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2011 Fiscal Year Annual Research Report

アクチンフィラメントの構造と動態:特にカルシウム調節のメカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 20227008
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

前田 雄一郎  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 特任教授 (10321811)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 成田 哲博  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (30360613)
Keywordsアクチン / アクチンフィラメント / アクチンのトレッドミリング / 筋収縮のカルシウム調節 / トロポニン / 遺伝性心疾患 / X線繊維回折 / 高分解能構造解析
Research Abstract

蛋白質・蛋白質間の相互作用としてのアクチンの会合動態の特徴:H22年度までにアクチン同士のあるいはアクチンと結合蛋白質の相互作用の研究で著しい成果があった。H23年度はこれらの意味を「蛋白質・蛋白質間の相互作用」という視点から考察し、総説・学会講演などの形で発表した。重合過程の考察:単量体 (Gアクチン) から重合体 (Fアクチン) への遷移に伴いアクチン分子は変形する (2009, Nature)。変形したF型には歪みのエネルギーが蓄えられる。この変形はアクチンのATP加水分解によって駆動されるのではなく、逆に変形によってATP加水分解が誘起される (2008, JBC)。変形は新規Gアクチンの重合端への衝突によって伝搬する。それゆえ、アクチン重合は自発的に開始されず、開始にはアクチンの変形を引起こす特別の蛋白質(Arp2/3複合体、forminなど)を必要とする。
トレッドミリングがB端方向へ進行する理由:トレッドミリングは以下の3要素メカニズムによって起きる。(1)G->F->G の1サイクルで1分子のATPが加水分解される。結合ヌクレオチドの加水分解 (ATP->ADP) はもっぱらFアクチン中で、ADP->ATPへの交換はもっぱらGアクチン中で起きる。(2)重合・脱重合速度ともB端で速く、P端で遅い (2011, EMBO J)。よってB端にはもっぱらATP-Fアクチンが存在し、P端はADP-Fアクチンで終わる。(3)ATP結合アクチンで終わる端(すなわちB端)で重合体はより安定であるため臨界濃度が低く、ADP結合アクチンで終わる端(P端)でより不安定で臨界濃度が高い。よって、両端の臨界濃度の中間のGアクチン濃度ではB端ではもっぱら伸張が、P端ではもっぱら短縮が起き、トレッドミリングはB端方向に進行する。進行方向は(2)端の構造の違いによって決まる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

上記の考察は、アクチン重合体およびその会合特性の理解を進めたものであり、今後の研究を計画する上で指針となる新しい概念を提案することができ、国際的にも高く評価された。また「蛋白質・蛋白質の相互作用」という現代の自然認識の最先端の領域で我々の理解を豊かにした。
なお、本研究課題は、「アクチンフィラメントの構造と動態」の解明であり、上述の成果はこの理解を格段に深めた。アクチンは「筋収縮のカルシウム調節」と、「アクチンのトレッドミリング分子運動」という2つの細胞機能を担っているため、具体的な課題はどちらかの機能を対象とする。申請当初、前者の分野で研究をより大きく研究を進展可能と判断したため、そのような副題を付したが、実際には後者の分野で研究は大きく進展した。いずれにせよ、「アクチンフィラメントの構造と動態」の理解を深めることは2つの機能を理解する共通の土台となるものである。

Strategy for Future Research Activity

蛋白質・蛋白質相互作用の研究として、(1)複合体の構造を解明する研究、(2)複合体の集合動態の基礎となる分子内構造動態を解明する研究、(3)細胞内の複合体構造、会合動態を解明する研究を展開する。(1)ではアクチン重合体・コフィリン複合体、およびアクチン・トロポミオシン・トロポニン複合体の高分解能構造解析、(2)ではキャッピング蛋白質(CP)およびアクチン重合体の構造動態の解析、(3)ではlamellipodia 内の分岐アクチン線維網目構造のアクチン重合体の構造解析を行う。

  • Research Products

    (39 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (31 results) (of which Invited: 8 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Direct determination of actin polarity in the cell2012

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Journal Title

      J.Mol.Biol.

      Volume: 419 Pages: 359-68

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2012.03.015

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Actin Branching in the initiation and maintenance of lamellipodia2012

    • Author(s)
      Vinzenz M
    • Journal Title

      J.Cell Science

      Volume: 125(11) Pages: 3775-85

    • DOI

      10.1242/jcs.107623

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Actin Capping protein and its inhibitor CARMIL : how intrinsically disordered regions function2011

    • Author(s)
      Takeda Shuichi
    • Journal Title

      Phys Biol.

