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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Rice NLR genes, their function and evolution

Research Project

Project/Area Number 20H05681
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

寺内 良平  京都大学, 農学研究科, 教授 (50236981)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 藤崎 恒喜  公益財団法人岩手生物工学研究センター, 園芸資源研究部, 主任研究員 (30626510)
阿部 陽  公益財団法人岩手生物工学研究センター, ゲノム育種研究部, 主席研究員 (80503606)
清水 元樹  公益財団法人岩手生物工学研究センター, ゲノム育種研究部, 主任研究員 (90734343)
Project Period (FY) 2020-08-31 – 2025-03-31
Keywords植物ー病原菌相互作用 / 共進化 / イネ / いもち病 / 抵抗性 / エフェクター
Outline of Annual Research Achievements

(1)英国Banfield教授グループと共同研究を実施し、Pikp-1のIDであるHMAドメインをsHMA1の配列と交換することによりPik-1 NLRをエンジニアし、エフェクター認識範囲の拡大に成功した。
(2)イネ属植物167系統からPias-1/Pia遺伝子領域のゲノム配列を獲得し、Helper NLRおよびSensor NLRの配列を比較した。Sensor NLRのIDが極めて多様で、栽培イネを含むAゲノムに属する種では、IDとしてHMAとDUF761が高い頻度で観察された。
(3) AVR-Pikの宿主標的であるsHMAタンパク質の機能解明を進めた。イネsHMA遺伝子のKOを実施したところ、AVR-Pikと結合するsHMA2遺伝子のKOにより、親和性いもち病菌株の罹病性が低下した。イネsHMAの一部は、いもち病菌感染にとって重要な罹病性因子であり、AVR-PikはsHMAに結合して安定化することを示した。またPikアリルの中で、これまで対応する非病原力エフェクターが未同定であったPikSが認識する新規のイネいもち病菌のエフェクター(Mgk1)を同定した。Mgk1はAVR-Pikと一次構造は異なるが、PikのID(HMAドメイン)と相互作用する。
(4) Y2HやAlphaScreenによる解析の結果、Pii-2はIDであるNOIドメインを介してOsExo70F2/F3と複合体を形成し、OsExo70F2/F3と結合するAVR-Piiと間接的に相互作用すること、またAVR-PiiがこのPii-2ーOsExo70F2/F3複合体を解離させることを示した。
(5)イネ組換え近交系(RILs)に多数のいもち病菌株を接種して抵抗性/感受性を検定した。この結果、現在までに3個のNLR候補を同定し、これらが認識するいもち病菌AVRも3個同定した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初計画に予定した研究が順調に進行していると判断する。

Strategy for Future Research Activity

(1)Pik NLRエンジニアリングは、ほぼ所期の目的を達成したので、論文公表する。PikおよびPiaのペアーNLRの複合体構造解析の可能性を検討する。
(2)Pias/AVR-Piasの直接結合の確認を、共免疫沈降法、AlphaScreen法により実施し、PiaとPiasのSensor NLRのID交換によるAVR認識特異性の交換実験をふまえ、任意のIDを挿入しても機能するようなPias/Pia Sensor NLRとHelper NLRの骨格(scaffold)のエンジニアリングに着手
(3)イネsHMA遺伝子の機能解明、イネRIN4タンパク質の機能解明。RIN4/Exo70相互作用とAVR-Piiの病原作用の解明、イネDUF761タンパク質の機能解明を進める。
(4)新規に単離同定されたイネNLR-いもち病菌AVRの相互作用を解明する。

  • Research Products

    (9 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 6 results) Presentation (2 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] The Sainsbury Laboratorya/John Innes Centre(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      The Sainsbury Laboratorya/John Innes Centre
  • [Journal Article] Functional diversification gave rise to allelic specialization in a rice NLR immune receptor pair2021

    • Author(s)
      De la Concepcion Juan Carlos、Vega Benjumea Javier、Bialas Aleksandra、Terauchi Ryohei、Kamoun Sophien、Banfield Mark J
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 10 Pages: 1-10

    • DOI

      10.7554/eLife.71662

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A single amino acid polymorphism in a conserved effector of the multihost blast fungus pathogen expands host-target binding spectrum2021

    • Author(s)
      Bentham Adam R.、Petit-Houdenot Yohann、Win Joe、Chuma Izumi、Terauchi Ryohei、Banfield Mark J.、Kamoun Sophien、Langner Thorsten
    • Journal Title

      PLOS Pathogens

      Volume: 17 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1009957

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Two NLR immune receptors acquired high-affinity binding to a fungal effector through convergent evolution of their integrated domain2021

    • Author(s)
      Bia?as Aleksandra、Langner Thorsten、Harant Adeline、Contreras Mauricio P、Stevenson Clare EM、Lawson David M、Sklenar Jan、Kellner Ronny、Moscou Matthew J、Terauchi Ryohei、Banfield Mark J、Kamoun Sophien
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 10 Pages: 1-10

    • DOI

      10.7554/eLife.66961

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A genetically linked pair of NLR immune receptors show contrasting patterns of evolution2021

    • Author(s)
      Shimizu Motoki、Hirabuchi Akiko、Sugihara Yu、Abe Akira、Takeda Takumi、Kobayashi Michie、Hiraka Yukie、Kanzaki Eiko、Oikawa Kaori、Saitoh Hiromasa、Langner Thorsten、Banfield Mark J.、Kamoun Sophien、Terauchi Ryohei
    • Journal Title

      birRxiv

      Volume: 1 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1101/2021.09.01.458560

    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] RIL-StEp: epistasis analysis of rice recombinant inbred lines reveals candidate interacting genes that control seed hull color and leaf chlorophyll content2021

    • Author(s)
      Sakai Toshiyuki、Abe Akira、Shimizu Motoki、Terauchi Ryohei
    • Journal Title

      G3 Genes|Genomes|Genetics

      Volume: 11 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1093/g3journal/jkab130

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Multiple variants of the fungal effector AVR-Pik bind the HMA domain of the rice protein OsHIPP19, providing a foundation to engineer plant defense2021

    • Author(s)
      Maidment Josephine H.R.、Franceschetti Marina、Maqbool Abbas、Saitoh Hiromasa、Jantasuriyarat Chatchawan、Kamoun Sophien、Terauchi Ryohei、Banfield Mark J.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 296 Pages: 100371~100371

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2021.100371

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] イネNLR型抵抗性遺伝子の機能と進化2022

    • Author(s)
      寺内良平
    • Organizer
      ファイトジーンの可能性と未来XIII 香川大学農学部 植物ゲノム・遺伝子源解析センター (2022.3.7)
    • Invited
  • [Presentation] イネのいもち病抵抗性: paired NLR遺伝子の機能と進化2022

    • Author(s)
      寺内良平
    • Organizer
      第37回資源植物科学シンポジウム及び第13回植物ストレス科学研究シンポジウム 「夢が広がる新植物の作出へ」 岡山大学資源植物科学研究所 (2022.3.1)
    • Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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