2021 Fiscal Year Annual Research Report
博物館資料の3Ｄ形態学：形状認識の定量化、高精度化、および展示公開への活用
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20H01381
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
佐々木 猛智 東京大学, 総合研究博物館, 准教授 (70313195)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鶴見 英成 東京大学, 総合研究博物館, 助教 (00529068)
野下 浩司 九州大学, 理学研究院, 助教 (10758494)
遠藤 秀紀 東京大学, 総合研究博物館, 教授 (30249908)
佐藤 圭 早稲田大学, 教育・総合科学学術院, 助教 (40780036)
西秋 良宏 東京大学, 総合研究博物館, 教授 (70256197)
上杉 健太朗 公益財団法人高輝度光科学研究センター, 分光推進室, 主席研究員 (80344399)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 博物館 / 形態学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、3次元(3D)形状データに注目した博物館収蔵標本の一層の有効活用、研究精度の向上、展示公開事業の発信の強化である。初年度は立ち上げのための実験に時間を使用したために作成したデータも少なかったが、本年度はルーチン化した作業に従って、多くのデータを取得することができた。形態データは、定量化し、タイプ分けや種の分類に使用した。生物系では形から種を分類したり、同定する研究に使用した。考古学分野では土器形態の3次元輪郭形状の解析を行った。例えば、古代アンデス土器を対象としてSfMを実施し、屈曲した注口や把手など、撮影の難しい特徴を持つ事例を中心に3Dモデル化のノウハウを検討した。特に、X線CTによって内部構造の解析を進めてきた、音の鳴る土器「笛吹きボトル」の検討を進め、3Dプリントレプリカを用いた教育プログラムを開発した。さらに、土器の形状に対して球面調和関数を用いた研究を行ったが、これは本年度の新規の研究である。博物館の展示では、スクールモバイルミュージアム 「鶏玩考」展(2021年11月8日～2022年3月31日)、「貝の不思議」展（2021年6月1日～10月2日）を開催し、展示会場で標本の3D映像を映写した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度はコロナウイルスによる影響は軽微であり、計画通りに研究を遂行することができた。博物館の展示も２件開催した。
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| Strategy for Future Research Activity |
次年度は、３Dデータの取得とかたちの定量化をさらに推進する。3Dデータの作成は、3Dスキャナ、フォトグラメトリ、X線CT、放射光CTを全て用いて行い、作業の効率化とルーチン化を目指す。データの解析には新しい手法開発も含めて行い、動物、植物、考古資料を対象に全ての分野で十分な量の研究成果の公表に努める。博物館の展示は２件を計画している。
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[Journal Article] Hydrophilic shell matrix proteins of Nautilus pompilius and the identification of a core set of conchiferan domains2021
Author(s)
Setiamarga, D. H. E., Hirota, K., Yoshida, M., Takeda, Y., Kito, K., Shimizu, K., Isowa, Y., Ikeo, K., Sasaki, T. and Endo, K.
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Journal Title
Genes
Volume: 12:1925
Pages: 1-16
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Population genetic structure of the pen shell Atrina pectinata sensu lato (Bivalvia: Pinnidae) throughout East Asia2021
Author(s)
Hashimoto, K., Yamada K., Sekino, M., Kobayashi, M., Sasaki, T., Fujinami, Y., Yamamoto, M., Choi, K. and Henmi, Y.
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Journal Title
Regional Studies in Marine Science
Volume: 48: 102024
Pages: 1-12
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Complete mitochondrial genome of the Pacific limpet Cellana nigrolineata (Gastropoda: Patellogastropoda) determined by shotgun sequencing using the Illumina NGS platform.2021
Author(s)
Nakashima, S., Shimizu, M., Hirota, K., Hiruta, S. F., Nakaji, N., Fujita, T., Sasaki, T. and Setiamarga, D. H. E.
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Journal Title
Mitochondrial DNA Part B
Volume: 6
Pages: 1857-1859
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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