Identification of therapeutic targets for childhood leukemia based on in vitro drug sensitivity

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 19K08318
• Research Institution: Hamamatsu University School of Medicine
• Principal Investigator: 坂口 公祥 浜松医科大学, 医学部附属病院, 講師 (00402280)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 薬剤反応性 / 白血病 / 遺伝子 / 次世代シークエンサー

Outline of Annual Research Achievements

白血病細胞株9種類と21例の患者由来の白血病細胞から抽出したmRNAを用いたトランスクリプトーム解析の結果は令和2年度までに得られており、これらを統合して解析することを目指した。
解析の中で白血病細胞株と患者由来白血病細胞とは別に解析を行った。患者由来白血病細胞株ではある抗悪性腫瘍薬に対して発現量に有意差を認めた遺伝子が認められたが、これはCD10など白血病の特徴自体に由来する遺伝子のみであり、抗悪性腫瘍薬の代謝経路やアポトーシスのシグナル伝達経路などに影響を与えるような遺伝子の発現量変化ではなかった。
このように抗悪性腫瘍薬の代謝経路やアポトーシスのシグナル伝達経路などに影響を与えるような遺伝子の発現量変化が全く得られなかったことは当初の想定外であり、計画の大幅な変更を余儀なくされることとなった。
したがって、さらに別の角度からの解析を行うことを検討していたが、コロナ禍において診療や管理業務に対するエフォートが非常に大きくなってしまい、本研究に対して十分な時間を割くことができなかった。このことが当初予想していた計画と大きく異なる点であった。
解析に十分な時間を割けるようにするため、研究期間を1年間延長することで、さらなる解析を行えるよう対応している。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

令和3年度はこれまで得られた結果をもとに、十分な解析を行って結果を報告する予定であった。しかし、トランスクリプトーム解析の結果に不十分なものがあったことと、診療や管理業務に対するエフォートが大きくなってしまい、本研究に対して十分な時間を割くことができなかったことから、十分な解析を行うことができなかった。
このため、研究成果の報告を行うこともできなかった。

Strategy for Future Research Activity

1年間研究期間を延長したので、前年度までに得られたデータの解析を進めていく。具体的な方針としては、分子標的薬の薬剤感受性試験結果にこだわらず、他の薬剤も含めて、薬剤感受性に影響を与える可能性のある遺伝子の発現量解析もとに検討を行っていく。
解析結果が得られれば、考察をおこなって結果報告につなげていく。

Causes of Carryover

2021年度は成果の発表を行うには時期尚早であり、また新型コロナウイルス感染症のまん延防止のために出張による学会活動がなく、旅費の請求を行わなかった。
すでに研究室で所有していた消耗品を使用したため、消耗品の購入も要しなかった。
主な支出は解析用機器の購入のために用いた。
コロナ禍で十分な研究活動を行うことができなかったこともあり、これまでに交付された助成金を合わせ、2022年度に改めて追加解析を行うことが可能な体制をとした方が有益と判断した。