2020 Fiscal Year Research-status Report
HIV-1Vif/HDAC3複合体によるHIV-1潜伏感染転写ネットワークの制御
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19K07591
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
白川 康太郎 京都大学, 医学研究科, 助教 (80728270)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | HIV-1 / 潜伏感染 / CAGE法 / トランスクリプトーム / CRISPRスクリーニング |
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| Outline of Annual Research Achievements |
HIVGKOを感染させたJurkatT細胞モデルを用いて潜伏感染細胞の遺伝子発現プロファイルをCAGE法により解析した。非感染細胞に比較して潜伏感染細胞で31種の遺伝子発現の低下を同定したが、遺伝子発現が増加した遺伝子は認めなかった。これらの遺伝子のうち非感染細胞でSPP1とAPOEが増加していたことは、そのノックダウンにより感染細胞が低下することから、これらの遺伝子発現がHIV-1感染に抑制性に機能していることを示唆している。さらに潜伏感染細胞とウイルス産生性感染細胞でmTOR経路の遺伝子群の発現に差があることに注目し、mTOR経路の発現が低い細胞で潜伏感染が多いことを発見した。以上の知見より感染する細胞の遺伝子発現の状態が、ウイルス感染が起こるかどうか、さらにウイルスのインテグレーション後にウイルス産生につながるか、転写が停止し潜伏感染の状態に陥るかに影響していると考えられた。
またこの潜伏感染細胞モデルを用いてCRISPRスクリーニングを行い、潜伏感染の再活性化に関わる遺伝子群を同定した。これらの遺伝子をCRISPRで予めノックアウトするとウイルス再活性化が起こりやすいことを発見した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
予定した潜伏感染細胞で特異的に遺伝子発現の変化があった遺伝子の機能について解明し報告した（Matsui et al., Journal of Virology, 95, 8, e02394-20, 2021）。CRISPRスクリーニングを実施し、ノックアウトすると潜伏感染再活性化をおこす遺伝子を６種類、同定し解析をつづけているため。
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| Strategy for Future Research Activity |
引き続きCRISPRスクリーニングで同定した遺伝子群の機能解析を行う。
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| Causes of Carryover |
他の研究費から試薬代などを賄えたため。次年度の試薬代に用います。
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Research Products
(3 results)
