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2008 Fiscal Year Annual Research Report

変異体構造解析による光化学系II複合体の構造制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 20570038
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

沈 建仁  Okayama University, 大学院・自然科学研究科, 教授 (60261161)

Keywords光合成 / 光化学系II / 膜タンパク質 / 結晶構造解析 / タンパク質複合体 / 酸素発生 / 水分解 / 変異体
Research Abstract

本研究の目的は、光合成光化学系II複合体(以下PSIIとする)における各低分子量サブユニットの役割を、それぞれのサブユニット欠失変異体を用いて、結晶化・X線結晶構造解析と機能解析を組み合わせて解析し、PSII複合体の構造形成・制御機構を明らかにすることである。本年度では、Ycf12(Psb30)欠失変異株からPSII二量体を精製し、結晶化・構造解析を行った。野生体PSII結晶との差フーリエ図から、Ycf12がPSII二量体の周辺部、PsbZの近傍に存在することが判明した。この位置は以前報告された3.0A分解能では未同定のX1ヘリックスに相当し、最近報告された2.9A分解能の構造と一致する。また、PsbZ欠失変異株からのPSII二量体を結晶化したところ、結晶の格子定数が野生体PSIIのものと異なっていた。これは、結晶のパッキングにおいてPsbZが隣接二量体のPsbOと相互作用しているため、PsbZの欠失により結晶中のPSII二量体の配置が変化したことを示している。PsbZ欠失変異株において、弱陰イオン交換カラムにより精製した粗PSII粒子にはYcf12が結合していたが、強陰イオン交換カラムにより調製したpufe PSIIにはYcf12が結合していなかった。したがって、PsbZはPSIIへのYcf12の結合を安定化しており、このことは、PSIIのアセンブリーにおいてYcf12→PsbZの順にPSIIに取り込まれることを示唆している。両変異株から調製したPSII二量体の酸素発生活性はいずれも野生株より低下し、PSIIの含量が減少した。これらのことは、Ycf12またはPsbZの欠失によりin vivoでPSIIが不安定化になったことを示している。

  • Research Products

    (26 results)

All 2009 2008

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (19 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Towards structural elucidation of eukaryotic photosystem II : Purification, crystallization and preliminary x-ray diffraction analysis of photosystem II from a redalga2009

    • Author(s)
      Hideyuki Adachi, Yasufumi Umena, Isao Enami, Takahiro Henmi, Nobuo Kamiya, Tian-Ren Shen
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta 1787

      Pages: 121-128

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Probing tyrosine Z oxidation in photosystem II core complex isolated from spinach by EPR at liquid helium temperatures2009

    • Author(s)
      Yanan Ren, Chunxi Zhang, Han Bao, Jian-Ren Shen. Jingquan Zhao
    • Journal Title

      Photosynthesis Research 99

      Pages: 127-138

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] X-ray crystallographic and biochemical characterizations of a mutant Photosystem II complex from Thermosynechococcus vulcanus with the psbTc gene inactivated by an insertion mutation2008

    • Author(s)
      Takahiro Henmi, Uasako Iwai, Masahiko Ikeuchi, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kaniya
    • Journal Title

      J. Synchrotron Rad. 15

      Pages: 304-307

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Acceptor side effects on the electron transfer at cryogenic temperatures in intact photosystem II2008

    • Author(s)
      Han Bao, Chunxi Zhang, Keisuke Kawakani, Yanan Ren, Jian-Ren Shen. Jingquan Zhao
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta 1777

      Pages: 1109-1115

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of phospholipase and lipase treatments on photosystem II core dimer from a thermophilic cyanobacterium2008

    • Author(s)
      Jing Leng, Isamu Sakurai, Hajime Wada, Jian-Ren Shen
    • Journal Title

      Photosynthesis Research 98

      Pages: 469-478

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structures and functions of the extrinsic proteins of photosystem II from different species2008

    • Author(s)
      Isao Bnami, Akinori Okumura, Ryo Nagao, Masako Iwai, Takehiro Suzuki, Jian-Ren Shen
    • Journal Title

      Photosynthesis Research 98

      Pages: 349-363

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 光化学系II二量体の形成・安定化におけるPsbM, Psblサブユニットの役割2009

    • Author(s)
      川上恵典, 岩井雅子, 川端洋輔, 逸見隆博, 池内昌彦, 神谷信夫, 沈 建仁
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090321-20090324
  • [Presentation] 紅藻Cyanidium caldarium光化学系II結晶分解能の改善とx線による分析2009

    • Author(s)
      足立秀行, 梅名泰史, 榎並勲, 神谷信夫, 沈建仁
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090321-20090324
  • [Presentation] Ycfl2、PsbZ欠失変異体由来光化学系IIのX線結晶構造解析2009

    • Author(s)
      3高坂賢之, 岩井雅子, 梅名泰史, 神谷信夫, 川上恵典, 沈建仁
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090321-20090324
  • [Presentation] シリカ多孔体細孔中に導入した好熱性シアノバクテリア光化学系II反応中心複合体の機能2009

