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2010 Fiscal Year Annual Research Report

生物における構造形成と情報に関する数理的研究

Research Project

Project/Area Number 19340023
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

小林 亮  広島大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60153657)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中垣 俊之  公立はこだて未来大学, システム情報科学部, 教授 (70300887)
三浦 岳  京都大学, 大学院・医学研究科, 准教授 (10324617)
Keywords真正粘菌小形体 / フェーズフィールド / 卵割 / 数理マデル / モルフォゲン / アメーバ運動
Research Abstract

アメーバ運動の数理モデルを構築するには、形状の大変形と、ゲル層の収縮によって引き起こされる原形質ゾルの流れ、ゾルゲル変換、および運動を制御する情報処理のメカニズムを記述する必要がある。我々はフェーズフィールドモデルに粒子法(SPH法)を組み合わせることによって、物理層を記述する数理モデルを提案した。さらに単純な反応拡散系を組み合わせることで、極性を自発的に作ることができることを確認した。
中垣らは、アメーバ運動に伴う細胞変形と原形質流動の3次元計測システム、床反力の測定システムを開発し、概ね後方で強く踏ん張っていることを観察した。この結果は、アメーバ運動に関する我々の仮説「前方は後方に比較して柔らかい」を支持するものである。
前年度に提案した卵割モデルは、中心体の運動が植物極と動物極で生成される拡散性の2種のモルフォゲンによりコントロールされるという仮説に基づいている。質量分析の専門家の協力を得て、実際のウニ卵におけるモルフォゲンの探索を開始した。また、形状変化まで含めた現実的な卵割の過程を数理的に記述するために、多細胞型フェーズフィールドを用いたモデリングを行った。
三浦は肺の分岐構造の形成の数理モデルを提案した。このモデルでは、形状はフェーズフィールドで記述するが、成長を制御すると考えられているFGFの分布を拡散方程式ではなく畳み込み積分で表現している点が特徴的である。さらに血管内皮細胞の作るメッシュ状構造のサイズがVEFGの単純な拡散ではなく、VEFGと細胞外基質の相互作用によって決まるという仮説を提案した。

  • Research Products

    (17 results)

All 2011 2010

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (9 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Mechanism of lung branching morphogenesis2011

    • Author(s)
      T.Miura
    • Journal Title

      Biological and Physical Constraints on the Evolution of Form in Plants and Animals

      Volume: (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mathematical model for contemplative amoeboid locomotion2011

    • Author(s)
      K.Ueda
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: 83 Pages: 02191

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of seld-organized transportation networks in the polydomous Argentine ant2011

    • Author(s)
      T.Latty
    • Journal Title

      Journal of The Royal Society, Interface

      Pages: doi: 10.1098/rsif.2010.0612

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reaction-Diffusion model as a Framework for Understanding Biological Pattern Formation2010

    • Author(s)
      S.Kondo
    • Journal Title

      Science

      Volume: 329 Pages: 1616-1620

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Risk management in spatio-temporally varying field by true slime mold2010

    • Author(s)
      K.Ito
    • Journal Title

      NOLTA (Nonlinear Theory and Application) journal, IEICE

      Volume: 1 Pages: 26-36

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mathematical analysis to coupled oscillators system with a conservation law2010

    • Author(s)
      T.Miyaji
    • Journal Title

      RIMS Kokyuroku Bessatsu

      Volume: B21 Pages: 129-147

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Mathematical Modeling of Crawling Animals2010

    • Author(s)
      R.Kobayashi
    • Organizer
      9th iCeMS International Symposium"Mesoscale Control and Engineering of Self-Organized and Excitable Systems in Biology and Chemistry"
    • Place of Presentation
      Kyoto(招待講演)
    • Year and Date
      2010-12-03
  • [Presentation] Ethology of an amoeba-physiology and mathematical modeling-2010

    • Author(s)
      T.Nakagaki
    • Organizer
      Lecture in GCOE program Industrial Mathematics
    • Place of Presentation
      Meiji University, Tokyo(招待講演)
    • Year and Date
      2010-10-25
  • [Presentation] Mechanism of lung branching morphogenesis2010

    • Author(s)
      T.Miura
    • Organizer
      24th ALTENBERG WORKSHOP IN THEORETICAL BIOLOGY
    • Place of Presentation
      Vienna, Austria(招待講演)
    • Year and Date
      2010-09-26
  • [Presentation] Mathematical Modeling of the Locomotion of Amoeba2010

    • Author(s)
      R.Kobayashi
    • Organizer
      Czech-Japan Seminar in Applied Mathematics
    • Place of Presentation
      Prague, Czech(招待講演)
    • Year and Date
      2010-08-31
  • [Presentation] Mathematical Modeling for Pattern Formation in Nature2010

    • Author(s)
      R.Kobayashi
    • Organizer
      ISSCG-14
    • Place of Presentation
      Dalian, China(招待講演)
    • Year and Date
      2010-08-04
  • [Presentation] 真正粘菌の知性-細胞のエソロジカルダイナミクス-2010

    • Author(s)
      小林亮
    • Organizer
      理論生物学(理研ASI細胞システムコロキウムシリーズI)
    • Place of Presentation
      理研、和光(招待講演)
    • Year and Date
      2010-06-04
  • [Presentation] 真正粘菌の知性2010

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Organizer
      理論生物学(理研ASI細胞システムコロキウムシリーズI)
    • Place of Presentation
      理研、和光(招待講演)
    • Year and Date
      2010-06-04
  • [Presentation] Mechanism of lung branching morphogenesis2010

    • Author(s)
      三浦岳
    • Organizer
      日本生理学会みちのくシンポジウム
    • Place of Presentation
      盛岡(招待講演)
    • Year and Date
      2010-05-19
  • [Presentation] Ethology of plasmodial amoeba of slime mold in relation to the capacity of information processing in cell2010

    • Author(s)
      T.Nakagaki
    • Organizer
      2^<nd> GCOE International Symposium of Animal Global Health.
    • Place of Presentation
      Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine(Special lecture 招待講演)
    • Year and Date
      2010-04-04
  • [Book] 理論生物学(望月敦編著)真正粘菌の運動と知性(分担執筆)2011

    • Author(s)
      小林亮、中垣俊之
    • Total Pages
      290
    • Publisher
      共立出版
  • [Book] 粘菌-その驚くべき知性-2010

    • Author(s)
      中垣俊之
    • Total Pages
      198
    • Publisher
      PHPサイエンスワールド新書

URL: 

Published: 2012-07-19  

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