化、ウイルスの増殖抑制に応用することを試みるものである。特に、インフルエンザウイルスの増殖抑制にRNAゲノム編集システムを初めて応用する。RISPR/CasはPAM配列非依存的にRNAを切断するので、HA亜型に関係なく全てのインフルエンザウイルスをユニバーサルに制御できる可能性がある。
本年度は、プラスミドバンク（米国Addgene社）より入手したLwaCas13a遺伝子を含むプラスミドからLwaCas13a遺伝子を切り出し、CRISPRシステムに適用可能な発現ベクターにサブクローニングしたものと、インフルエンザウイルスの特異配列を認識できるRNA-targeting guide RNA（rgRNA）を発現するプラスミドを同時に培養細胞に導入し、インフルエンザウイルスの増殖が抑制できるかを評価した。しかし、現在までいくつかのコンストラクトを試したが、細胞でのインフルエンザウイルスの増殖抑制効果は見られていない。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
トランスフェクションベースにおいても期待したウイルス増殖抑制効果は今のところ見られていないため、非増殖型ウイルスベースの構築に進むことができていない。また、COVID-19の影響で、一部の実験実施が停滞している。
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| Strategy for Future Research Activity |
最近、本研究と同様な方法（PAC-MAN）で、同じRNAウイルスであるコロナウイルスの細胞での増殖抑制に成功し、またこのコンストラクトはヒトのインフルエンザウイルスにも応用できることを示した論文が発表された。そこで今後は、標的配列のデザインなどをこの方法を参考にして実施し、鳥インフルエンザウイルスを標的とするrgRNAコンストラクトを構築し、ウイルス抑制効果を検証する。
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| Causes of Carryover |
予定していた実験の進展がやや遅れており、また、COVID-19の影響で実験の自粛期間が発生したため、次年度使用額が発生した。今後の研究方針は明確化されており、その早期実現のためにやや費用のかかるキット類や遺伝子人工合成などを利用することで、集中して実験を実施する予定である。
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Research Products
(1 results)