      Volume: 8(3) Pages: 035005

    • DOI

      10.1088/1478-3975/8/3/035005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transformation of ActoHMM Assembly Confined in Cell-Sized Liposome2011

    • Author(s)
      Takiguchi Kingo
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 27(18) Pages: 11528-35

    • DOI

      10.1021/la2016287

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Minimum requirements for the actin-like treadmilling motor system.2011

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Journal Title

      Bio Architecture

      Volume: 1(5) Pages: 205-8

    • DOI

      10.4161/bioa.1.5.18115

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Merits of the double-stranded form of the actin filament revealed by structures of the filament ends2011

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Journal Title

      Communicative and Integrative Biology

      Volume: 4(6) Pages: 692-5

    • DOI

      http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22446529

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 分子と細胞をつなぐ線維状蛋白質構造解析2012

    • Author(s)
      Narita AKihiro
    • Organizer
      第117回日本解剖学会総会・全国学術集会
    • Place of Presentation
      山梨大学(山梨県)
    • Year and Date
      20120327-20120328
    • Invited
  • [Presentation] Two distinct mechanisms for actin capping protein regulation2012

    • Author(s)
      Takeda Shuichi
    • Organizer
      International Workshop "from Structure to Dynamics" for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120316-20120319
  • [Presentation] Does rigidified Capping Protein lose the affinity for the actin filamentB-end ?2012

    • Author(s)
      Maeda Yuichjro
    • Organizer
      International Workshop "from Structure to Dynamics" for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120316-20120318
  • [Presentation] Structural analysis of the actin filament in vitro and in vivo2012

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Organizer
      International Workshop "from Structure to Dynamics" for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120316-20120318
  • [Presentation] "Spatial structure of cytoskeleton associated with nuclear membrane2012

    • Author(s)
      Minakata Shiho
    • Organizer
      International Workshop "from Structure to Dynamics" for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120316-20120318
  • [Presentation] "Supramolecular structural analysis by STEM electron tomography2012

    • Author(s)
      Koike Masafumi
    • Organizer
      International Workshop "from Structure to Dynamics" for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120316-20120318
  • [Presentation] nhibition technique of troponin molecule aggregation in structural analysis by NMR2012

    • Author(s)
      Sakiyama-Kimura Chieko
    • Organizer
      International Workshop "from Structure to Dynamics" for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120316-20120318
  • [Presentation] Real-time observation of F-BAR-induced liposome tubulation2012

    • Author(s)
      Tanaka-Takiguchi Yohko
    • Organizer
      International Workshop "from Structure to Dynamics" for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120316-20120318
  • [Presentation] Reconstruction of Active Cytoskeletal Networks in Cell-Sized Liposomes2012

    • Author(s)
      Takiguchi Kingo
    • Organizer
      International Workshop "from Structure to Dynamics" for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120316-20120318
  • [Presentation] "New method for identify the ABP binding sites on the actin filament2012

    • Author(s)
      Dai Shuheng
    • Organizer
      International Workshop "from Structure to Dynamics" for Our Understanding of Protein-Protein Interactions
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20120316-20120318
  • [Presentation] Actin Polymerization correlates with the flattening of actin molecule2012

    • Author(s)
      Iwasa Mitsusada
    • Organizer
      56th Annual meeting Biophysical Society
    • Place of Presentation
      SanDiego Convention Center CA.(USA)
    • Year and Date
      20120225-20120229
  • [Presentation] Structural analysis of the actin filament network in the cell2012

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Organizer
      Direction of future in biological electron microscopy
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      20120217-20120217
    • Invited
  • [Presentation] "Structural analysis of NA+driven flagellar motor embedded in the membrane of Vibrio alginolyticus by electron tomography2012

    • Author(s)
      Koike Masafumi
    • Organizer
      Sensory Transduction in Microorganisms at Grordon Research Conference
    • Place of Presentation
      Ventura Beach Marriott CA.(USA)
    • Year and Date
      20120115-20120120
  • [Presentation] Structural analysis of the actin filament in vivo and in vitro2012

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Organizer
      Joint Seminar Centre for BioImaging Sciences - Structural biology division of Japan EM
    • Place of Presentation
      IMCB (Singapore)
    • Year and Date
      20120112-20120112
    • Invited
  • [Presentation] NMRによる構造解析におけるトロポニン分子会合の阻害法Inhibition technique of troponin molecule aggregation in structural analysis by NMR2011

    • Author(s)
      﨑山(木邑)智恵子
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] 分子から細胞までをつなぐ繊維状蛋白質複合体構造解析2011

    • Author(s)
      成田 哲博
    • Organizer
      第2回神経科学と構造生物学の融合
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • Year and Date
      20111121-20111122
    • Invited
  • [Presentation] Morphological and Topological Transformations That Are Induced into Cell -Sized Giant Liposomes2011

