2008 Fiscal Year Annual Research Report
テーパー状流路を用いた単一細胞からの瞬間RNA抽出と解析研究
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19021018
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| Research Institution | Japan Advanced Institute of Science and Technology |
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Principal Investigator |
高村 禅 Japan Advanced Institute of Science and Technology, マテリアルサイエンス研究科, 准教授 (20290877)
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| Keywords | バイオナノ / マイクロ・ナノデバイス / 遺伝子 / 分子トラップ / RNA抽出 / μTAS / DNAトラップ / DNA解析 |
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| Research Abstract |
本年度得られた成果を列挙する。
1. RNA抽出条件の精査と品質の確認
これまでの研究で開発した変性剤を用いたトラップ抽出法でも、PCR可能なことが確認されたが、本年度はさらに品質を上げるため、変性剤を用いない方法の開発を試みた。その結果、一旦70℃以上にサンプルを過熱し、一旦熱変性させ、その後常温で速やかにトラップすることで、十分なトラップが可能な条件が見つかった。本法は、変性剤を用いないため、後処理に対する影響が少なく、より適しているとがえれる。
2. 単一細胞よりRNAを瞬間抽出し、解析部に確実に渡すためのチップ開発
本年度は、特定の検出方法に特化した、チップの設計・最適化を行う。現在、パフォーマンス上のボトルネックとして、単一細胞をチップ内に導入する工程である。したがってここを改善するため、複数の細胞をが含まれている液より、単一細胞を自動的にピックアップし、それぞれの解析流路に一つずつ導入する、微小流体デバイスを開発した。これは、本法以外にも、単一細胞の解析、特に再生医療等での利用が期待されている。
3. RNA解析方法の開発
3-1 チップ内集積化可能な簡易解析方法の開発
昨年度開発したチップ上にミネラルオイルを保持する方法をさらに発展させ、ミネラルオイルを用いない方法の開発に取り組む。具体的には、チップ内部の、水上気圧を制御し、かつガスを投下しにくい膜をチップ内にコーティングする手法を検討する。ミネラルオイルを用いずとも、蒸発が抑えられることを確認した。
3-2 チップ外の装置を組み合わせたより高度な解析法の開発
チップ内で抽出したRNAをゲル内に保持し、外へ取り出す手法により、定量的な評価を行った。
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