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2020 Fiscal Year Research-status Report

Analysis of specific interactions among influenza A virus genomic RNAs

Research Project

Project/Area Number 19K22529
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

野田 岳志  京都大学, ウイルス・再生医科学研究所, 教授 (00422410)

Project Period (FY) 2019-06-28 – 2022-03-31
Keywordsインフルエンザウイルス / ゲノムパッケージング
Outline of Annual Research Achievements

インフルエンザウイルスのゲノムRNAは8分節に分かれている。各RNA分節はウイルス核タンパク質およびRNAポリメラーゼと結合し、リボ核酸タンパク質複合体(RNP複合体)として存在する。感染細胞で形成される子孫ウイルス粒子が増殖能を持つためには、8種類のRNA分節を全て取り込まなければならない。しかし何本のRNA分節がどのように子孫ウイルス粒子内に取り込まれるかという”ゲノムパッケージング機構”は、ウイルス学の古典的命題として半世紀以上も謎のままだった。申請者はこれまでに、8種類のRNP複合体が規則的な配置(「1+7」構造)をとって取り込まれることを明らかにした。そこで本研究では、ウイルスゲノムRNAを介したRNP複合体間相互作用の立証とその分子基盤の解明を目指した。これまでに、in vitro RNA合成系を用いて8種類のvRNAおよび各vRNAの3'端および5'端のRNAを合成し、gel shift assayを用いてvRNA-vRNA間相互作用の解析を実施した。その結果、in vitroにおいて、8種類のvRNAがそれぞれ複数のvRNAと相互作用しネットワークを形成していること、多くの相互作用がゲノムパッケージングシグナル間で認められることを明らかにした。本年度はin vivoにおいてパッケージングシグナル間の相互作用が存在するかどうかを解析した。HA分節のパッケージングシグナルに変異を導入したウイルスを作出し、減弱したゲノムパッケージング効率を回復させる変異を解析したところ、PB2分節のパッケージングシグナルに変異が導入されていることを見出した。すなわち、NPやポリメラーゼが結合したvRNPの状態においても相互作用が存在する可能性を示した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

これまでに、in vitro RNA合成系を用いて8種類のvRNAがそれぞれ複数のvRNAと相互作用しネットワークを形成していること、多くの相互作用がゲノムパッケージングシグナル間で認められることを明らかにした。また、実際のウイルス感染細胞において、すなわちNPやポリメラーゼが結合したRNPの状態でも2つのRNA分節間に相互作用が存在しうることを見出した。

Strategy for Future Research Activity

RNPにおける分節間RNA-RNA相互作用を明らかにするため、ウイルス粒子内RNPをソラレンで架橋して解析を進める。

  • Research Products

    (2 results)

All 2021 2020

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results)

  • [Journal Article] Selective Genome Packaging Mechanisms of Influenza A Viruses.2021

    • Author(s)
      Noda T
    • Journal Title

      Cold Spring Harb Perspect Med.

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.1101/cshperspect.a038497.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Influenza A virus NS1 optimises virus infectivity by enhancing genome packaging in a dsRNA-binding dependent manner.2020

    • Author(s)
      Sha TW, Weber M, Kasumba DM, Noda T, Nakano M, Kato H, Fujita T.
    • Journal Title

      Virol J

      Volume: 17 Pages: 107

    • DOI

      10.1186/s12985-020-01357-3.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-12-27  

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