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2009 Fiscal Year Annual Research Report

細菌鞭毛フラジェリンの構造機能相関と細胞表層局在化機構

Research Project

Project/Area Number 20380049
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

村田 幸作  Kyoto University, 農学研究科, 教授 (90142299)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 橋本 渉  京都大学, 農学研究科, 准教授 (30273519)
三上 文三  京都大学, 農学研究科, 教授 (40135611)
Keywordsフラジェリン / 鞭毛 / 細菌細胞表層構造 / アルギン酸 / X線結晶構造解析 / 超チャネル / ペプチドグリカン構造 / ペプチドグリカン分解酵素
Research Abstract

スフィンゴモナス(Sphingomonas)属細菌A1は、細胞表層に巨大な体腔を形成し、そこから高分子多糖(アルギン酸)をペリプラズムに取り込む。取り込まれたアルギン酸はペプチドグリカン層を通過して、細胞膜局在のABCトランスポーターによって細胞質へ輸送され、細胞質局在性のアルギン酸リアーゼによって単糖に分解され、資化される。この場合、体腔の形成には本来鞭毛形成タンパク質である筈のタンパク質フラジェリンが細胞表層に2種類(P5, P6)発現し、両者を破壊すると細胞は死滅する。また、両フラジェリンは強力なアルギン酸結合能を有する。このような現象を理解するため、フラジェリンP5の立体構造を決定した。その結果、P5は、N-ターミナルとC-ターミナルから成るα-ドメイン(更にα1とα2から成る)と中央部のβ-ドメインから構成されている。α-ドメインはアルギン酸の結合に関与している(より詳細にはα1とα2の境界にあるスポークル領域に結合)。β-ドメインはT4ファージの宿主接着に必要なshort-tail fiberとbaseplateを結び付けるヒンジタンパク質gp11の立体構造と重なることを明らかにした。これにより、鞭毛やファージを構成する分子の起源、進化、構造と機能に関して新たな視座を提供した。また、ペプチドグリカン分解酵素(FlgJ)の立体構造を初めて決定し、リゾチームとは触媒残基が明らかに異なることを見出した(掲載受理論文 : Maruyama Y.,
Ochiai, A., Itoh, T., Mikami, B., Hashimoto, W., & Murata, K. : Mutational studies of the peptideglycan hydrolase FlgJ of Sphingomonas sp. strain A1. J. Basic. Microbiol., inpress, 2010)。

  • Research Products

    (15 results)

All 2010 2009

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (11 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Bacterial supersystem for alginate import/metabolism and its environmental and bioenergy applications2010

    • Author(s)
      Wataru Hashimoto
    • Journal Title

      Bioengineered Bugs 1

      Pages: 1-13

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of cell-surface alginate-binding protein Algp7 from Sphingomonas sp. A12009

    • Author(s)
      Wataru Hashimoto
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section F 65

      Pages: 515-517

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of family 14 polysaccharide lyase with pH-dependent modes of action2009

    • Author(s)
      Kohei Ogura
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 284

      Pages: 33572-33579

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 細菌由来推定リポタンパク質の脂質結合性評価とその予備的X線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      橋本渉
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2010-03-30
  • [Presentation] 窒素固定細菌 Azotobacter vinelandii のシデロフォア生合成遺伝子クラスター2010

    • Author(s)
      米山史紀
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2010-03-29
  • [Presentation] アルギン酸輸送ABCトラシスポーターの機能解析と予備的X線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      伊藤貴文
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2010-03-29
  • [Presentation] アルギン酸代謝における細菌由来α-ケト酸還元酵素の生理機能と活性中心構造2010

    • Author(s)
      落合秋人
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2010-03-29
  • [Presentation] 細菌由来メタロペプチダーゼファミリーM16酵素のX線結晶構造2010

    • Author(s)
      丸山如江
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      東京大学 (東京都)
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] 細菌におけるATP加水分解エネルギーによる高分子多糖の取り込み2009

    • Author(s)
      西谷悠
    • Organizer
      リン化合物討論会
    • Place of Presentation
      静岡大学 (静岡県)
    • Year and Date
      2009-12-05
  • [Presentation] Coenzyme-binding mode in α-keto acid reductase responsible for alginate metabolism2009

    • Author(s)
      高瀬隆一
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド (兵庫県)
    • Year and Date
      2009-10-24
  • [Presentation] Structural determinants responsible for mode of action in polysaccharide lyases for biofuel production2009

    • Author(s)
      落合秋人
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド (兵庫県)
    • Year and Date
      2009-10-24
  • [Presentation] Expression and function analysis of Sphingomonas alginate ABC transporter2009

    • Author(s)
      伊藤貴文
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド (兵庫県)
    • Year and Date
      2009-10-22
  • [Presentation] 多糖の輸送・分解に関わる細菌由来超分子の構造と機能2009

    • Author(s)
      橋本渉
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド (兵庫県)
    • Year and Date
      2009-10-21
  • [Presentation] アルギン酸リアーゼvAL-1 (S) は反応pHにより異なる作用様式 (エンド/エキソ型) を示す2009

    • Author(s)
      小倉康平
    • Organizer
      日本生物工学会
    • Place of Presentation
      名古屋大学 (愛知県)
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 細菌によるアルギン酸からのバイオ燃料生産2009

    • Inventor(s)
      村田幸作
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人京都大学・株式会社マルハニチロホールディングス
    • Industrial Property Number
      特許・特願2009-198972
    • Filing Date
      2009-08-28

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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