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2020 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノム・細胞情報に基づく国内希少動物の繁殖促進戦略

Research Project

Project/Area Number 20H00420
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

村山 美穂  京都大学, 野生動物研究センター, 教授 (60293552)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 亀井 謙一郎  京都大学, 高等研究院, 准教授 (00588262)
金子 武人  岩手大学, 理工学部, 准教授 (30332878)
福田 智一  岩手大学, 理工学部, 教授 (40321640)
大沼 学  国立研究開発法人国立環境研究所, 生物・生態系環境研究センター, 主任研究員 (50442695)
木下 こづえ  京都大学, 野生動物研究センター, 助教 (50724233)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords絶滅危惧種 / ゲノム / iPS細胞 / 生殖細胞 / 加齢
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、国内の希少高次捕食者のツシマヤマネコ、ニホンイヌワシにおいて、繁殖の成否に関わる要因を司る分子基盤を、ゲノム、細胞、生殖機能など多階層縦断的な解析によって明らかにする。具体的には1)繁殖機能に関わる遺伝子の同定、2)iPS細胞および始原生殖細胞の作製法の確立、3)加齢やストレスによる繁殖機能低下の原因解明、を相互補完的に実施し、得られる情報に基づいて、飼育施設に有効な繁殖促進戦略を提案する。
1)では、イヌワシおよびヤマネコのゲノム配列情報を、ロングリード解析やメイトペアのデータの追加により、精度を高めた。全国のイヌワシを飼育している動物園より、繁殖状況に関する情報を収集し、繁殖に成功または失敗した個体の抽出を行った。さらにゲノム情報が取得されていない2個体の全ゲノム解析を実施した。
2)では、ツシマヤマネコの皮膚由来細胞から、薬剤誘導性の変異型サイクリン依存性キナーゼ4(CDK4)遺伝子、サイクリンD1を発現する無限分裂細胞を作製した。アマミノクロウサギ およびケナガネズミの死亡個体の筋肉から、合計10個体の初代培養細胞を樹立した。ニホンイヌワシiPS細胞の培養条件を検討し、ヒト多能性幹細胞用の未分化維持用合成培養液が使用できる可能性が示唆された。また始原生殖細胞分化への条件検討も試みた。
3)では、モデル動物のネコを用いてDNAメチル化を指標とした年齢推定を行い、健康状態(腎臓疾患)と推定年齢の関係を調べた。またツシマヤマネコの野生由来個体の糞のDNAを抽出した。糞を用いてストレスのバイオマーカーとしてコルチゾール濃度を測定し、主に繁殖状態の違いによる生理的ストレス変化を調べた。ツシマヤマネコの死亡個体から摘出した精巣組織から、精子を回収し凍結保存を実施した。高齢個体からの精子採取にも成功し、凍結精子の受精能試験を実施した結果、核形成可能な受精能を確認した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ほぼ予定通りに進行し、論文や学会発表も行っている。

Strategy for Future Research Activity

1)では、SNPマーカーを用いて、ペア形成や繁殖の成功に重要な役割を果たしていると考えられるゲノム領域を特定する。特定されたゲノム領域の配列を最初に整備したドラフト配列から抽出する。この配列を活用して、タンパク質として機能していると予想される領域(Open Reading Frame、ORF)を特定する。特定されたORFについてニワトリゲノムとの相同性検索等によってORFの機能を推定する。特に繁殖との関連が考えられる遺伝子(精子形成、MHC、感覚等)を中心に解析を進める。
2)では、作成したiPS細胞の機能評価には、長期培養後における増殖能・分化能・核型解析を行う。さらに分化誘導因子を作製して、始原生殖細胞分化誘導における最適条件を同定する。
3)では、昨年度に引き続き年齢推定を行い、加齢およびストレスと繁殖機能低下の関係について解明する。また年齢推定を行う個体の糞を用いてストレスのバイオマーカーとして知られているコルチゾール濃度を測定し、加齢やストレスが繁殖機能低下に与える影響について調べる。生殖細胞については、イエネコやニワトリをモデル動物として用い、老齢個体にも有用な生殖細胞の保存法・生殖細胞の機能解析法の技術開発を行う。モデル動物で開発した年齢推定や生殖細胞保存の技術を、野生由来の飼育個体へ応用する。

  • Research Products

    (34 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 3 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 11 results,  Invited: 2 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Edinburgh(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Edinburgh
  • [Journal Article] The tail-tale of stress: an exploratory analysis of cortisol levels in the tail-hair of captive Asian elephants2021

    • Author(s)
      Pokharel Sanjeeta Sharma、Yoneda Hiroki、Yanagi Moe、Sukumar Raman、Kinoshita Kodzue
    • Journal Title

      PeerJ

      Volume: 9 Pages: e10445

    • DOI

      10.7717/peerj.10445

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Development of 34 microsatellite markers for the Ryukyu flying fox (Pteropus dasymallus)2020

