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2009 Fiscal Year Self-evaluation Report

New genome medicine and drug discovery based on the comprehensive transcriptome analysis

Research Project

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Project/Area Number 19109001
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (S)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Biological pharmacy
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

TSUJIMOTO Gozoh  Kyoto University, 薬学研究科, 教授 (80172013)

Project Period (FY) 2007 – 2011
KeywordsmiRNA / 上皮細胞 / がん / 分化
Research Abstract

(1)近年トランスクリプトーム中には従来考えられていたよりも複雑多様な転写物が存在し、それら転写物が生物学的機能を有している可能性があり、中でも機能調節には蛋白質をコードしないRNA(non-protein-coding RNA ; ncRNA)の関与が最も注目されている。バイオインフォマティクス解析によりncRNAはヒト、マウスで数千から一万以上存在することが示されつつあり、ncRNAは蛋白質をコードするRNA(coding RNA ; cRNA)に対してアンチセンスDNAやsiRNAとして機能し得る構造を持つ場合が多い。ncRNAを含む包括的トランスクリプトーム解析研究は疾病の分子メカニズムや医薬品の作用機構に新たな次元の理解を導くことが予測される。本研究では、バイオインフォマティクスにより生物学的に機能が予測されるncRNA(特にmiRNA)にcRNAを含めた包括的トランスクリプトーム解析用マイクロアレイDNAチップを用い、特にがん関連機能RNA(群)、中でもmiRNAを抽出するとともにその生物学的意義を検証することを目的とする。
(2)国内外で、臨床トランスクリプトーム解析がなされており、一部の疾患では個人化医療の実現に臨床応用されようとしている。しかしながら、すべての研究はcRNAのみを対象とするDNAチップ解析研究であり、生物学的機能がほとんど未知であるncRNA、特にmiRNAをも含めた包括的トランスクリプトーム解析は未だ世界に例を見ない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2010 2007 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Genome-wide analysis of aberrant methylation in human breast cancer cells using methyl-DNA immunoprecipitation combined with high-throughput sequencing2010

    • Author(s)
      Ruike Y, Imanaka Y, Sato F, Shimizu K, Tsujimoto G.
    • Journal Title

      BMC Genomics 11

      Pages: 137

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] miR-34a inhibits cell proliferation by repressing MEK1 during megakaryocytic differentiation of K5622010

    • Author(s)
      Ichimura A, Ruike Y, Terasawa K, Shimizu K, Tsujimoto G.
    • Journal Title

      Mol Pharmacol (Epub ahead of print)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 慢性骨髄性白血病細胞株K562においてTPA刺激により誘導されるmiRNAおよび標的遺伝子探索2007

    • Author(s)
      市村敦彦, 類家慶直, 寺澤和哉, 辻本豪三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会 (BMB2007)
    • Place of Presentation
      神奈川県横浜市
    • Year and Date
      2007-12-11
  • [Remarks]

    • URL

      http://gdds.pharm.kyoto-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2011-06-18   Modified: 2016-04-21  

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