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2008 Fiscal Year Final Research Report

Design and synthesis of histone tail polypeptide library

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 19710181
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Living organism molecular science
Research InstitutionTohoku University (2008)
The University of Tokyo (2007)

Principal Investigator

SAKAMOTO Seiji  Tohoku University, 多元物質科学研究所, 助教 (30335228)

Project Period (FY) 2007 – 2008
Keywords生体機能関連物質 / ポリペプチド / ライブラリ
Research Abstract

本研究では様々なアミノ酸側鎖翻訳後修飾を位置特異的に施したヒストンテールポリペプチドライブラリの構築を行った。さらに、構築したライブラリを用いて、代表的クロマチン関連因子由来のブロモドメインやクロモドメインとの相互作用を解析した。また、得られた情報に基づき、ヒストン認識ドメインや人工の刺激応答部位を複合化した分割型 GFPを設計し、任意のタンパク質翻訳後修飾反応や外部刺激を特異的に検出可能な蛍光プローブを構築することに成功した。

  • Research Products

    (28 results)

All 2009 2008 2007

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (17 results)

  • [Journal Article] Design of Photoactivable Split-GFP by Incorporation of A Photolabile Linker2009

    • Author(s)
      S. Sakamoto, Y. Araki, T. Wada
    • Journal Title

      Peptide Science 2008

      Pages: 487-490

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Resin-Bound Peptide Catalyzed Asymmetric Synthesis under Aqueous Conditions2009

    • Author(s)
      K. Akagawa, H. Akabane, T. Fujiwara, T. Yamashita, S. Sakamotro, K. Kudo
    • Journal Title

      Peptide Science 2008

      Pages: 529-530

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Asymmetric transfer hydrogenation in aqueous media catalyzed by resin-supported peptide having polyleucine tether2009

    • Author(s)
      K. Akagawa, H. Akabane, S. Sakamoto, K. Kudo
    • Journal Title

      Tetrahedron : Asymmetry 20

      Pages: 461-466

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cyclo[-His-His-] Derived C2-Symmetric Diketopiperazine as Chiral Ligand for Asymmetric Diels-Alder Reactions2009

    • Author(s)
      M. Furutani, S. Sakamoto, K. Kudo
    • Journal Title

      Heterocycles 78

      Pages: 1171-1176

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Supramolecular Control of Split-GFP Reassembly by Conjugation of β-Cyclodextrin and Coumarin Units2008

    • Author(s)
      S. Sakamoto, K. Kudo
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc 130

      Pages: 9574-9582

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Organocatalytic Asymmetric Transfer Hydrogenation in Aqueous Media using Resin-Supported Peptide having Polyleucine2008

    • Author(s)
      K. Akagawa, H. Akabane, S. Sakamoto, . Kudo
    • Journal Title

      Org. Lett 10

      Pages: 2035-2037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Glucose Responsive Two-step Release of Hydrogel-Immobilized Protein2008

    • Author(s)
      K. Murota, S. Sakamoto, K. Kudo
    • Journal Title

      Chem. Lett 37

      Pages: 582-583

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of β-Cyclodextrin and Fluorophore Conjugated Split-GFP Whose Reassembly Is Accelerated by the Addition of Hydrophobic Guest Molecules2008

    • Author(s)
      S. Sakamoto, K. Kudo
    • Journal Title

      Peptide Science 2007

      Pages: 455-458

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and Characterization of Split-GFP Whose Reassembly Is Accelerated by Phosphorylation2008

    • Author(s)
      M. Kasahara, S. Sakamoto, K. Kudo
    • Journal Title

      Peptide Science 2007

      Pages: 459-463

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reversible Immobilization of Protein into Hydrogel Using Designed Coiled-coil Peptides2007

    • Author(s)
      K. Murota, S. Sakamoto, K. Kudo
    • Journal Title

      Chem. Lett 36

      Pages: 1320-1321

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Orientation Control of Self-stacking D,L-Alternating Cyclic Octa-α-peptide through Multiple Electrostatic Interactions2007

