Comparative analysis of expression profiles of counterpart gene sets between Brassica rapa and Arabidopsis thaliana

2008 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19580053
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Plant pathology
• Research Institution: Research Institute for Biological Science Okayama
• Principal Investigator: NARUSAKA Yoshihiro Research Institute for Biological Science Okayama, 研究員 (20335459)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): ABE Hiroshi 理化学研究所, 実験植物開発室, 研究員 (90360479)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Keywords: 遺伝子 / シグナル伝達 / ストレス / マイクロアレイ / 比較ゲノム / アブラナ科 / ハクサイ / シロイヌナズナ

Research Abstract

モデル実験植物から農作物への技術移管のモデルケースを提案することを目的として、ゲノム配列が明かになっているシロイヌナズナとアブラナ科作物のハクサイについて遺伝子レベルでの比較解析を行った。ハクサイの遺伝子ライブラリーを作成して2000個以上のハクサイ遺伝子を得、これら遺伝子を用いてマイクロアレイを作製し、遺伝子発現解析を行った。その結果、両植物間で機能が類似する遺伝子の存在が示唆され、技術移管に向けた重要なデータが得られた。

Research Products

• [Journal Article] Gene coding for SigA-binding protein from Arabidopsis appears to be transcriptionally upregulated by salicylic acid and NPR1-dependent mechanisms (2008)
  • Author(s): Narusaka, M., Kawai, K., Izawa, N., Seki, M., Shinozaki, K., Seo, S., Kobayashi, M., Shiraishi, T., Narusaka, Y.
  • Journal Title: Journal of General Plant Pathology 74 Pages: 345-354
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Arabidopsis-thrips system for analysis of plant response to insect feeding (2008)
  • Author(s): Abe, H., Ohnishi, J., Narusaka, M., Seo, S., Narusaka, Y., Tsuda, S., Kobayashi, M.
  • Journal Title: Plant Signaling & Behavior 3(7) Pages: 1-2
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Function of jasmonate in response and tolerance of Arabidopsis to thrips feeding (2008)
  • Author(s): Abe, H., Ohnishi, J., Narusaka, M., Seo, S., Narusaka, Y., Tsuda, S., Kobayashi, M.
  • Journal Title: Plant Cell Physiol 49 Pages: 68-80
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] ハクサイ炭疽病および黒すす病に対するプラントアクティベーターの効果と影響 (2008)
  • Author(s): 鳴坂義弘, 鳴坂真理, 白石友紀, 河合清, 井沢典彦, 畠山勝徳, 安部洋, 小林正智
  • Journal Title: 日本農薬学会誌 33(2) Pages: 196-200
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] ハクサイにおけるアブラナ科野菜類炭疽病および黒すす病に対するプラントアクティベーターの効果の評価 (2008)
  • Author(s): 鳴坂義弘, 鳴坂真理, 白石友紀, 畠山勝徳, 安部洋, 小林正智
  • Journal Title: 岡山県生物科学総合研究所平成19年研究年報 Pages: 81-87
• [Journal Article] CERK1, a LysM receptor kinase, is essential for chitin elicitorsignaling in Arabidopsis (2007)
