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2009 Fiscal Year Annual Research Report

生命現象の解明に資する革新的高速AFMの開発

Research Project

Project/Area Number 20221006
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

安藤 敏夫  Kanazawa University, 数物科学系, 教授 (50184320)

Keywords原子間力顕微鏡 / AFM / 高速AFM / タンパク質 / 細胞 / 細胞表面 / 細胞内構造 / ダイナミクス
Research Abstract

我々は世界に先駆けて高速原子間力顕微鏡(高速AFM)を開発し、それを用いてタンパク質分子が示すナノメータスケールの動的挙動を撮影することに成功している。そのイメージングにより、いくつかの試料系の機能メカニズムの解明にも成功している。しかし、走査範囲は分子の観察には問題ないが、細胞の観察には狭すぎる。生きた細胞表面は極めて柔らかく、探針との接触で大きく変形するため、そこで起こる分子プロセスを観察することはできない。また、細胞内部を観察することができない。本研究では、我々が開発してきた高速AFM技術を更に発展させ、現在困難なこれらの観察を実現することを目指す。2年度目である今年度は、広範囲走査を可能にするプローブ走査型AFMと蛍光顕微鏡一体型の高速AFM製作に必要な要素技術を開発するとともに、新規な観察を可能にする技術の原理的な探索を去年度に引き続き進めた。
1.プローブ走査型で必要なカンチレバートラッキングを高速に行える方法を見出すことに成功した。また、広域スキャナーの振動ダンピングの技術を開発した。これら技術を組み込んだ蛍光顕微鏡一体型の高速AFMの設計を進め部分的な試作を済ませた。
2.超音波を利用した接触の検出:超音波の非線形干渉を利用した方法では非接触条件を見出せていない。超音波の周波数を上げるために、ピエゾ素子の検討、及び、レーザドップラ振動計測法の導入を検討した。
3.超音波を利用した表面下構造の検出:表面下に構造をもつ標準試料の作成法をいくつか検討した。超音波の非線形干渉による表面下構造の観察は大気中ではうまくいくが、水中ではカンチレバーがほとんど励振されず困難であることが分かった。試料ステージ側からの超音波でカンチレバーを励振させる方法では水中でも表面下構造が観察できたように思われる。だが、十分な再現性が未だ得られていない。表面の構造が平滑でないと表面下の構造を観察しているのか明確にならないという問題があり、理想に近い標準試料の作成をいくつか検討した。

  • Research Products

    (64 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (52 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] High-speed atomic force microscopy shows dynamic molecular processes in photo-activated bacteriorhodopsin2010

    • Author(s)
      M.Shibata, H.Yamashita, T.Uchihashi, H.Kandori, T.Ando
    • Journal Title

      Nature Nanotechnology 5

      Pages: 208-212

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] AAA+ chaperone ClpX regurates dynamics of prokaryotic cytoskeletal protein FtsZ2010

    • Author(s)
      S.Sugimoto, K.Yamanaka, S.Nishikori, A.Miyagi, T.Ando, T.Ogura
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 285

      Pages: 6648-6657

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Surface topography of membrane domains2010

    • Author(s)
      M.-C.Giocondi, D.Yamamoto, E.Lesniewska, P.-E.Milhiet, T.Ando, C.Le Grimellec
    • Journal Title

      Biochim.Biophys.Acta.-Biomembranes 1978

      Pages: 703-718

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 生体分子の動的プロセスを直接可視化する高速AFM2010

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Journal Title

      顕微鏡 45

      Pages: 22-30

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamics of bacteriorhodopsin 2D crystal observed by high-speed atomic force microscopy2009

    • Author(s)
      H.Yamashita, K.Voitchovsky, T.Uchihashi, S.Antoranz Contera, J.F.Ryan, T.Ando
    • Journal Title

      J.Struct.Biol. 167

      Pages: 153-158

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] High-resolution high-speed contact mode atomic force microscopy movies of purple membrane2009

    • Author(s)
      I.Casuso, N.Kodera, C.Le Grimellec, T.Ando, S.Scheuring
    • Journal Title

      Biophys J 97

      Pages: 1354-1361

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Streptavidin 2D crystal substrates for visualizing biomolecular processes by atomic force microscopy2009

    • Author(s)
      D.Yamamoto, N.Nagura, S.Omote, M.Taniguchi, T.Ando
    • Journal Title

      Biophys.J. 97

      Pages: 2358-2367

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-molecule imaging of a micro-Brownian motion of a chiral helical π-conjugated polymer as a molecular spring driven by thermal fluctuations2009

