Detection of epitope using native structure of a membrane protein

2022 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 20K06959
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related
• Research Institution: National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition
• Principal Investigator: Ise Tomoko 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 創薬デザイン研究センター, プロジェクト研究員 (20771900)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 抗体 / エピトープ / 膜抗原 / 競合結合阻害 / フローサイトメトリー

Outline of Final Research Achievements

To effectively select antibodies that exhibit desirable functions as therapeutic antibodies, it is important to quickly analyze the antibody binding sites (epitopes) of the obtained antibodies and identify epitopes that correlate with their functions. However, it is technically challenging to use the native higher-order structure of membrane antigens expressed on biological membranes for conventional epitope identification methods because it requires much labor and time, such as antibody purification and labeling. In this study, using flow cytometry using fluorescent beads, we developed a novel epitope identification method that can detect competitive inhibition of antibody binding to the native structure of membrane antigens expressed on biological membranes, which has been difficult to date.

Free Research Field

免疫学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

高次構造が保たれている天然膜抗原を発現させた細胞を用いたフローサイトメトリーにより、その抗原に結合する抗体を未精製、未標識の状態で用いても行え、しかも、膜抗原に普遍的に応用できる可能性がある新しいエピトープ同定法を開発した。これにより、従来の方法では多大な時間と労力を要していた、高次構造に基づいたエピトープグループの同定を、抗体取得の早い段階で容易にできるようになることが期待される。高次構造があって初めて現れるエピトープグループは、その膜抗原において重要な機能に関連している可能性があり、この点においても新しい治療抗体開発への貢献が期待できる。