  • Author(s): Miya, A., Albert, P., Shinya, T., Desaki, Y., Ichimura, K., Shirasu, K., Narusaka, Y., Kawakami, N., Kaku, H., Shibuya, N.
  • Journal Title: Proc Natl Acad Sci USA 104 Pages: 19613-19618
  • Peer Reviewed
• [Presentation] モデル実験植物シロイヌナズナを用いた植物-昆虫間相互作用研究 (2009)
  • Author(s): 安部洋, 立石剣, 下田武志, 大西純, 釘宮聡一, 鳴坂真理, 瀬尾茂美, 今野浩太郎, 服部誠, 鳴坂義弘, 津田新哉, 小林正智
  • Organizer: 第53回日本応用動物昆虫学会大会
  • Place of Presentation: 北海道
  • Year and Date: 20090328-30
• [Presentation] シロイヌナズナゲノム情報を利用したハクサイcDNAリソース整備とデータベース開発 (2009)
  • Author(s): 小林正智, 佐々木一誠, 鳴坂真理, 畠山勝徳, 深海-小林薫, 鳴坂義弘, 安部洋
  • Organizer: 育種学会・作物学会合同講演会
  • Place of Presentation: つくば
  • Year and Date: 20090327-28
• [Presentation] 微小昆虫アザミウマの食害に対するシロイヌナズナの防御応答 (2009)
  • Author(s): 安部洋, 下田武志, 大西純, 釘宮聡一, 鳴坂真理, 瀬尾茂美, 鳴坂義弘, 津田新哉, 小林正智
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 20090321-24
• [Presentation] Analyses of Arabidopsis response to thrips feeding (2008)
  • Author(s): Hiroshi ABE, Jun OHNISHI, Mari NARUSAKA, Shigemi SEO, Takeshi SHIMODA, Sohichi KUGIMIYA, Yoshihiro NARUSAKA, Shinya TSUDA and Masatomo KOBAYASHI
  • Organizer: 19th International Conference on Arabidopsis Research
  • Place of Presentation: カナダ・モントリオール
  • Year and Date: 20080723-27
• [Presentation] モデル実験植物シロイヌナズナを用いた植物-昆虫間相互作用研究 (2008)
  • Author(s): 安部洋, 立石剣, 大西純, 鳴坂真理, 下田武志, 瀬尾茂美, 今野浩太郎, 服部誠, 鳴坂義弘, 津田新哉, 小林正智
  • Organizer: 日本応用動物昆虫学会
  • Place of Presentation: 宇都宮
  • Year and Date: 20080326-28
• [Presentation] ハイスループットスクリーニングシステムによる新規Plant activatorの探索 (2008)
  • Author(s): 宇野久仁子, 鳴坂真理, 平塚和之, 安部洋, 畠山勝徳, 白石友紀, 鳴坂義弘
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 20080320-22
• [Presentation] アブラナ科野菜類炭そ病菌に対するシロイヌナズナ抵抗性遺伝子の同定 (2008)
  • Author(s): 鳴坂真理, 白須賢, 井内聖, 宇野久仁子, 小林正智, 白石友紀, 鳴坂義弘
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 20080320-22
• [Presentation] モデル実験植物の知見を農作物へ!-プラントアクティベーターによる病害防除戦略- (2008)
  • Author(s): 鳴坂義弘
  • Organizer: 第10回RIBSバイオサイエンスシンポジウム「食糧・バイオマス生産性の飛躍的向上に向けて」
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 2008-10-31
• [Presentation] 作物研究に向けたシロイヌナズナからの発信の試み (2008)
  • Author(s): 小林正智, 安部洋, 鳴坂義弘, 田村卓郎, 太田聡史, 深海薫
  • Organizer: 日本育種学会平成20年度秋季講演会シンポジウム
  • Place of Presentation: 彦根
  • Year and Date: 2008-10-12
• [Presentation] アブラナ科作物ゲノムリソースおよびプラントアクティベーターを利用した新規病害防除法の開発 (2008)
  • Author(s): 鳴坂義弘
  • Organizer: 第29回日本植物病理学会関西地区若手の会
  • Place of Presentation: 和歌山
  • Year and Date: 2008-09-19
• [Presentation] ハクサイ-シロイヌナズナ間の比較ゲノム解析によるハクサイの病害防御機構解明の試み (2008)
  • Author(s): 鳴坂真理, 安部洋, 小林正智, 白石友紀, 鳴坂義弘
