2020 Fiscal Year Research-status Report
Identification of virulence factors of Mycobacterium ulcerans for the transmission from natural environments to humans
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19KK0217
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| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
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Principal Investigator |
鈴木 敏彦 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 教授 (10292848)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
星野 仁彦 国立感染症研究所, ハンセン病研究センター 感染制御部, 室長 (20569694)
吉田 光範 国立感染症研究所, ハンセン病研究センター 感染制御部, 主任研究官 (70772630)
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| Project Period (FY) |
2019-10-07 – 2022-03-31
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| Keywords | ブルーリ潰瘍 / 比較ゲノム解析 / 感染伝播 / 西アフリカ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
ブルーリ潰瘍はMycobacterium ulceransの感染が原因であり、また河川の流域に流行地域が集中することから主に水系環境が原因でヒト皮膚に感染すると考えら れている。しかし、自然界におけるリザーバーの有無、感染伝播の様式、感染によって生じる皮膚潰瘍の病態機序は現在でも謎に包まれている。M. ulcerans の 検出には、本菌に特異的とされる挿入配列を指標としてPCRによって検出する方法がよく用いられているが、実際に本菌由来のDNA断片が検出されているのか検証 されていない。そこで本研究では、検出される環境中の全てのM. ulceransがブルーリ潰瘍の起因菌となるのではなく、「病原因子」を有する一部の集団が感染 症の原因となるのでは?という新たな仮説を提出する。これを検証することにより、自然界におけるM. ulceransの生態とヒトへの感染経路の一端を解明する。 2020年度には、ブルーリ潰瘍原因菌の遺伝情報が不足しているため、所有している菌株のshort read sequencingあるいはlong read sequencingを行い、比較ゲノム解析を行うことで、次年度以降に行われるアフリカでの臨床分離株や環境分離株の遺伝情報に対するreference作成を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
2020年2月より渡航の自粛と3月からの国境封鎖および国際便の運行停止が約半年間続いた。その後国境と国際便は再開したが、日本からの渡航が依然厳しい状態にある。このため所有している菌株のゲノム解析を進めてきた。
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| Strategy for Future Research Activity |
外務省から発出される海外渡航状況ではほとんどの国がレベル3（渡航中止勧告）となっており、ガーナへの渡航は依然厳しい。しかし学内の調整と野口研との交渉により、次年度に現地調査に入ることとなった。今後は環境サンプルの採取が進められると期待される。
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| Causes of Carryover |
現地への渡航ができなかったため、最終年度に渡航費を繰り越した。
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[Journal Article] Virulence profile of diarrhoeagenic Escherichia coli from the Western region of Ghana. Japanese journal of infectious diseases.2021
Author(s)
Prah I, Ayibieke A, Nguyen TTH, Iguchi A, Mahazu S, Sato W, Hayashi T, Yamaoka S, Suzuki T, Iwanaga S, Ablordey A, Saito R
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Journal Title
Jpn J Infect Dis
Volume: 74
Pages: 115-121
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Case Report of Bursitis,Bacteremia,and Disseminated Infection of Mycobacteroides (Mycobacterium) abscessus subsp.massiliense.2021
Author(s)
Oka K, Morioka H, Asakura T, Sato Y, Tetsuka N, Iguchi M, Kanematsu T, Fukano H, Hoshino Y, Kiyoi H,Yagi T.
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Journal Title
Intern Med
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Pancreatic glycoprotein 2 is a first line of defense for mucosal protection in intestinal inflammation.2021
Author(s)
Kurashima Y, Kigoshi T, Murasaki S, Arai F, Shimada K, Seki N, Kim YG, Hase K, Ohno H, Kawano K, Ashida H, Suzuki T, Morimoto M, Saito Y, Sasou A, Goda Y, Yuki Y, Inagaki Y, Iijima H, Suda W, Hattori M, Kiyono H.
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Journal Title
Nat Comm
Volume: 12
Pages: 1067
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] A bacterial small RNA regulates the adaptation of Helicobacter pylori to the host environment.2021
Author(s)
Kinoshita-Daitoku R, Kiga, K, Miyakoshi M, Otsubo R, Ogura Y, Sanada T, Bo Z, Phuoc TV, Okano T, Iida T, Yokomori R, Kuroda E, Hirukawa S, Tanaka M, Sood A, Subsomwong P, Ashida H, Binh TT, Nguen LT, Van KV, Ho VDQ, Nakai K, Suzuki T, Yamaoka Y, Hayashi T, Mimuro H.
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Journal Title
Nat Comm
Volume: -
Pages: -
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Prevalence and characterization of carbapenem-hydrolyzing class D β-lactamase-producing Acinetobacter isolates from Ghana.2020
Author(s)
Ayibieke A, Kobayashi A, Suzuki M, Sato W, Mahazu S, Prah I, Mizoguchi M, Moriya K, Hayashi T, Suzuki T, Iwanaga S, Ablordey A, Saito R
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Journal Title
Front Microbiol
Volume: 11
Pages: 587398
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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