    • Author(s)
      Taki Y, Vincenot CE, Sato Y, Inoue-Murayama M, Nakajima N
    • Journal Title

      Conservation Genetics Resources

      Volume: 12 Pages: 12-15

    • DOI

      10.1007/s12686-020-01148-6

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Primary and immortalized cell lines derived from the Amami rabbit (Pentalagus furnessi) and evolutionally conserved cell cycle control with CDK4 and Cyclin D12020

    • Author(s)
      Orimoto A, Katayama M, Tani T, Ito K, Eitsuka T, Nakagawa K, Inoue-Murayama M, Onuma M, Kiyono T, Fukuda T
    • Journal Title

      BBRC

      Volume: 525 Pages: 1046-1053

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.03.036

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Facial width-to-height ratio in chimpanzees: Links to age, sex and personality.2020

    • Author(s)
      Wilson V, Weiss A, Lefevre CE, Ochiai T, Matsuzawa T, Inoue-Muraya ma M, Freeman H, Herrelko ES, Altschul D
    • Journal Title

      Evolution and Human Behavior

      Volume: 41 Pages: 226-234

    • DOI

      10.1016/j.evolhumbehav.2020.03.001

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Follicular extracellular vesicles enhance meiotic resumption of domestic cat vitrified oocytes2020

    • Author(s)
      de Almeida Monteiro Melo Ferraz Marcia、Fujihara Mayako、Nagashima Jennifer Beth、Noonan Michael James、Inoue-Murayama Miho、Songsasen Nucharin
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 8619

    • DOI

      10.1038/s41598-020-65497-w

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Population history of the golden eagle inferred from whole-genome sequencing of three of its subspecies2020

    • Author(s)
      Sato Yu、Ogden Rob、Kishida Takushi、Nakajima Nobuyoshi、Maeda Taku、Inoue-Murayama Miho
    • Journal Title

      Biological Journal of the Linnean Society

      Volume: 130 Pages: 826-838

    • DOI

      10.1093/biolinnean/blaa068

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Genetic Signatures of Evolution of the Pluripotency Gene Regulating Network across Mammals2020

    • Author(s)
      Endo Yoshinori、Kamei Ken-ichiro、Inoue-Murayama Miho
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 12 Pages: 1806-1818

    • DOI

      10.1093/gbe/evaa169

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic Diversity and Genetic Structure of the Wild Tsushima Leopard Cat from Genome-Wide Analysis2020

    • Author(s)
      Ito Hideyuki、Nakajima Nobuyoshi、Onuma Manabu、Murayama Miho
    • Journal Title

      Animals

      Volume: 10 Pages: 1375-1375

    • DOI

      10.3390/ani10081375

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Gynaecological diagnosis by ultrasound and the measurement of urinary sex steroid hormones in female orangutans2020

    • Author(s)
      Kinoshita Kodzue、Nakamura Tomoyuki、Kimura Koichi、Shimizu Mika、Kuze Noko、Ozaki Yasuhiko
    • Journal Title

      Veterinary Medicine and Science

      Volume: 6 Pages: 612-616

    • DOI

      10.1002/vms3.237

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Seasonal variation in energy balance of wild Japanese macaques (Macaca fucata yakui) in a warm-temperate forest: a preliminary assessment in the coastal forest of Yakushima2020

    • Author(s)
      Kurihara Yosuke、Kinoshita Kodzue、Shiroishi Izumi、Hanya Goro
    • Journal Title

      Primates

      Volume: 61 Pages: 427-442

    • DOI

      10.1007/s10329-020-00797-3

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Key Male Glandular Odorants Attracting Female Ring-Tailed Lemurs2020

    • Author(s)
      Shirasu Mika、Ito Satomi、Itoigawa Akihiro、Hayakawa Takashi、Kinoshita Kodzue、Munechika Isao、Imai Hiroo、Touhara Kazushige
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 30 Pages: 2131-2138

    • DOI

      10.1016/j.cub.2020.03.037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 近赤外分光法を用いた動物の簡易かつ迅速な生理モニタリング法の開発について2020

    • Author(s)
      木下こづえ
    • Journal Title

      哺乳類科学

      Volume: 60 Pages: 297-305

    • DOI

      10.11238/mammalianscience.60.297

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Phylogenetic relationship of the Malayan tapir in Japan2021

    • Author(s)
      Qi Luan Lim, Geetha Annavi, Miho Inoue-Murayama
    • Organizer
      The 15th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Pair chemistry in golden eagles: relationship between MHC genes and breeding success2021

    • Author(s)
      Annegret M. Naito, Yu Sato, Miho Inoue-Murayama
    • Organizer
      The 15th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Preliminary characterization of personality and its genetic factors in two dog breeds2021

