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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Photon Upconversion Fluorescent Probe for Sequence Selective Detection/Imagine of Double-Stranded DNA

Research Project

Project/Area Number 20H02768
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

中野 幸二  九州大学, 工学研究院, 准教授 (10180324)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 石松 亮一  九州大学, 工学研究院, 助教 (90512781)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywords蛍光プローブ / フォトンアップコンバージョン / 二重鎖DNA / 分子イメージング / エピジェネティック
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、フォトンアップコンバージョン機構を組み込んだDNAプローブについて研究し、長波長の可視光で励起して短波長の蛍光で観察することができる分析法・イメージング法を実現する。今年度は、DNA二重らせん小溝に結合するピロール・イミダゾール・ポリアミド (Py-Im)プローブについて検討した。具体的には、前立腺ガンに関係する、ゲノムDNAに含まれるアンドロゲン受容体に対するプロモーター配列 (5'-WGWWCW-3', WはAまたはT)に選択的に結合するピロール・イミダゾール・ポリアミド (Py-Im)を基本骨格に選び、ドナー分子に白金-オクタエチルポルフィリン錯体 (PtOEP)、アクセプター分子にアントラセン (ANTH)を組み込んだ蛍光プローブの合成を計画した。このとき、1) マイクロ波加熱法と組み合わせたワンポット固相ペプチド合成による母核Py-Imの合成とANTH組み込み、それに続く2) 縮合剤や光クリック反応を利用したPtOEP組み込みという2ステップの反応を合成戦略とした。
現在までにPy-Im、およびANTH修飾Py-Imの合成が完了している。なおPtOEPは比較的かさ高く反応性が低いことが懸念されるので、PtOEPの組み込み位置、あるいはANTHの結合位置や導入数を種々変えて3種類の化合物を合成した。またこれらのPy-Im分子については、ターゲットとなる二重鎖DNAに対して十分な結合の親和性があることが確認できている。
これに対し、Py-ImへのPtOEPの組み込みが障害になっている。すなわち、PtOEPそのものは反応性置換基を含んでいないので、PtOEPをホルミル化、あるいはカルボキシル化してANTH修飾Py-Imとの反応を試みたが、目的化合物を得るには至っていない。これは、PtOEP誘導体がごく僅かしか得られないので、十分なスケールで実験することができず反応後の分離精製操作が課題になっているためである。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度は、フォトンアップコンバージョンプローブを合成するフェーズ1の研究期間に該当している。現状では最終化合物の1ステップ前の中間体しか得られていないので、やや計画に遅れが生じていることになる。しかし、この中間体は、当初計画の化合物よりもバリエーションを増やすことができている。また、フェーズ2の研究、すなわちターゲットになる二重鎖DNAとの結合反応の検討にも着手し、良好な結果を得ている。最大の懸案事項であったPy-Imへのドナー分子の導入についても、後述するように目処がたっており、種々検討を開始したところである。これらの成果を総合的に勘案して、本研究はおおむね順調に進展していると判断した。

Strategy for Future Research Activity

今年度の検討で最大の課題となったフォトンアップコンバージョンプローブに導入するドナー分子については、PtOEPに変えてコプロポルフィリンの白金錯体 (PtCOPRO)あるいはパラジウム錯体 (PdCOPRO)が利用できることが判明した。これらのドナー分子は、簡単な縮合反応で直接Py-Imに導入することができる。さらに、Pd錯体は対応するPt錯体よりもフォトンアップコンバージョン効率が高いのでより都合が良い。そこで、Py-Imとの反応では、PtOEPについて引き続き検討するとともに、PtCOPRO、およびPdCOPROの利用も検討する。これにより最終化合物の合成研究を加速する。また、フォトンアップコンバージョンプローブが得られ次第、フェーズ2の検討を開始する。Py-Im母核化合物、あるいはANTH修飾Py-Imを用いた先行実験のスキルを最大限に活用して実験に取り組む。

  • Research Products

    (6 results)

All 2021 2020 Other

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Direct Electron Transfer Reaction of Cytochrome c Immobilized on a Bare ITO Electrode2021

    • Author(s)
      Matsuda Naoki, Okabe Hirotaka, Nagamura Toshihiko, Nakano Koji
    • Journal Title

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      Volume: 94 Pages: 433~439

    • DOI

      10.1246/bcsj.20200192

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Covalent Hyperbranched Polymer Self-Assemblies of Three-Way Junction DNA for Single-Molecule Devices2020

    • Author(s)
      Nakano Koji, Sawada Takafumi, Mori Yoshifumi, Morita Kohei, Ishimatsu Ryoichi
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 36 Pages: 10166~10174

    • DOI

      10.1021/acs.langmuir.0c01621

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enzyme-linked immunosorbent assay based on light absorption of enzymatically generated aniline oligomer: Flow injection analysis for 3-phenoxybenzoic acid with anti-3-phenoxybenzoic acid monoclonal antibody2020

    • Author(s)
      Ishimatsu Ryoichi, Shimizu Shinichi, Hongsibsong Surat, Nakano Koji, Malasuk Chacriya, Oki Yuji, Morita Kinichi
    • Journal Title

      Talanta

      Volume: 218 Pages: 121102~121102

    • DOI

      10.1016/j.talanta.2020.121102

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ペルオキシダーゼ活性を持つペプチド核酸モノリスハイブリッドーPNAzymeの合成と遺伝子センシング応用2020

    • Author(s)
      中野幸二,田邊潤壱,石松亮一
    • Organizer
      日本分析化学会第70年会
  • [Presentation] ピレスロイド系殺虫剤の体内代謝物である3-phenoxybenzoic acid検出に向けたフローインジェクションELISA法の開発2020

    • Author(s)
      石松亮一,清水慎一,中野幸二
    • Organizer
      日本分析化学会第70年会
  • [Remarks] 九州大学大学院工学研究院応用化学部門 化学環境工学講座 研究紹介

    • URL

      http://www.cstf.kyushu-u.ac.jp/~chemenvironlab/detail.html

URL: 

Published: 2021-12-27  

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