  • Organizer: 平成20年度日本植物病理学会関西部会
  • Place of Presentation: 和歌山
  • Year and Date: 2008-09-18
• [Presentation] ゲノムリソースと情報を農学分野で活用する (2008)
  • Author(s): 小林正智, 鳴坂真理, 鳴坂義弘, 安部洋
  • Organizer: 第26回日本植物細胞分子生物学会(大阪)大会
  • Place of Presentation: 大阪
  • Year and Date: 2008-09-02
• [Presentation] シロイヌナズナのゲノム情報を利用したアブラナ科作物の病害防御機構解明の試み (2008)
  • Author(s): 鳴坂義弘, 鳴坂真理, 安部洋, 小林正智, 畠山勝徳, 宇野久仁子, 白石友紀
  • Organizer: 平成20年度日本植物病理学会大会
  • Place of Presentation: 松江
  • Year and Date: 2008-04-28
• [Presentation] シロイヌナズナのゲノム情報を利用したハクサイcDNAの整備 (2008)
  • Author(s): 安部洋, 佐々木一誠, 鳴坂真理, 深海薫, 畠山勝徳, 鳴坂義弘, 小林正智
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会シンポジウム「モデル植物の"ゲノム"情報をどのように利用するか」
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2008-03-22
• [Presentation] シロイヌナズナのゲノム情報からアブラナ科作物の病害応答を診断する (2008)
  • Author(s): 鳴坂義弘, 鳴坂真理, 安部洋, 畠山勝徳, 宇野久仁子, 白石友紀, 小林正智
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会シンポジウム「モデル植物の"ゲノム"情報をどのように利用するか」
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2008-03-22
• [Presentation] 微小昆虫アザミウマの食害に対するシロイヌナズナの応答機構 (2008)
  • Author(s): 安部洋, 大西純, 鳴坂真理, 瀬尾茂美, 下田武志, 鳴坂義弘, 津田新哉, 小林正智
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2008-03-20
• [Presentation] フォーカスマイクロアレイを用いたプラントアクティベーターの評価と病害応答診断技術の開発 (2007)
  • Author(s): 鳴坂真理, 安部洋, 小林正智, 白石友紀, 鳴坂義弘
  • Organizer: 平成19年度日本植物病理学会関西部会
  • Place of Presentation: 岐阜
  • Year and Date: 20071006-07
• [Presentation] プラントアクティベーターを利用したハクサイに発生する病害の防除 (2007)
  • Author(s): 鳴坂義弘, 鳴坂真理, 安部洋, 小林正智, 畠山勝徳, 白石友紀
  • Organizer: 平成19年度日本植物病理学会関西部会
  • Place of Presentation: 岐阜
  • Year and Date: 20071006-07
• [Presentation] Analyses of plant response to thrips feeding using Arabidopsis system (2007)
  • Author(s): Hiroshi ABE, Jun Ohnishi, Mari NARUSAKA, Shigemi SEO, Yoshihito NARUSAKA, Shinya TSUDA, Masatomo KOBAYASHI
  • Organizer: 4^<th> Asia-Pacific Conference on Chemical Ecology (主催Asia-Pacific Association of Chemical)
  • Place of Presentation: 筑波
  • Year and Date: 20070910-14
• [Presentation] マイクロアレイを利用した高等植物の病害応答機構解明の試み (2007)
  • Author(s): 鳴坂義弘
  • Organizer: 第22回岡山植物病理セミナー
  • Place of Presentation: 岡山大学
  • Year and Date: 2007-12-08
• [Presentation] プラントアクティベーターを利用した環境負荷低減型病害防除法の開発 (2007)
  • Author(s): 鳴坂義弘
  • Organizer: 第9回RIBSバイオサイエンスシンポジウム「植物の病気を科学する-病原菌の感染戦略、植物の防御戦略、農業における病害防除戦略-」
  • Place of Presentation: 岡山
  • Year and Date: 2007-10-26
• [Remarks] 渋谷直人, 宮彩子, 賀来華江, 川上直人, Albert Premkumar, 新屋友規, 出崎能丈, 白須賢, 市村和也, 鳴坂義弘, 「植物の免疫受容体 カビ認識たん白確認」, 化学工業日報, 2007年12月3日掲載