    • Author(s)
      Chika Zemmoto, Minori Arahori, Yuki Matsumoto, Miho Inoue-Murayama
    • Organizer
      The 15th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Getting basic information of wild animals through genetic approaches2021

    • Author(s)
      Miho Murayama
    • Organizer
      14th United Nations Congress on Crime Prevention and Criminal Justice
    • Invited
  • [Presentation] DNAメチル化解析によるネコ科年齢推定:予報2021

    • Author(s)
      斉 惠元, 木下 こづえ, 森 尚志, 大蔵 佳織, 松井 由希子, 村山 美穂
    • Organizer
      日本生態学会第68回全国大会
  • [Presentation] 相性は遺伝子で決まるのか:絶滅危惧種ニホンイヌワシのMHC遺伝子型と繁殖成績2021

    • Author(s)
      内藤アンネグレート 素, 佐藤悠, 前田琢, 井上剛彦,中嶋信美, 井上-村山美穂
    • Organizer
      日本生態学会第68回全国大会
  • [Presentation] 絶滅危惧種アマミノクロウサギ由来の無限分裂細胞及び体細胞クローンの作製2021

    • Author(s)
      福田智一、折本愛、片山雅史、谷哲弥、伊藤圭子、永塚貴弘、仲川清隆、村山美穂、大沼学、清野透
    • Organizer
      日本畜産学会 第 128 回大会
  • [Presentation] Examining the Possible Mechanisms and Adaptive Significance of Single and Multi-male Groups in Horse Societies2021

    • Author(s)
      Pinto P, Mendonca R, Ringhofer M, Kinoshita K, Hirata S
    • Organizer
      The 15th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Stress monitoring in captive koalas (Phascolartos cinereus) using urinary cortisol concentration2021

    • Author(s)
      Kinoshita K, Etsuko Miyakawa
    • Organizer
      The 15th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 野生ボルネオ・オランウータン(Pongo pygmaeus morio)の雌の妊娠と一斉結実との関係ー15年間の記録-2021

    • Author(s)
      久世濃子,金森朝子,山崎彩夏,田島知之,Renata Mendonca,蔦谷匠,木下こづえ, Peter Malim,Henry Bernard,幸島司郎
    • Organizer
      第74回日本人類学会大会
  • [Presentation] Genetic diversity of the endangered Japanese golden eagle2020

    • Author(s)
      Annegret M. Naito, Yu Sato, Taku Maeda, Takehiko Inoue, Miho Inoue-Murayama
    • Organizer
      The 14th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Genetic diversity of the Malayan tapir’s captive population in Japan2020

    • Author(s)
      Qi Luan Lim, Geetha Annavi, Miho Inoue-Murayama
    • Organizer
      The 14th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Preliminary Results of RNA-Seq Meta-Analysis Comparing Mouse and Grasscutter Tissue Expression2020

    • Author(s)
      Scott Jenkins, Atsushi Toyoda, Takushi Kishida, Tsuyoshi Koide, Christopher Adenyo, Boniface B. Kayang, Miho Inoue-Murayama
    • Organizer
      The 14th International Symposium on Primatology and Wildlife Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Ovarian tissue cryopreservation for female fertility preservation in wild animals2020

    • Author(s)
      Mayako Fujihara, Miho Inoue-Murayama
    • Organizer
      13th Asian Society of Conservation Medicine Virtual Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] MHC gene diversity of the endangered Japanese golden eagle: insights into immunity2020

    • Author(s)
      Annegret M. Naito, Yu Sato, Miho Inoue-Murayama
    • Organizer
      13th Asian Society of Conservation Medicine Virtual Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ゲノム情報を活用した野生動物の保全2020

    • Author(s)
      村山美穂
    • Organizer
      バーチャル研究会「生物多様性のDNA情報学~自然の計測と生命の理解のために」
    • Invited
  • [Presentation] Do macho horses have all the mojo? Examining testosterone concentrations in feral stallions2020

    • Author(s)
      Pinto P, Mendonca R, Ringhofer M, Kinoshita K, Hirata S
    • Organizer
      14th United Nations Congress on Crime Prevention and Criminal Justice
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ウガンダ共和国ブウィンディ原生国立公園におけるマウンテンゴリラの糞中グルココルチコイド濃度と観光の関係についての予備的な報告2020

    • Author(s)
      大塚 亮真,山越 言,木下こづえ
    • Organizer
      第36回日本霊長類学会大会
  • [Book] Resilience and Human History2020

    • Author(s)
      Miho Murayama
    • Total Pages
      231
    • Publisher
      Springer
    • ISBN
      978-981-15-4090-5
  • [Remarks] 保全生物学コンソーシアム

    • URL

      http://web.cc.iwate-u.ac.jp/~takehito/wild_animal/

  • [Remarks] 野生動物研究センター 村山研究室

    • URL

      http://miho-murayama.sakura.ne.jp/

URL: 

Published: 2023-12-25  

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