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2021 Fiscal Year Research-status Report

Mitochondrial shape determination mechanism with phosphorylation and dephosphorylation process

Research Project

Project/Area Number 20K06730
Research InstitutionKurume University

Principal Investigator

太田 啓介  久留米大学, 医学部, 教授 (00258401)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 広重 佑  久留米大学, 医学部, 助教 (50647782)
都合 亜記暢  久留米大学, 医学部, 技能職員 (80569517)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2023-03-31
Keywordsミトコンドリア / リン酸化
Outline of Annual Research Achievements

ミトコンドリアは細胞の種類によって様々な独特の形を持っているが、その形がどの様に維持され、どの様にコントロールされているのかは明らかではない。我々はミトコンドリアがCCCP等の脱共役処理により、伸長したいわゆるミトコンドリアらしい長細い形から、球体(スフェロイド)、より正確には壺状へと急速に移行することを示してきた(Miyazono,2018)。この変形機序にリン酸化脱リン酸化が関わると予想し、その機構を明らかにすることが本研究の目的である。
本課題では、これまでにリン酸化・脱リン酸化阻害剤投与により、この形態変化に影響が及ぼされることを確認してきているが、現在、PINK1-perkinの系に注目し、PINK1のRNAiにより、その形態変化への影響を評価し、この系がミトコンドリア形態に及ぼす影響を評価している。
近年、パーキンソン病患者由来(PRKN遺伝子に異常が確認された)細胞において、CCCP処理によるスフェロイド形成が抑制されていることが報告されている(Yokota, Molecular Brain 58 (14)2021 )。PRKNがコードするPerkinは、ミトコンドリアマイトファジーの系に関わる。脱共役にともなうPINK1のリン酸化とミトコンドリアへの集積によって初めてミトコンドリアにリクルートされることが知られており、これがマイトファジーを誘導する起点となる。PINK1-perkinの系はこのマイトファジーに関わるだけでなく、ミトコンドリア形態にも影響することを示唆するものであり、本課題で取り組んでいる結果とも密接に関わることが予想される。
ミトコンドリアの形は細胞種間で厳密にコントロールされているが、そもそもなぜ長細い、いわゆるソーセージのような形をしているのか、どうして細胞間で異なる形をしているのか、その本質は明らかになっていない。今回の結果はこれらの疑問に対して一つの答えにつながるものと期待している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

昨年、条件の安定化に時間がかかっていたリン酸化阻害剤、脱リン酸化阻害剤の影響については昨年に引き続き行い、経路の絞り込みを進めている。ただ、反応が予想よりクリティカルではなく、候補遺伝子の確定に至らない可能性もある。しかし、関連する経路の推定ができるところまでは進められるよう計画している。
一方、iRNAについては、PINK1についてiRNAを作成し、培養細胞系においてその影響をテストをしている。発現量の抑制のチェック等を行いまとめている過程であり、継続中である。

Strategy for Future Research Activity

RNAiによる影響,また阻害剤による影響については、電子顕微鏡下での評価を目指し次年度当初から試料作製を行う。評価項目は、当初はLive-3D-CLEM法としていたが、反応が環境変化に対して鋭敏であることを鑑み、一定時間での固定時の状況判断とし、Live imagingは行わない方針に変更する。しかし、得られる結果に対しては当初予定とかわからない結論が得られるものと考えている。
一方、これに加え、より広範な解析ができる、SEM広域CLEM観察を予定する。今回の反応が、予想よりも明確ではないため、統計的処理が必要となると考えられるためである。広域CLEM法は、培養細胞を固定後、広範囲に光顕観察し、その構造を電子顕微鏡化に相関観察する方法で、我々の研究センターではその基本技術を既に確立している。これにより、微細形態の詳細を解析するもので、3D-CLEM法では達成できないn数を稼ぐことにより、統計的変化を捉えることで、本研究の目的達成を図る。

Causes of Carryover

siRNAの種類を予定より少なくしたことに伴い、支出を減額した。一方で、次年度の電子顕微鏡解析は当初予定よりも、項目を増やす予定にしており、これに充当する予定である。

  • Research Products

    (12 results)

All 2022 2021

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 4 results)

  • [Journal Article] 試料包埋用樹脂の電子線ダメージによる変形2022

    • Author(s)
      太田 啓介, 都合 亜記暢
    • Journal Title

      顕微鏡

      Volume: 57 Pages: 13-17

    • DOI

      10.11410/kenbikyo.57.1_17

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Morphological analysis of interstitial cells in murine epididymis using light microscopy and transmission electron microscopy.2021

    • Author(s)
      Hiroshige T, Uemura KI, Hirashima S, Hino K, Togo A, Ohta K, et al.
    • Journal Title

      Acta Histochem.

      Volume: 123 Pages: 151761

    • DOI

      10.1016/j.acthis.2021.151761

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reducing human operation time to obtain a segmentation learning model for volume electron microscopy using stepwise deep learning with manual correction2021

    • Author(s)
      Konishi K, Nonaka T, Takei S, Ohta K, Nishioka H, Suga M.
    • Journal Title

      Microscopy (Oxf).

      Volume: 70 Pages: 526-535

    • DOI

      10.1093/jmicro/dfab025

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 観えないものを観えるように2021

    • Author(s)
      太田啓介
    • Journal Title

      久留米医学会雑誌

      Volume: 84 Pages: 165-174

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 真皮内異種間細胞性コンタクトの光電子相関(CLEM)観察2022

    • Author(s)
      山田晋也、太田啓介
    • Organizer
      第127回日本解剖学会全国学術集会
  • [Presentation] Making the invisible visible2021

    • Author(s)
      太田啓介
    • Organizer
      第75回久留米医学会学術講演会
    • Invited
  • [Presentation] Deep learningによるArray tomograpohyデータからの細胞核抽出とその形態的特徴解析2021

    • Author(s)
      須賀三雄 、小西功記 、前田光代 、野中崇雄 、武居俊輔 、 久米慧嗣 、西岡秀夫 、片岡洋祐 、太田啓介
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第77回学術講演会
  • [Presentation] In vitro におけるコラーゲン線維配向性の定量解析2021

    • Author(s)
      平嶋伸悟、太田啓介、金澤知之進、都合亜記暢、常吉梨沙、宮園佳宏 、楠川仁悟、 中村桂一郎
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第77回学術講演会
  • [Presentation] 段階的な深層学習を用いた顕微鏡画像のセグメンテーションにおける手作業量の低減2021

    • Author(s)
      小西功記 、野中崇雄 、武居俊輔 、太田啓介 、西岡秀夫 、須賀三雄
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第77回学術講演会
  • [Presentation] 細胞のソーシャルディスタンス?3次元空間で観る細胞同士の関係性.2021

    • Author(s)
      太田啓介
    • Organizer
      第47会皮膚かたち研究会
    • Invited
  • [Presentation] 電子顕微鏡三次元ボリュームデータの後処理, セグメンテーションと解析2021

    • Author(s)
      太田啓介
    • Organizer
      日本顕微鏡学会 ソフトマテリアル分科会
    • Invited
  • [Presentation] SEM電顕ボリューム解析で観る組織・細胞・オルガネラ そこから見えてくるもの2021

    • Author(s)
      太田啓介
    • Organizer
      第64回顕微鏡シンポジウム
    • Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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