    • Author(s)
      Takiguchi Kingo
    • Organizer
      IEEE 2011 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2011) & Symposium on "COE for Education and Research of Micro-Nano Mechatronics
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
    • Year and Date
      20111103-20111103
  • [Presentation] Two distinct mechanisms for actin capping protein regulation2011

    • Author(s)
      Takeda Shuichi
    • Organizer
      EMBO Lecture Courese: The 26th. European Cytoskeletal Forum Meeting "Actin-Based Motility"
    • Place of Presentation
      Hotel Palma, Stresa(Italy)
    • Year and Date
      20111029-20111102
  • [Presentation] High-Resolution structural determination of the cofilin-decorated actin filament by single-particle analysis of cryo-electron micrographs2011

    • Author(s)
      Tanaka Kotaro
    • Organizer
      EMBO Lecture Courese: The 26th. European Cytoskeletal Forum Meeting "Actin-Based Motility"
    • Place of Presentation
      Hotel Palma, Stresa (Italy)
    • Year and Date
      20111029-20111102
  • [Presentation] 細胞を動かす原動力としてのアクチン重合体:構造研究から見えてきた離合集散のメカニズム  The actin filament as a cytomotive filament: structural insight into the mechanism of assembly-disassembly2011

    • Author(s)
      前田 雄一郎
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府)
    • Year and Date
      20110921-20110924
    • Invited
  • [Presentation] Actin capping protein and its inhibitor CARMIL how intrisically disordered regions function アクチンキャッピング蛋白質とその活性阻害蛋白質CARMILに含まれる天然変性領域の作用機構2011

    • Author(s)
      Takeda Shuichi
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] Visualization of Vibrio Na+-driven flagellar motor structure embedded in cell membrane by electron microscopy 菌体細胞膜に埋まったビブリオ菌のナトリウムイオン駆動型べん毛モーター構造の電子顕微鏡による可視化2011

    • Author(s)
      Koike Masafumi
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] A structural analysis of actin cytoskeleton in the cell 細胞内アクチン細胞骨格の構造解析2011

    • Author(s)
      Narita Akihiro
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] High-resolution structural determination of the cofilin-decorated actin filament by single-particle analysis of cryo-electron micrographs2011

    • Author(s)
      Tanaka Kotaro
    • Organizer
      第49回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] コフィリンでfull-decorateされたアクチンフィラメントの高分解能構造決定2011

    • Author(s)
      田中 康太郎
    • Organizer
      第51回日本生物物理学会若手の会夏の学校
    • Place of Presentation
      関西セミナーハウス(京都府)
    • Year and Date
      20110825-20110828
  • [Presentation] Two distinct mechanisms for actin capping protein regulation2011

    • Author(s)
      Takeda Shuichi
    • Organizer
      Motile & Contractile Systems at Gordon Research Conference
    • Place of Presentation
      Colby-Sawyer College NH.(USA)
    • Year and Date
      20110731-20110805
  • [Presentation] A Static View of the Dynamic Actin Filament2011

    • Author(s)
      Maeda Yuichiro
    • Organizer
      Muscle & Molecular Motors at Gordon Research Conference
    • Place of Presentation
      Colby-Sawyer College NH.(USA)
    • Year and Date
      20110710-20110715
    • Invited
  • [Presentation] アクチンキャッピングタンパク質、およびCARMILの天然変性領域によるアクチンダイナミックス制御機構 Functional roles of intrinsically disordered regions in actin capping protein and its inhibitor CARMIL for actin dynamics regulation2011

    • Author(s)
      武田 修一
    • Organizer
      第63回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      20110627-20110629
  • [Presentation] 細胞骨格のための単粒子解析法 Single particle analysis for cytoskeletal proteins2011

    • Author(s)
      成田 哲博
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府)
    • Year and Date
      20110607-20110609
    • Invited
  • [Presentation] Structural insights into mechanism of the actin treadmilling2011

    • Author(s)
      Maeda Yuichiro
    • Organizer
      IX European Symposium of he Protein Society
    • Place of Presentation
      Stockholm Univ. Stockholm(Sweden)
    • Year and Date
      20110522-20110526
    • Invited
  • [Presentation] 海洋性ビブリオ菌が持つNa+駆動型極べん毛モーターの電子線トモグラフィによる可視化

    • Author(s)
      小池 雅文
    • Organizer
      第48回日本細菌学会中部支部総会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知県)
  • [Book] 現代生物科学入門 3.構造機能生物学, 第2章 細胞運動のメカニズム2011

    • Author(s)
      前田雄一郎、小田俊郎
    • Total Pages
      163
    • Publisher
      岩波書店
  • [Remarks] 名古屋大学構造生物学研究センター

    • URL

      http://str.bio.nagoya-u.ac.jp:8080/Plone

URL: 

Published: 2014-07-24  

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