2008 Fiscal Year Final Research Report
Bioinformatics using non-metric multidimensional scaling method
| Project/Area Number |
19500254
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Bioinformatics/Life informatics
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| Research Institution | Chuo University |
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Principal Investigator |
TAGUCHI Yoshihiro Chuo University, 理工学部, 教授 (30206932)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
OYAMA Tokitaka 京都大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (30324396)
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| Project Period (FY) |
2007 – 2008
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| Keywords | 非計量多次元尺度構成法 / ゲノム科学 / マイクロアレイ / Barcode of Life / DNA copy number異状 / プロテオミクス / シアノバクテリア / 概日周期 |
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| Research Abstract |
近年、遺伝子に関する網羅的な実験結果が広く公開される様になってきた。本研究では数千個の遺伝子に対して行われた遺伝子発現、蛋白質発現、塩基配列、アミノ酸配列などのデータを非計量多次元尺度構成法を用いて解析して、遺伝子の機能などを解明する研究を行った。この結果、この様な様々なデータに対して、非計量多次元尺度構成法を用いた研究が非常に有効であることを確認した。
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[Remarks] 田口善弘, 非計量多次元尺度構成法とその生体生命情報解析への応用, 物性研究, 91, pp.137-143(2008)
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[Remarks] 伊庭幸人、末谷大道、青柳富誌生、田口善弘、小松崎民樹, 研究会報告「非線型科学と統計科学の対話」, 91, pp.113-174,(2008)
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[Remarks] 田口善弘、フロ桶はいついっぱいになる?、数学セミナー、9月号、pp.44-47,(2007)
