2020 Fiscal Year Research-status Report
Elucidation of the mechanism of non-alcoholic steatohepatitis focusing on the metabolic zonation in the liver.
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19K17496
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
田中 正剛 九州大学, 生体防御医学研究所, 助教 (20837265)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 非アルコール性脂肪肝炎 / NASH / 低酸素 / hypoxia inducible factor / zonation |
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| Outline of Annual Research Achievements |
非アルコール性脂肪肝炎(NASH)は肝脂肪化を基盤として、炎症・線維化が起きる病態であるが、その発症機序は解明されていない。NASHの肝脂肪化は中心静脈周囲に起き、また特徴的な線維化の一つに中心静脈周囲線維化が挙げられることから、NASHにおける肝脂肪化から炎症・線維化へと進展する根源的な病理変化は中心静脈周囲(zone 3)の生物学的特性に強く関連していると考えられる。そこでNASHモデルマウスの肝臓をzone別にサンプリングし、網羅的遺伝子発現解析を行う実験を計画した。
MC4R欠損マウスに高脂肪食を20週間給餌しNASHモデルを作製し、組織学的に低酸素を評価するため、肝臓をサンプリングする1時間前にpimonidazole HClを60mg/kg腹腔内投与を行った。凍結切片を用いて免疫組織化学を行い、zone 3の肝実質が低酸素となっていることが確認できた。この所見は予備的検討においてzone 3肝実質でHIF2-alphaの発現が亢進していたことと一致していた。次に、未固定凍結切片を用いてレーザーマイクロダイセクションによりzone別にサンプリングを行った。当初、抽出したRNAの品質を評価する指標であるRINが3前後と不十分な結果であり、肝臓に内在する豊富なRNaseが原因と考えられた。薄切後の切片にRNAlaterを滴下することにより、RNase活性を抑制し、氷上で染色するプロトコールを考案し、RNA-seqに要求される品質のRNAを得ることができた。得られたRNAは微量であったが、RNA-seqのライブラリ作製方法を複数回修正することにより、RNA-seqを行うことがで、現在RNA-seqで得られたデータの解析を行っている。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
昨年度、レーザーマイクロダイセクションによりzoneごとにサンプリングを行い、抽出したRNAからライブラリ作製を行いRNA-seqを行った。しかし、サンプルごとのリード数のばらつきが大きかったため、再度ライブラリ作製のプロトコールの修正を行なう必要があった。また、新型コロナウイルスの流行により研究活動が制限された期間があり、今年度は新たに作成したライブラリを用いてRNA-seqを行うところまでしか研究計画が進まなかった。現在、RNA-seqで得られたデータの解析を行っている。
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| Strategy for Future Research Activity |
RNA-seqのデータを解析し、各zoneに特異的に発現している遺伝子 (zone特異的遺伝子) とNASHモデルマウスにおいて発現変化を認める遺伝子 (NASH関連遺伝子) を同定する。これらの遺伝子の内、肝細胞表面に発現しているタンパクをコードするものをピックアップし、これらのタンパクに対する一次抗体を用いてfluorescence-activated cell sorting (FACS) により初代肝細胞をzone毎に分離する。
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| Causes of Carryover |
次年度に免疫組織化学やFACSのための一次抗体を購入する必要があるため、次年度使用とした。
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