2008 Fiscal Year Final Research Report
Prevalence and comparative molecular epidemiologic analysis of enteric bacteria in south Asia and Africa
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19406015
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 海外学術 |
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| Research Field |
Bacteriology (including Mycology)
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| Research Institution | Osaka Prefecture University |
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Principal Investigator |
YAMASAKI Shinji Osaka Prefecture University, 生命環境科学研究科, 教授 (70221653)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
IIJIMA Yoshio 神戸市環境保健研究所, 微生物部, 部長 (60144739)
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| Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) |
TSUKAMOTO Teizo 大阪府立大学, 生命環境科学研究科, 客員研究員 (80250314)
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| Research Collaborator |
OUNDO Joseph O. ケニア中央医学研究所微生物研究センター, 研究員
NAIR Gopinath B. 国際下痢性疾患研究センター, 研究部部長
FARUQUE Shah M. 国際下痢性疾患研究センター, 分子遺伝学研究室, 室長
RAMAMURTHY Thandavarayan インド国立コレラ及び腸管感染症研究所, 副所長
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| Project Period (FY) |
2007 – 2008
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| Keywords | コレラ菌 / 下痢原性大腸菌 / 腸管感染症菌 / 分子疫学 / 病原因子 / アフリカ / 南アジア |
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| Research Abstract |
インド、ケニアでの主要な下痢原因菌と考えられる下痢原性大腸菌とコレラ菌について解析した。下痢症患者便をマッコンキー寒天培地で培養し得られたコロニーからボイルテンプレートを作製しReal-time PCRで下痢原性大腸菌の病原因子を網羅的に解析した。インドでは、ipaH遺伝子陽性菌(腸管組織侵入性大腸菌)が最も陽性率が高く、次にeaeA遺伝子陽性菌(腸管病原性大腸菌)の順であったが、ケニアではelt遺伝子陽性菌(腸管毒素原生大腸菌)の陽性率が最も高く、次にaagR遺伝子陽性菌(腸管凝集性大腸菌)であった。我が国で陽性率の高いcdt遺伝子陽性大腸菌がインドやケニアではあまり検出されなかった。一方、コレラ菌に関しては、バングラデシュで見つかったハイブリッド型O1コレラ菌(エルトールバリアント)はインドでは1990年に既に分離されており1995年以降分離されたO1コレラ菌は全てハイブリッド型(エルトールバリアント)であることが明らかとなった。ケニアでのコレラの流行で分離されたコレラ菌もエルトールバリアントであり、エルトールバリアントがアフリカ、ケニアでも広く流行に関わっていることが明らかとなった。
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Research Products
(54 results)
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[Journal Article] Peruvian Vibrio cholerae O1 El Tor strains possess a distinct region in the Vibrio seventh pandemic island-II that differentiates them from the prototype seventh pandemic El Tor strains.2009
Author(s)
S. Nusrin, A.I. Gil, N.A. Bhuiyan, A. Safa, M. Asakura, C.F. Lanata, E.R. Hall, H. Miranda, B. Huapaya, C. Vargos, M.A. Luna, D.A. Sack, S. Yamasaki, G.B. Nair
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Journal Title
J. Med. Microbiol 58
Pages: 342-354
Peer Reviewed
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[Journal Article] An inducible lambdoid prophage encoding Cytolethal Distending Toxin (CDT-I), and a Type III effector protein in enteropathogenic Escherichia coli.2007
Author(s)
M. Asakura, A. Hinenoya, M.S. Alam, K. Shima, S.H. Zahid, L. Shi, N. Sugimoto, A.N. Ghosh, T. Ramamurthy, S.M. Faruque, G.B. Nair, S. Yamasaki
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Journal Title
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104
Pages: 14483-14488
Peer Reviewed
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[Journal Article] A highly sensitive and specific multiplex PCR assay for simultaneous detection of Vibrio cholerae, Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus.
Author(s)
S.B. Neogi, N. Chowdhury, M. Asakura, A, Hinenoya, S. Haldar, S.M. Saidi, K. Kogure, R.J. Lara, S. Yamasaki
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Journal Title
Lett. Appl. Microbiol (in press)
Peer Reviewed
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[Presentation] 腸管感染症のメタゲノミック解析2009
Author(s)
中村昇太, 片岡千鐘, 井筒香織, 飯島義雄, 河合純, 林崎良英, 安永照雄, 堀井俊宏, 中屋隆明, 飯田哲也
Organizer
第43回腸炎ビブリオシンポジウム
Place of Presentation
岡山
Year and Date
20091100
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[Presentation] New variants of Vibrio cholerae O1 El Tor produce higher leveles of cholera toxin as compared to prototype El Tor strains.2009
Author(s)
J. Ghosh, M. Senoh, T. Hamabata, A.K. Mukhopadhyay, T. Ramamurthy, S. Chjatterjee, M. Asakura, S. Yamasaki, G.B. Nair, Y. Takeda
Organizer
13th International Conference on Emerging Infections Diseases in the Pacific Rim
Place of Presentation
Kolkata, India
Year and Date
20090406-20090409
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[Presentation] The Peruvian El Tor strains of Vibrio cholerae O1 have a distinct region in the Vibrio seventh pandemic island-II.2007
Author(s)
S. Nusrin, A.I. Gil, N.A. Bhuiyan, A. Safa, M. Asakura, C.F. Lanata, E. Hall, H. Miranda, B. Huapaya, C. Vargas G., M.A. Luna, D.A. Sack, S. Yamasaki, G.B. Nair
Organizer
42nd Joint Conference on cholera and other bacterial enteric infections panel
Place of Presentation
Austin, Texas, USA
Year and Date
20071205-20071207
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[Presentation] Vibrio fluvialis: an emerging pathogen in causing acute diarrhea in Kolkata, India.2007
Author(s)
G. Chowdhuray, E. Arakawa, M. Morita, H. Izumiya, G.P. Pazhani, M.K. Bhattacharya, P. Dutta, G.B. Nair, K. Okamoto, S. Shinoda, A.K. Mukhopadhyay, S. Yamasaki, H. Watanabe, R.K. Nady, Y. Takeda, S.K. Bhattacharya, T. Rammurthy
Organizer
VIBRIO 2007
Place of Presentation
Paris France
Year and Date
20071128-20071201
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[Remarks] S. Yamasaki:大阪大学大学院薬学研究科/大阪大学グローバルコラボレーションセンター主催、International Symposium on Cultivating Professionals in Health and Environment Risk Management「Infectious d iseases and their control in Asia」、March 17th, 2010、Osaka University, Osaka
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[Remarks] S. Yamasaki. The 4th Nagasaki Symposium on Tropical and Emerging Infectious Diseases,「Molecular Epidemiology of Vibrio cholerae」, Nov. 26th 2009, Nagasaki
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[Remarks] S. Yamasaki. International Symposium on fifty years of discovery of cholera toxin: A tribute to S.N. De,「Natural product can repress cholera toxin production by Vibrio cholerae」, Oct. 25th to 27th 2009, Kolkata, India
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[Remarks] S. Yamasaki. The 6th Annual Meeting Showa International Symposium for Life Sciences, Current Topics of Infectious Diseases in Japan and Asia「Molecular epidemiology of Vibrio cholerae and Campylobacters isolated in Asian countries」September 19th 2009, Showa University, Tokyo.
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[Remarks] S. Yamasaki. Prevalence of campylobacters and cytolethal distending toxin-producing Eshcerichia coli in diarrheal children in Japan. June 21st 2009, Guangzhou, China
