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2009 Fiscal Year Annual Research Report

シアノバクテリアゲノムの日周適応ダイナミクス

Research Project

Project/Area Number 20370072
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

岩崎 秀雄  Waseda University, 理工学術院, 准教授 (00324393)

Keywordsシアノバクテリア / 概日リズム / 明暗応答 / kai遺伝子 / マイクロアレイ
Research Abstract

当研究は,シアノバクテリアを用いて概日時計と明暗切り替えに伴う光応答の関係を,ゲノムワイドな転写制御の観点から解明することを目的としていた。
シアノバクテリアでは,概日振動子がどのように転写リズムを駆動するかについてはまだ不明な点が多い。ゲノムワイドな発現リズムを検討したところ,連続明条件下で少なくとも全ゲノムの30%強の遺伝子産物が概日発現すること,KaiCは従来の仮説と異なり,必ずしも概日発現の抑制因子とは言えないこと,暗期中では12時間以内に総mRNA量が20%以下にまで激減することなどをまず明らかにし,PNAS誌に報告した(Ito et al.,2009)。
これらの解析から暗期中ではkai遺伝子の転写が強く抑制されることなどから,概日リズムからの転写制御が解除されると考えられた。
しかし,最近私たちはkai遺伝子の破壊により,約半数の暗誘導遺伝子の発現パターンに大きな影響が見られることを明らかにした。さらに,これらの暗誘導パターンは,どの時刻から明期から暗期に移すのかによっても顕著な違いが観られた(暗誘導の時刻依存性)。この結果は,概日時計が一部の遺伝子の暗誘導を暗条件下で制御しうることを示すだけでなく,事実上Synechococcusが日長感受的な遺伝子発現を行っていること,すなわちバクテリアでも光周的遺伝子発現誘導が起こりうることを意味する。さらに,これらの制御に関わる因子としてシグマ因子を同定することにも成功した。間もなくこの成果は論文投稿する予定である。

  • Research Products

    (14 results)

All 2010 2009

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (9 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Cyanobacterial daily life with Kai-based circadian and diurnal genome-wide transcriptional control in Synechococcus elongatus2009

    • Author(s)
      Ito, Mutsuda, Murayama, Tomita, Hosokawe, (4 authors), Iwasaki
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA 106

      Pages: 14168-14173

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cyanobacterial Cell Lineage Analysis of the Spatiotemporal hetR Expression Profile during Heterocyst Pattern Formation in Anabaena sp.PCC 71202009

    • Author(s)
      Asai, Iwamori, Kawai, Ehira, Ishihara, Aihara, Shoji, Iwasaki
    • Journal Title

      PLoS ONE 4

      Pages: e7371

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] バクテリアの生物時計-システム解析と構成的アプローチ2009

    • Author(s)
      岩崎秀雄
    • Journal Title

      化学と生物 47(7)

      Pages: 493-498

  • [Presentation] バクテリアの時空間パターン形成の科学とアート2010

    • Author(s)
      岩崎秀雄
    • Organizer
      医科学研究所サイアート・カフェ
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2010-03-06
  • [Presentation] 紙とバクテリアの対話について:バイオメディアを用いた科学とアートの現状と課題2010

    • Author(s)
      岩崎秀雄
    • Organizer
      第4回内部観測研究会
    • Place of Presentation
      東京理科大学
    • Year and Date
      2010-03-05
  • [Presentation] 単細胞性シアノバクテリアにおける光周的遺伝子発現について2010

    • Author(s)
      畠山哲央, 細川徳宗, 岩崎秀雄
    • Organizer
      時間生物学フォーラム東京
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2010-02-13
  • [Presentation] 原核生物の光周的遺伝子発現誘導の発見:kai 遺伝子の転写翻訳フィードバックを欠く暗期中でのシアノバクテリアの概日転写制御2009

    • Author(s)
      細川徳宗, 畠山哲央, 岩崎秀雄
    • Organizer
      日本時間生物学会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2009-10-25
  • [Presentation] 多細胞性シアノバクテリア Anabaena sp.PCC 7120における概日リズム2009

    • Author(s)
      櫛笥博子, 久下沼正之, 松岡正城, 岩崎秀雄
    • Organizer
      日本時間生物学会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2009-10-25
  • [Presentation] Photoperiodic gene expression in cyanobacteria : circadian gene expression in the dark without transcriptional feedback of kai genes2009

    • Author(s)
      岩崎秀雄
    • Organizer
      日本生化学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2009-10-22
  • [Presentation] シアノバクテリアの概日転写リズムに関する新知見2009

    • Author(s)
      岩崎秀雄
    • Organizer
      藍藻ゲノム研究会
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2009-07-04
  • [Presentation] 体内時計から細胞創成へ?:構成生物学の社会・文化的含意について2009

    • Author(s)
      岩崎秀雄
    • Organizer
      日本時間学会
    • Place of Presentation
      山口大学
    • Year and Date
      2009-06-13
  • [Presentation] マイクロ流体デバイスを使用した多細胞性シアノバクテリアのパターン形成の観察2009

    • Author(s)
      石原潤一, 川合健太郎, 庄子習一, 岩崎秀雄
    • Organizer
      日本発生生物学会
    • Place of Presentation
      新潟
    • Year and Date
      2009-05-23
  • [Book] Systems Biology : The Challenge of Complexity(chapter : "A posttranslational chemical circadian oscillator in cyanobacteria")2009

    • Author(s)
      H.Iwasaki(Eds.Nakanishi, S., Kageyama, R., Watanabe, D)
    • Total Pages
      246
    • Publisher
      Springer
  • [Book] Bacterial Circadian Programs2009

    • Author(s)
      H.Iwasaki(Eds.J.Ditty, S.Mackey, C.H.Johnson)
    • Total Pages
      300
    • Publisher
      Springer

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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