2022 Fiscal Year Annual Research Report
Understanding Cellular Function with Short RNAs and Small Molecules
| Project/Area Number |
20H02859
|
|---|
| Research Institution | Kyoto University |
|---|
Principal Investigator |
佐藤 慎一 京都大学, 化学研究所, 准教授 (70534478)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
萩原 正規 弘前大学, 理工学研究科, 准教授 (40403000)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
|
| Keywords | 機能性RNA / 核酸 / 小分子化合物 / ケミカルバイオロジー |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では，採択者が開発した「機能性RNAと小分子化合物」を研究ツールとして利用し，タンパク質の機能発現機構の解析を目指した．具体的には次の2つの研究課題を提案した．
課題①：小分子化合物とRNAツールによる内在性タンパク質の生細胞内動態解析法の創出
課題②：小分子化合物によるRNA G-quadruplexの網羅的探索とビッグデータ基盤構築
【課題①】内在性タンパク質の生細胞内動態解析法の創出；課題①の研究内容は，20塩基からなるランダム配列をアーム部位に配置したRNAライブラリーからin vitro selectionで選出したタンパク質標的アプタマーを利用して，生細胞内の内在性タンパク質の動態観察を目指したものである．課題①は，目標を達成することができ，国際的科学論文へ報告した (Nucleic Acids Research, 49(22), e132, 2022 IF=16.971)．
【課題②】 RNA G-quadruplexの網羅的探索とビッグデータ基盤構築；採択者が開発したRGB-1を利用することにより新たに発見したRNA G-quadraplex構造を解析した結果について，国際的科学論文へ報告した(Nucleic Acids Research, 50(14), 8143-8153, 2022 IF=19.160)．またRNA G-quadruplexの網羅的探索のためのビッグデータ取得のため，RNA seq.とプロテオーム解析を行った．最終年度には，２つのビッグデータを組み合わせた再解析を行い， mRNA上に存在し，タンパク質翻訳に影響を与えるRNA G-quadruplexを網羅的に見出した．現在，二つのビッグデータから導き出されたRNA G-quadruplexの機能を解析することで，本方法の有効性を示した結果について，国際的科学論文に投稿準備中である．
|
| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
|
