テナガザル類の多様性と系統生物地理学

2011 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 20405016
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 平井 啓久 京都大学, 霊長類研究所, 教授 (10128308)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 香田 啓貴 京都大学, 霊長類研究所, 助教 (70418763) ; 宮部 貴子 京都大学, 霊長類研究所, 助教 (10437288) ; 遠藤 秀紀 東京大学, 総合研究博物館, 教授 (30249908)
• Keywords: テナガザル / シアマン / シロマユテナガザル / ホオジロテナガザル / アルファサテライトDNA / レトロトランスポゾン

Research Abstract

(1)シアマンのヘテロクロマチンの主成分を明らかにする実験を行った。シアマンのゲノムから、端部の大規模ヘテロクロマチンに存在する反復配列を確認した。塩基配列を解読した結果、アルファサテライトDNAであることが判明した。アルファサテライトDNAは、霊長類のセントロメアの主成分となっている反復配列であり、171bpの単位が連続している。セントロメアに存在する主成分がシアマンではテロメアのヘテロクロマチンを形成している。
(2)テナガザルにおいて従来とは異なるトランスポゾンの特性を発見した。SVA因子とよばれるレトロトランスポゾンは、ヒト上科の共通祖先で生じたと考えられている複合型因子である。3つの領域からなり、右端(SINE)と左端(Alu)は、それぞれが単独のトランスポゾンに由来する。内部(VNTR)は30-50bpの単位が縦列に連なった反復配列である。シロマユテナガザルでも同様の因子が存在するが、これに加えて長大なVNTRが多数存在する。染色体上のセントロメア領域のヘテロクロマチンを形成していると考えられる、すなわち今回の発見は、トランスポゾンが新規のヘテロクロマチンを大量に供給する現象である。
(3)ヒトのゲノムの約45%を占めるトランスポゾンのうち,動いているトランスポゾンとして4種類が知られている。SVAはその一つであり,遺伝子に転移して様々な病気を引き起こす例が知られている.ホオジロテナガザルのゲノムにおいて,SVAに関連する配列を発見した.この配列はSVAのSINEの部分がプロスタグランジン還元酵素2様(PTGR2-like)遺伝子の一部に置き換えられた構造をしており,我々はこれをSr-SVAと名付け、現在この配列の発生機序を解析中である。
今回発見した配列は、テナガザル4属の染色体を判別する場合に有効であることも明らかになった。また、分子集団遺伝学的に解析するための、シロマユテナガザルの糞収集をバングラデシュでおこなった。

