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2009 Fiscal Year Annual Research Report

深海底熱水活動域における化学合成微生物の共生機構を分子的に理解する

Research Project

Project/Area Number 20687003
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

中川 聡  Hokkaido University, 大学院・水産科学研究院, 准教授 (70435832)

Keywords深海底熱水孔環境 / 共生 / 生物間相互作用 / 糖鎖 / グライコミクス
Research Abstract

本研究は糖鎖分子を扱う第三の分子生物学(=グライコミクス)を深海底に導入し、共生関係にある微生物-大型生物の相互作用・相互認識機構を分子レベルで解明することを目的とするものである。
平成21年度は、計画していた目標を全て達成し、想定以上の成果を得た。本年度は、主に1.全ゲノム解析済みの共生微生物(純粋培養細胞)、2.ホスト生物の血清、3.ホスト生物のバクテリオサイトから分画した共生微生物細胞(環境試料)を用いて、(1)現有設備による微生物糖鎖の精製・検出・構造解析法の確立、(2)微生物細胞表層に特化した糖鎖解析技術の確立、(3)ホスト生物における糖鎖認識タンパク質の探索と性状解析、の3項目を重点的に進めた。その結果、(1)においては、糖鎖精製法・ラベル化法・MALDI-TOFMSの設定を最適化することにより、ピコモルオーダーの糖鎖を高感度に検出し構造解析することが可能な系を確立した。また、(2),(3)においてはハイスループットなアレイ技術を用いて解析を行なった。(2)においては、FISH (fluorescent in-situ hybridization)法により染色した微生物細胞をそのままレクチンアレイに供し、共生微生物の細胞表層に高発現している糖鎖をプロファイリングすることに成功した。(3)においてはホスト生物の血清中にレクチン活性を検出することに成功したが、糖鎖アレイにて性状解析できるほどレクチン含量は多くなかったため、現在レクチン分子の濃縮・精製を行なっている。
加えて、インド洋中央海嶺で実施した研究調査航海において、細胞内共生微生物を有する希少巻貝の大群集を発見し、平成22年度に行う解析に必要となる細胞内共生系試料を採取・調整することに成功した。
以上の結果の一部は、国内外における複数の学会や新聞・国際誌等で報告した。

  • Research Products

    (8 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Archaeoglobus sulfaticallidus sp.nov., a novel thermophilic and facultatively lithoautotrophic sulfate-reducer isolated from black rust exposed to hot ridge flank crustal fluids2010

    • Author(s)
      Steinsbu, B.
    • Journal Title

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bacterial lifestyle in a deep-sea hydrothermal vent chimney revealed by the genome sequence of the thermophilic bacterium Deferribacter desul-furicans SSM12010

    • Author(s)
      Takaki, Y.
    • Journal Title

      DNA Research (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multi-probe-fluorescence in situ hybridization for the rapid enumeration of viable Vibrio parahaemolyticus2009

    • Author(s)
      Sawabe, T.
    • Journal Title

      Microbes and Environment 24

      Pages: 259-264

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation and physiological characterization of two novel, piezophilic, thermophilic chemolithoautotrophs from a deep-sea hydrothermal vent chimney2009

    • Author(s)
      Takai, K.
    • Journal Title

      Environmental Microbiology 11

      Pages: 1983-1997

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 海藻糖質をエタノール-水素発酵するビブリオの種同定2010

    • Author(s)
      澤辺智雄
    • Organizer
      日本水産学会春季大会
    • Place of Presentation
      日本大学生物資源科学部
    • Year and Date
      2010-03-28
  • [Presentation] 魚介類の粘液に対する腸炎ビブリオの化学走性2009

    • Author(s)
      石澤明子
    • Organizer
      腸炎ビブリオシンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学大学院自然科学研究科
    • Year and Date
      2009-11-26
  • [Presentation] Chemotaxis of Vibrio harveyi using sequence type defined strains2009

    • Author(s)
      澤辺智雄
    • Organizer
      Vibrio 2009
    • Place of Presentation
      リオデジャネイロ(ブラジル)
    • Year and Date
      2009-11-06
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.hokudai.ac.jp/bureau/topics/press_release/091130_pr_scaly-foot.pdf

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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