    • Author(s)
      K. Murota, S. Sakamoto, K. Kudo
    • Journal Title

      Chem. Lett 36

      Pages: 1070-1071

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 外部刺激応答機能を持つ分割型 GFP 変異体を用いた高感度検出システムへの応用2009

    • Author(s)
      坂本清志, 寺内美香, 荒木保幸, 和田健彦
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      2009-03-29
  • [Presentation] 外部刺激応答型緑色蛍光タンパク質の合成と蛍光検出への応用2009

    • Author(s)
      寺内美香, 坂本清志, 荒木保幸, 和田健彦
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      2009-03-29
  • [Presentation] Cyvlo[His-His]型キラル配位子を用いた銅触媒不斉 Diels-Alder 反応2009

    • Author(s)
      古谷昌太, 坂本清志, 工藤一秋
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] 塩基部配向規制因子としてフェニルボロン酸を有するペプチドリボ核酸 (PRNA) の RNA 錯体形成解離の pH による制御2009

    • Author(s)
      遠藤絵梨子, 下司慶一郎, 坂本清志,荒木保幸, 井上佳久, 和田健彦
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] アルギニンおよびセリン含有 α-ペプチドリボ核酸の合成と DNA・RNA との相互作用2009

    • Author(s)
      小野寺恵子, 西尾明洋, 坂本清志, 荒木保幸, 井上佳久, 和田健彦
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] 固相担持プロリル触媒を用いた分子内 Baylis-Hillman 反応2009

    • Author(s)
      赤川賢吾, 坂本清志, 工藤一秋
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] レーザー励起による DNA-カチオン性ポルフィリン複合体の時間分解円二色性2009

    • Author(s)
      村上憤, 荒木保幸, 坂本清志, 和田健彦
    • Organizer
      日本化学会第89春季年会
    • Place of Presentation
      船橋
    • Year and Date
      2009-03-28
  • [Presentation] 外部刺激による緑色蛍光タンパク質の機能制御2008

    • Author(s)
      坂本清志
    • Organizer
      第11回生命化学研究会
    • Place of Presentation
      水上
    • Year and Date
      2008-11-28
  • [Presentation] 光によって活性化される分割型緑色蛍光タンパク質の設計2008

    • Author(s)
      坂本清志, 荒木保幸, 和田健彦
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-10-29
  • [Presentation] 樹脂固定化ペプチドを用いる水系溶媒中での触媒的不斉合成2008

    • Author(s)
      赤川賢吾, 赤羽 創, 藤原巧真, 山下拓大, 坂本清志, 工藤一秋
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-10-29
  • [Presentation] 外部刺激応答機能を持つ分割型緑色蛍光タンパク質変異体の設計2008

    • Author(s)
      坂本清志, 和田健彦
    • Organizer
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2008-09-18
  • [Presentation] β-シクロデキストリンと蛍光色素を複合化したGFP変異体の設計と半合成2008

    • Author(s)
      坂本清志, 工藤一秋
    • Organizer
      日本化学会第88春季年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-03-28
  • [Presentation] Construction of β-Cyclodextrin and Fluorophore Conjugated Split-GFP Whose Reassembly Is Accelerated by the Addition of Hydrophobic Guest Molecules2007

    • Author(s)
      坂本清志, 工藤一秋
    • Organizer
      第44回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2007-11-08
  • [Presentation] Design and Characterization of Split-GFP Whose Reassembly Is Accelerated by Phosphorylation2007

    • Author(s)
      笠原睦美, 坂本清志, 工藤一秋
    • Organizer
      第44回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2007-11-08
  • [Presentation] シクロデキストリン複合化緑色蛍光タンパク質の設計2007

    • Author(s)
      坂本清志, 工藤一秋,
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学シンポジウム・若手フォーラム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-09-30
  • [Presentation] β-シクロデキストリンと蛍光色素を複合化した分割型GFP変異体の構築2007

    • Author(s)
      坂本清志, 工藤一秋
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-09-30
  • [Presentation] タンパク質翻訳後修飾反応の検出を指向した分割型GFP変異体の構築2007

    • Author(s)
      笠原睦美, 坂本清志, 工藤一秋
    • Organizer
      第22回生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-09-29

URL: 

Published: 2010-06-10   Modified: 2016-04-21  

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