    • Author(s)
      野地智康, 上滝十尋, 川上恵典, 沈建仁, 梶野勉, 福嶋喜章, 関藤武士, 伊藤繁
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090321-20090324
  • [Presentation] PsbM, PsbI欠失変異株における光化学系II複合体の構造・機能解析2008

    • Author(s)
      川上恵典, 川端洋輔, 逸見隆博, 岩井雅子, 池内昌彦, 神谷信夫, 沈建仁
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      20081218-20081219
  • [Presentation] 変異株を用いた光化学系II低分子量サブユニットYcfl2の位置決定2008

    • Author(s)
      高坂賢之, 岩井雅子, 川上恵典, 沈建仁, 梅名泰史, 神谷信夫
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      20081218-20081219
  • [Presentation] 光化学系II複合体のサブ構造2008

    • Author(s)
      岩井雅子, 渡辺麻衣, 沈建仁, 池内昌彦
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      20081218-20081219
  • [Presentation] 立体構造から探る光化学系II酸素発生反応の機構2008

    • Author(s)
      沈建仁
    • Organizer
      日本生物物理学会2008年度年会
    • Place of Presentation
      博多
    • Year and Date
      20081203-20081205
  • [Presentation] Roles of chloride and small subunits in PSII function and assembly studied by X-ray crystal structural analysis2008

    • Author(s)
      Jian-Ren Shen
    • Organizer
      Japan-Finland Seminar : Genomics and Molecular Mechanisms of Regulation in Photosynthetic Organisms
    • Place of Presentation
      Helsinki, Finland
    • Year and Date
      20081028-20081101
  • [Presentation] 光化学系II反応中心の多周波EPR研究2008

    • Author(s)
      松岡秀人, 沈建仁, 西山圭, 古川貢, 中村敏和, 山内清語, 河盛阿佐子
    • Organizer
      第47回電子スピンサイエンス学会年会(SEST2008)
    • Place of Presentation
      博多
    • Year and Date
      20081001-20081003
  • [Presentation] 膜タンパク質を見る2008

    • Author(s)
      沈 建仁
    • Organizer
      日本植物学会第7 2回大会
    • Place of Presentation
      高知
    • Year and Date
      20080924-20080927
  • [Presentation] Crystal structural analysis of photosystem II complex with the novel method to reduce X-ray radiation : damage2008

    • Author(s)
      Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Akio Ohkuma, Shinya Saijyou, Hisashi Naitow, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya
    • Organizer
      IUCr2008, XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      20080823-20080831
  • [Presentation] Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of photosystem II dimer from a red alga2008

    • Author(s)
      Hideyuki Adachi, Yasufumi Umena, Isao Enami, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen
    • Organizer
      IUCr2008, XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      20080823-20080831
  • [Presentation] Coordination structure and functional implications of two Cl^--binding sites in oxygen-evolving photosystem II2008

    • Author(s)
      Keisuke Kawakami, Yasufumi Umena, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen
    • Organizer
      IUCr2008, XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      20080823-20080831
  • [Presentation] g-Anisotropy of the S2-state Manganese Cluster in Cyanobacterial Photosystera II derived by W-band Electron Paramagnetic Resonance2008

    • Author(s)
      Asako Kawamori, Hideto Matsuoka, Ko Furukawa, Tatsuhisa Kato, Hiroyuki Mino, Jian-Ren Shen
    • Organizer
      Asia Pacific EPR Society-EPR Symposium
    • Place of Presentation
      Cairns, Queensland, Australia
    • Year and Date
      20080713-20080718
  • [Presentation] The Yz Tyrosine Radical in Photosystem II studied by Q- and W-band EPR Spectroscopy2008

    • Author(s)
      Hideto Matsuoka, Jian-Ren Shen, Toshikazu Nakamura, Seigo Yamauchi, Asako Kawamori
    • Organizer
      Asia Pacific EPR Society - EPR Symposium
    • Place of Presentation
      Cairns, Queensland, Australia
    • Year and Date
      20080713-20080718
  • [Presentation] 脱水処理による紅藻光化学系II複合体結晶の分解能の向上2008

    • Author(s)
      足立 秀行, 梅名 泰史, 榎並 勲, 神谷 信夫, 沈 建仁
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ
    • Place of Presentation
      淡路島
    • Year and Date
      20080616-20080618
  • [Presentation] PsbI欠失変異株における光化学系IIの構造・機能解析2008

    • Author(s)
      川上 恵典, 川端洋輔, 逸見 隆博, 岩井 雅子, 池内 昌彦, 神谷 信夫, 沈 建仁
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ
    • Place of Presentation
      淡路島
    • Year and Date
      20080616-20080618
  • [Presentation] X線損傷低減データに基づく光化学系II膜蛋白質複合体の構造解析2008

    • Author(s)
      梅名泰史, 川上恵典, 大熊章郎, 西条慎也, 内藤久志, 沈建仁, 神谷信夫
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ
    • Place of Presentation
      淡路島
    • Year and Date
      20080616-20080618
  • [Book] Structure and Function of Photosystem II, In Photosynthetic Protein Complexes, A Structural Approach, Edited by F. Fromme2008

    • Author(s)
      Shen J. -R., Henmi T., Karaiya N.
    • Total Pages
      83-106
    • Publisher
      WILEY-VCH

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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