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2008 Fiscal Year Annual Research Report

オートファジー分子機構とその多様性の解明

Research Project

Project/Area Number 19002015
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

大隅 良典  National Institute for Basic Biology, 分子細胞生物学研究部門, 教授 (30114416)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鎌田 芳彰  基礎生物学研究所, 分子細胞生物学研究部門, 助教 (20291891)
中戸川 仁  基礎生物学研究所, 分子細胞生物学研究部門, 助教 (90414010)
Keywordsオートファジー / Atg / 膜動態 / オートファゴソーム / P13キナーゼ / ミトコンドリア分解 / 栄養飢餓
Research Abstract

第2年次である今年度における計画は順調に進行し、得られた成果は以下の通りである。
1. オートファジーに必須な2つの結合反応系に関しては、Atg12-Atg5がAtg8のPE化のE2酵素、Atg3と相互作用して、活性を促進する機序の一端が明らかとなった。反応のチオエステル中間体を検出する方法を確立し、素過程の理解が深まると共に、脂質化反応の基質となる脂質の選択性に関する知見が得られた。精緻な細胞分画法により、Atg8-PEが存在する構造の解析の準備が整った。
2. オートファゴソーム形成に関わるPASに関する理解が進み、飢餓によって誘導されるAtg17-Atg29-Atg31の3者複合体を基部とし、Atg13-Atg1が結合した5者からなるPASの理解が深まり、その動的な性格が明らかとなった。
3. Atg17に結合することで、5者複合体の直下で働くAtg9の機能解析が進み、細胞質を激しく動き回るドットとPASとPAS周辺に局在するAtg9との関係が明らかにされつつある。
4. Atg13が直接Torキナーゼによってリン酸化される複数の部位を同定し、それらのアラニン置換体、非リン酸化型Atg13を発現させるだけで、栄養培地中でもオートファジーが誘導されることを明らかにした。
5. グリセロール培地で増殖する酵母では、増殖時にLap3がCvt系路によって液胞に運ばれ、分解されることからCvt系路が分解系として機能することが明らかとなった。飢餓条件下には、Lap3はオートファゴソームに選択的に取り込まれることも分った。
6. 非醗酵性のグリセロール培養の酵母は増殖が停止する時期にミトコンドリアのみを取り込んだオートファジックボディー様の構造が液胞に送り込まれ、分解される。この過程に必須の因子を網羅的にスクリーニングし、ミトコンドリア外膜に存在するMtv1タンパク質がリセプターとして必須の機能をしていることを解明した。
7. 北大稲垣研との共同研究により、Atg4BとLC3との複合体の構造が明らかになり、その機能を理解が進んだ。

  • Research Products

    (22 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (14 results) (of which Peer Reviewed: 14 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] A. Autophagy plays a role in chloroplast degradation during senescence in individually darkened leaves2009

    • Author(s)
      Wada, S.
    • Journal Title

      Plant Physiol. 149

      Pages: 885-893

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] OsATG10b, an autophagosome component, is needed for cell survival against oxidative stresses in rice2009

    • Author(s)
      Shin, J.
    • Journal Title

      Mol Cells. 27

      Pages: 67-74

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Lap3 is a selective target of autophagy in yeast, Saccharomyces cerevisiae2009

    • Author(s)
      Kageyama, T.
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Comm. 378

      Pages: 551-557

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The yeast Tor signaling pathway is involved in G2/M transition via Polo-kinase2008

    • Author(s)
      Nakashima, A.
    • Journal Title

      PLoS ONE 3

      Pages: e2223

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Physiological pH and acidic phospholipids contribute to substrate specificity in lipidation of Atg 82008

    • Author(s)
      Oh-oka, K.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 21847-21852

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Atg 18-Atg 2 complex is recruited to autophagic membranes via Ptdlns (3) P and exerts an essential function2008

    • Author(s)
      Obara, K.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 283

      Pages: 23972-23980

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mobilization of Rubisco and stromal-localized fluorescent proteins of chloroplasts to the vacuole by an ATG gene-dependent autophagic process2008

    • Author(s)
      Ishida, H.
    • Journal Title

      Plant Physiol. 148

      Pages: 142-155

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization of the coiled-coil domain of Atg 16 essential for autophagy2008

    • Author(s)
      Fujioka, Y.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun 64

      Pages: 1046-1048

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis of target recognition by Atg8/LC3 during selective autophagy2008

    • Author(s)
      Noda, N. N.
    • Journal Title

      Genes Cells 12

      Pages: 1211-1218

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Atg17 recruits Atg9 to organize the pre-autophagosomal structure

    • Author(s)
      Sekito, T.
    • Journal Title

      Genes Cells (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The amino-terminal region of Atg3 is essential for association with phosphatidylethanolamine in Atg8 lipidation

    • Author(s)
      Hanada, T.
    • Journal Title

      FEBS Lett. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The structure of Atg4B-LC3 complex reveals the mechanism of LC3-processing and delipidation during autophagy

    • Author(s)
      Satoo, K.
    • Journal Title

      EMBOJ. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamics and function of PtdIns (3) P in autophagy

    • Author(s)
      Obara, K.
    • Journal Title

      Autophagy 4

      Pages: 952-954

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ATG Systems from the Protein Structural Point of View

    • Author(s)
      Noda, N.
    • Journal Title

      Chem Rev. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Molecular Basis of Mitophagy, Degradation of Mitochondria via Autophagy-Related Membrane Dynamics in Yeast2009

    • Author(s)
      Koji Okamoto
    • Organizer
      Keystone Symposia Confernce, Mitochondrial Dynamics and Physiology
    • Place of Presentation
      Whistler, British Columbia, Canada
    • Year and Date
      2009-03-26
  • [Presentation] 高等植物に見られるAtg6-Vps34-UVRAG複合体の様々な生理機能2008

    • Author(s)
      藤木友紀
    • Organizer
      第81回日本生化学会大会合同
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-12
  • [Presentation] 出芽酵母pre-autophagosomal structure(PAS)の栄養飢餓応答-ATg31のリン酸化からのアプローチ2008

    • Author(s)
      壁谷幸子
    • Organizer
      第81回日本生化学会大会合同
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-12
  • [Presentation] ミトコンドリア・オートファジーに関わる遺伝子ゲノムワイドスクリーニング2008

    • Author(s)
      岡本(近藤)徳子
    • Organizer
      第81回日本生化学会大会合同
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-12
  • [Presentation] Torによるオートファジー誘導の制御機構2008

    • Author(s)
      鎌田芳彰
    • Organizer
      第81回日本生化学会大会合同
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] Molecular basis of mitophagy, degradation of mitochondria via selective autophagy2008

    • Author(s)
      Koji Okamoto
    • Organizer
      第81回日本生化学会大会合同
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-09
  • [Presentation] Tor signaling controls mitotic entry via polo-kinaze in the budding yeast2008

    • Author(s)
      Yoshiaki Kamada
    • Organizer
      the 2008 Yeast Genetics and Molecular Biology Meeting
    • Place of Presentation
      University of Toronto, Canada
    • Year and Date
      2008-07-26
  • [Presentation] Molecular Dissection of Autophagy in Yeast2008

    • Author(s)
      Yoshinori Ohsumi
    • Organizer
      XX INTERNATIONAL CONGRESS OF GENETICS
    • Place of Presentation
      Berlin, Germany
    • Year and Date
      2008-07-17

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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