    • Author(s)
      K.Shinohara, N.Kodera, T.Ando
    • Journal Title

      Chem Lett. 38

      Pages: 690-691

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ビデオレート高速バイオ原子間力顕微鏡2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Journal Title

      真空 51

      Pages: 783-788

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 生命科学に資する高速原子間力顕微鏡2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Journal Title

      バイオインダストリー 26

      Pages: 21-30

  • [Presentation] バクテリオロドプシンの高速AFM観察 : バクテリオロドプシンの直接観察から何がわかるか、何をもたらすか2010

    • Author(s)
      柴田幹大, 山下隼人, 内橋貴之, 神取秀樹, 安藤敏夫
    • Organizer
      分子研研究会 拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか""何をもたらすか"
    • Place of Presentation
      分子科学研究所、愛知
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] 高速原子間力顕微鏡によるロドプシンの動態観察2010

    • Author(s)
      山下隼人, 柴田幹大, 内橋貴之, 古谷祐詞, 山下高廣, 神取秀樹, 七田芳則, 安藤敏夫
    • Organizer
      分子研研究会 拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか""何をもたらすか"
    • Place of Presentation
      分子科学研究所、愛知
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] Walking myosin V visualized by high-speed AFM2010

    • Author(s)
      安藤敏夫, 古寺哲幸, 山本哲朗
    • Organizer
      Alpbach Workshop on Muscle, Myosin, and Molecular Motors 2010
    • Place of Presentation
      Alpbach, Austria
    • Year and Date
      20100320-20100325
  • [Presentation] Direct visualization of photo-activated bacteriorhodopsin by high-speed atomic force microscopy2010

    • Author(s)
      柴田幹大, 山下隼人, 内橋貴之, 神取秀樹, 安藤敏夫
    • Organizer
      Biophysical Society 54th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      San Francisco, USA
    • Year and Date
      20100220-20100224
  • [Presentation] Walking mechanism of myosin V revealed by high-speed AFM imaging2010

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      XII Linz Winter Workshop
    • Place of Presentation
      Linz, Austria
    • Year and Date
      20100205-20100208
  • [Presentation] 高速AFMによって明らかになったアクトミオシンVの運動メカニズム2010

    • Author(s)
      古寺哲幸, 山本大輔, 安藤敏夫
    • Organizer
      生体運動研究合同班会議
    • Place of Presentation
      東京・中央大学理工学部
    • Year and Date
      20100109-20100111
  • [Presentation] 特別講演「ナノメータスケールの動的プロセスを可視化する高速AFM」2010

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      電気化学会第77回大会 シンポジウム「ナノスケール界面・表面の構造とダイナミクス」
    • Place of Presentation
      富山・富山大学
    • Year and Date
      2010-03-29
  • [Presentation] タンパク質の天然変性領域の高速AFM観察と今後の展望2010

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      新学術領域研究「天然変性蛋白質」第1回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      神奈川・理化学研究所横浜研究所
    • Year and Date
      2010-01-19
  • [Presentation] タンパク質のナノダイナミクス高速撮影装置の開発2010

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      生命現象解明のための計測分析 さきがけ・CREST研究報告会
    • Place of Presentation
      東京品川、コクヨホール
    • Year and Date
      2010-01-13
  • [Presentation] Instrumentation of high-speed AFM and dynamic imaging of motor protein myosin V2010

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      Seminar at University of Nebraska Medical Center
    • Place of Presentation
      Omaha, USA
    • Year and Date
      2010-01-08
  • [Presentation] Direct watching of bacteriorhodopsin structural response to photo-activation2009

    • Author(s)
      柴田幹大, 山下隼人, 内橋貴之, 神取秀樹, 安藤敏夫
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Walking mechanism of myosin V dissected by high-resolution dynamic imaging2009

    • Author(s)
      古寺哲幸, 山下隼人, 安藤敏夫
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] High-resolution dynamic imaging of chaperonin GroEL-GroES reaction2009

    • Author(s)
      山下隼人, 谷口雅昭, 安藤敏夫
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Tapping-force reduction based on parametric excitation for high-speed AFM2009

    • Author(s)
      T.Yamamoto, T.Uchiahshi, T.Ando
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Solution dynamics analysis of budding yeast chhesin complex by fast scanning AFM2009

    • Author(s)
      T.Nishino, A.Miyagi, T.Ando, K.Morikawa, K.Nasmyth
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Single-molecule analysis of dynamics of bactrial cytoskeletal proteins FtsZ by high-speed AFM2009

