2022 Fiscal Year Annual Research Report
Molecular basis underlying color pattern diversification through chromosomal inversions within a single gene
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20H03003
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
安藤 俊哉 京都大学, 白眉センター, 特定准教授 (10709744)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
新美 輝幸 基礎生物学研究所, 進化発生研究部門, 教授 (00293712)
藤本 章晃 岩手大学, 農学部, 特任助教 (10868102)
佐原 健 岩手大学, 農学部, 教授 (30241368)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | ナミテントウ / 染色体逆位 / エピジェネティクス / ゲノム編集 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、1.pannier遺伝子座周辺のエンハンサー推定、2.ゲノム編集によるエンハンサー領域の機能解析、3.pannierのエンハンサーに入力を送る上流の遺伝子制御ネットワーク(GRN)の解明を目指して、研究を進めてきた。
今年度は、1.のエンハンサーの推定の一環としてクロマチンの三次元構造を推定する次世代シークエンス手法（Hi-C法）の検討を行った。前年度に確立した夾雑物を除去する方法を用いて、テントウムシの蛹から核サンプルを回収し、Hi-C法の解析を進めた。その結果、発生期においてpannier遺伝子周辺に特徴的なクロマチン３次元構造（Topologically Associating Domain/TAD）と、pannierの転写制御に重要と推測されるTAD内の特徴的な染色体間相互作用を見出した。また、異なる斑紋系統間でpannier遺伝子座周辺のクロマチン構造の比較解析を行うための核抽出サンプリングを進めた。2.に関しては、エンハンサー欠失系統を作出し、斑紋形成に必要な制御領域の絞り込んだ。3.に関しては、斑紋サイズの雌雄差形成に関わるpannierの上流制御因子候補として、転写因子遺伝子doublesexを見出し、雄において斑紋サイズを負に制御することを明らかとした。
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| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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