Research Products

• [Journal Article] Evaluation of the predictive performance of a pharmacokinetic model for propofol in Japanese macaques (Macaca fuscata fuscata) (2012)
  • Author(s): Miyabe-Nishiwaki T, K Masui, A Kaneko, K Nishiwaki, T Nishio, H.Kanazawa
  • Journal Title: Journal of Veterinary Pharmacology and Therapeutics
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Streptococcus troglodytae sp.nov., from the Chimpanzee Oral Cavity (2012)
  • Author(s): Okamoto M, Imai S, Miyanohara M, Saito W, Momoi Y, Abo T, Nomura Y, Ikawa T, Ogawa T, Miyabe-Nishiwaki T, Kaneko A, Watanabe A, Watanabe S, Hayashi M, Tomonaga M, Hanada N
  • Journal Title: Int J Syst Evol Microbiol Volume: Mar 23
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Urological screening of wild Japanese macaques : investigating trends in nutrition and health (2012)
  • Author(s): MacIntosh AJJ, Huffman MA, Nishiwaki K, Miyabe-Nishiwaki T
  • Journal Title: International Journal of Primatology Volume: 33 Pages: 460-478
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evolution and biological meaning of genomic wastelands (RCRO) : proposal of hypothesis (2012)
  • Author(s): Hirai, H
  • Journal Title: In Post-Genome Biology of Primates Pages: 227-240
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Molecular characterization of glycogen synthese 1 and its tissue expression profile with type II hexikinase and muscle-type phosphofructokinase in horses (2011)
  • Author(s): Echigoya Y, Okabe H, Itou T, Endo H, Sakai T
  • Journal Title: Mol.Biol Volume: 38 Pages: 461-469
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Collection, Analysis, and Distribution of Three-Dimensional CT Data from Primate and Other Skull Specimens (2011)
  • Author(s): Endo H, Yamamoto Y, Yamamoto H, Sakai T, Itou T, Koie H, Hirai H
  • Journal Title: Jpn.J.Zoo Wildl.Med Volume: 16 Pages: 45-53
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Necropsy case report for an old wild Japanese macaque (Macaca fuscata yakui) from Yakushima Island (2011)
  • Author(s): Hayakawa S, Hernadez A.D, Suzuki M, Sugaya K, koda H, Hasegawa H, Endo H
  • Journal Title: Primate Res Volume: 27 Pages: 3-10
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Phylogenetic relationship between Callosciurus caniceps and C.inornatus (Rodentia, Sciuridae) : Implication for zoogeographical isolation by the Mekong River (2011)
  • Author(s): Oshida T, Can Ngoc Dang, Son Truong Nguyen, Nghia, Xuan Nguyen, Hideki Endo, Junpei Kimura, Motoki Sasaki, Akiko Hayashida, Ai Takano, Masatoshi Yasuda, Yoshihiro Hayashi
  • Journal Title: Italian J.Zool Volume: 78 Pages: 328-335
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Coxa morphologically adapted to large egg in aepyornithid species compared with various palaeognaths (2011)
  • Author(s): Endo H, Akishinonomiya F, Yonezawa T, Hasegawa M, Rakotondraparany F, Sasaki M, Taru H, Yoshida A, Yamasaki T, Itou T, Koie H, Sakai T
  • Journal Title: Anat.Hist.Embryol Volume: 41 Pages: 31-40
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Differential prefrontal white matter development in chimpanzees and humans (2011)
  • Author(s): Sakai T, Mikami A, Tomonaga M, Matsui M, Suzuki J, Hamada Y, Tanaka M, Miyabe-Nishiwaki T, Makishima H, Nakatsukasa M, Matsuzawa T
  • Journal Title: Curr Biol Volume: 21 Pages: 1397-1402
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Diversification of bitter taste receptor gene family in western chimpanzees (2011)
  • Author(s): Sugawara T, Go Y, Udono T, Morimura N, Tomonaga M, Hirai H, Imai H
  • Journal Title: Molecular Biology and Evolution Volume: 28 Pages: 921-931
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Positive selection of Toll-like receptor 2 polymorphisms in two closely related old world monkey species, rhesus and Japanese macaques (2011)
  • Author(s): Takaki A, Yamazaki A, Maekawa T, Shibata H, Hirayama K, Kimura A, Hirai H, Yasunami M
  • Journal Title: Immunogenetics
  • DOI: 10.1007/S00251-011-0556-2
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genomes and geography : genomic insights into the evolution and phylogeography of the genus Schistosoma (2011)
  • Author(s): Lawton SP, Hirai H, Ironside JE, Johnstone DA, Rollinson D
  • Journal Title: Parasites & Vectors Volume: 4 Pages: 131
  • DOI: 10.1186/1756-3305-4-131
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] B chromosomes have a functional effect on femal sex determination in lake Victoria cichlid fishes (2011)
  • Author(s): Yoshida K, Terai Y, Mizoiri S, Aibara M, Nishihara H, Watanabe M, Kuroiwa A, Hirai H, Hirai Y, Matsuda Y, Okada N
  • Journal Title: PLoS Genetics Volume: 7
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Activation of the long terminal repeat of human endogenous retrovirus K by melanoma-specific transcription factor MITF-M (2011)
  • Author(s): Katoh I, Mirova A, Kurata s, Murakami Y, Horikawa K, Nakakuki N, Sakai T, Hashimoto K, Maruyama A, Yonaga T, Fukunishi N, Moriishi K, Hirai H
  • Journal Title: Neoplasia Volume: 13 Pages: 1081-1092
  • Peer Reviewed