    • Author(s)
      S.Sugimoto, A.Miyagi, T.Ando, T.Ogura
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Nano-dissection of Chlamydomonas Dynein-c by high-speed AFM2009

    • Author(s)
      D.Yamamoto, A.Miyagi, K.Oiwa, T.Ando, H.Sakakibara
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Myosin V motor activity depending on the number of calmodulin2009

    • Author(s)
      小山ゆり, 小出博史, 田中慎一郎, 表冴子, 安藤敏夫
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Development of stand-alone- type high-speed AFM for cell imaging2009

    • Author(s)
      岡崎康孝, 内橋貴之, 安藤敏夫
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Direct observation of GroEL-substrate complexes by high-sped atomic force microscopy2009

    • Author(s)
      谷口雅昭, 山本大輔, 古寺哲幸, 安藤敏夫
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Direct observation of membrane protein dynamics by high-sped AFM2009

    • Author(s)
      H.Yamashita, M.Shibata, K.Voitchovsky, T.Uchihashi, Y.Furutani, S.Antranz Contera, J.F.Ryan, H.Kandori, T.Ando
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Visualization of subsurface structures by high-speed ultrasonic force microscopy2009

    • Author(s)
      渡辺大輝, 内橋貴之, 安藤敏夫
    • Organizer
      Symposium on Watching Biomolecules in Action
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Year and Date
      20091215-20091217
  • [Presentation] Keynote Speech "High-speed AFM for dynamic visualization of biomolecular processes"2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      Workshop on dynamics and control of micro and nanoscale systems
    • Place of Presentation
      IBM Research Institute, Zurich, Ruschlikon, Switzerland
    • Year and Date
      20091210-20091211
  • [Presentation] Structural characterization of dynein-c by high-speed AFM2009

    • Author(s)
      D.Yamamoto, A.Miyagi, K.Oiwa, T.Ando, H.Sakakibara
    • Organizer
      International Workshop Dynein 2009
    • Place of Presentation
      Kobe, Japan
    • Year and Date
      20091101-20091105
  • [Presentation] High-speed atomic force microscopy visualization reveals dynamic molecular processes in photo-activated bacteriorhodopsin2009

    • Author(s)
      柴田幹大, 山下隼人, 内橋貴之, 神取秀樹, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会(若手招待講演)
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] ストレプトアビジン二次元結晶基板の高速AFM観察への適用2009

    • Author(s)
      山本大輔, 名倉直希, 表冴子, 谷口雅昭, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] 高速AFMによるクラミドモナス ダイニンC破壊過程の観察2009

    • Author(s)
      山本大輔, 宮城篤, 安藤敏夫, 榊原斉
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] 細胞観察用 tip-scan 型高速原子間力顕微鏡の開発2009

    • Author(s)
      岡崎康孝, 内橋貴之, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] ミオシンVのカルシウム調節2009

    • Author(s)
      小山ゆり, 小出博史, 田中慎一郎, 表冴子, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] アクトミオシンIIの高速AFM観察2009

    • Author(s)
      今井将之, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] 高速原子間力顕微鏡(AFM)を用いたバクテリオロドプシンの光励起に伴う動態観察2009

    • Author(s)
      柴田幹大, 山下隼人, 内橋貴之, 神取秀樹, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] 高速原子間力顕微鏡による探針試料間の相互作用の検出感度の向上2009

    • Author(s)
      吉田正人, 内橋貴之, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] 超音波高速原子間力顕微鏡による表面下構造のイメージング2009

    • Author(s)
      渡辺大輝, 内橋貴之, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] パラメトリック共振モード高速AFMを用いた低侵襲性生体分子イメージング2009

    • Author(s)
      山本哲朗, 内橋貴之, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] 高速原子間力顕微鏡によるATP加水分解反応中のp97の動態観察2009

    • Author(s)
      宮川直也, 山本愛輔, 小椋光, 錦織信吾, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] 高速原子間力顕微鏡によるロドプシンの動態観察2009

    • Author(s)
      山下隼人, 柴田幹大, 内橋貴之, 古谷祐詞, 山下高廣, 神取秀樹, 七田芳則, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] 高速AFMによるGroEL-基質タンパク質複合体の直接観察2009

    • Author(s)
      谷口雅昭, 山本大輔, 古寺哲幸, 安藤敏夫
    • Organizer
      日本生物物理学会第47回年会
    • Place of Presentation
      徳島・アスティ徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Direct visualization of protein dynamics using high-speed AFM2009

    • Author(s)
      内橋貴之, 安藤敏夫
    • Organizer
      International Symposium on Innovative Nanoscience of Supramolecular Motor Proteins Working in Biomembranes
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      20090908-20090910
  • [Presentation] バクテリオロドプシンの光励起に伴う姿を高速原子間力顕微鏡(AFM)で捉える2009

    • Author(s)
      柴田幹大, 山下隼人, 内橋貴之, 神取秀樹, 安藤敏夫
    • Organizer
      生理学研究所 研究会「作動中の膜機能分子の姿を捉える -静止画から動画へ-」
    • Place of Presentation
      愛知・岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      20090903-20090904
  • [Presentation] High-speed atomic force microscopy and direct visualization of biomolecular processes2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      5^<th> International Symposium on Scanning Probe Spectroscopy and Related Methods
    • Place of Presentation
      Poznan(Wasowo), Poland
    • Year and Date
      20090719-20090722
  • [Presentation] Direct visualization of biomolecular processes by high-speed atomic force microscopy2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      4^<th> Asian and Pacific Rim Symposium on Biophotonics
    • Place of Presentation
      Jeju, South Korea
    • Year and Date
      20090527-20090529
  • [Presentation] 高速AFMによる蛋白質天然変性領域の観察2009

    • Author(s)
      宮城篤, 津中康央, 内橋貴之, 真柳浩太, 広瀬進, 西野達也, 安藤敏夫, 森川耿右
    • Organizer
      第9回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      熊本・熊本全日空ホテルニュースカイ
    • Year and Date
      20090520-20090522
  • [Presentation] 基調講演「高速AFMの現状と将来展望」2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      (株)生体分子計測研究所 創立10周年記念「高速(動画)AFMシンポジウム」
    • Place of Presentation
      東京・浅草ビューホテル
    • Year and Date
      2009-12-20
  • [Presentation] High-speed AFM for dynamic visualization of biomolecular processes2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      The American Society for Cell Biology 49th Annual Meeting, Symposium "Breaking Diffraction Barrier"
    • Place of Presentation
      San Diego, USA
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] 生命活動のより直接的理解を目指す生物学へのSPM技術の貢献2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      第4回ATI合同研究会「-科学は融合する- バイオ・医学とナノサイエンス」
    • Place of Presentation
      長野・ホテルメトロポリタン
    • Year and Date
      2009-11-13
  • [Presentation] 機能中のタンパク質の動態を直接見る2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      大阪市大生物学科セミナー
    • Place of Presentation
      大阪・大阪市大
    • Year and Date
      2009-11-10
  • [Presentation] 生体分子の動態を捉える高速原子間力顕微鏡2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      第29回日本表面科学会学術講演会 シンポジウム急速に進歩する非接触原子間力顕微鏡
    • Place of Presentation
      東京、タワーホール船堀
    • Year and Date
      2009-10-27
  • [Presentation] High-speed AFM Instrumentation and Study on the Walking Mechanism of Myosin V2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      Seminar at Curie Institute
    • Place of Presentation
      Curie Institute, France
    • Year and Date
      2009-09-28
  • [Presentation] High-speed AFM Instrumentation and Study on the Walking Mechanism of Myosin V2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      Seminar at Univ.of Bourgogne
    • Place of Presentation
      Univ.of Bourgogne, France
    • Year and Date
      2009-09-25
  • [Presentation] High-speed AFM Instrumentation and Study on the Walking Mechanism of Myosin V2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      Seminar at Univ.of Montpelier
    • Place of Presentation
      Univ.of Montpellier, France
    • Year and Date
      2009-09-21
  • [Presentation] 高速バイオAFM(原子間力顕微鏡)の開発2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      応用物理学会 特別企画シンポジウム「産学官連携と応用物理」
    • Place of Presentation
      富山・富山大学
    • Year and Date
      2009-09-08
  • [Presentation] High-speed atomic force microscopy for visualizing dynamic biomolecular processes,2009

    • Author(s)
      安藤敏夫
    • Organizer
      The International Congress of Physiological Sciences, Symposium on "Challenges in the Integration of Multiscale Biomechanical Systems"
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2009-07-30
  • [Book] "Handbook of Single-Molecule Biophysics" Chapter 17(pp.487-523), "High-speed atomic force microscopy"2009

    • Author(s)
      T.Ando, T.Uchihashi
    • Total Pages
      626
    • Publisher
      Springer-Verlarg
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.s.kanazawa-u.ac.jp/phys/biophys/index.htm

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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