2022 Fiscal Year Research-status Report
Risk and prediction of tick-borne diseases based on migration and dispersal of host animals
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20K07471
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
沢辺 京子 国立感染症研究所, 昆虫医科学部, 主任研究官 (10215923)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
駒形 修 国立感染症研究所, 昆虫医科学部, 主任研究官 (20435712)
糸川 健太郎 国立感染症研究所, 薬剤耐性研究センター, 主任研究官 (70769992)
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| Project Period (FY) |
2020-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | マダニ / 重症熱性血小板減少症候群 / 宿主動物 / 生息環境 / リスクマップ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、マダニ媒介ウイルスによる極めて重篤な人獣共通の新興・再興感染症であるSFTSに注目した。自然界でのSFTSウイルスの感染環を推察し、ヒトの健康影響へのリスク評価ならびに発生予測に資することを目的としたものである。具体的には、媒介節足動物（マダニ）、その宿主動物（イノシシ、シカ、ネズミ、アライグマ等）、環境要因（森林面積、人工林面積、農地、平均気温、年降水量等）、SFTS患者、SFTSウイルス等病原体情報の4つの要素を包括的に解析し、SFTSを含むダニ媒介感染症発生のリスクマップ作製を行う。
本年度初めはまだCOVID-19の収束が見られなかったため、予定した計画は遂行できなかったが、主な成果は以下のとおりである。
１）以前にマダニの生息調査を行った兵庫県T市において追加調査を行い、マダニの種構成ならびに保有ウイルスの検出を行った。
２）すでに登録されているSFTS患者および病原体の情報収集に努めたが、患者情報の入手が困難であった。しかし、国立感染症研究者が収集しているNESID情報の一部利用を検討し、情報収集の準備を進めている。入手出来次第SFTSの発生リスクの検討を試みる。
３）マダニの一塩基多型を調べるためのハイブリダイゼーションキャプチャプローブのデザインを行った。プローブの配列として以下の点を考慮した。①単一のプローブセットで複数種の解析を行えるように塩基レベルで種間の保存性が高いこと②遺伝子の喪失が無く異なるマダニ種で安定的に存在する配列であること③ゲノム中に一コピーのみ存在し進化の過程でコピー数の変化が起きていないと考えられる配列であること。現在、アクセス可能なマダニ種のゲノムアセンブリを比較した結果、約2,000ヶ所の上記の条件に合致する座位を発見し、それらからそれぞれプローブをデザインした。R5年度はこのプローブセットの性能評価を行う予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
R4年度初めはまだCOVID-19の収束が見られなかったため、追加の野外調査が計画通りに実施できなかった。また、国立感染症研究所の感染症発生動向調査(NESID)に登録された情報からSFTS患者情報の入手を検討したが、研究期間内に間に合わせることができなかったため、来年度の期間延長を許可いただいた。
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| Strategy for Future Research Activity |
R5年度は、リスクマップを作成する地域をまず選定し、個別にその地域の患者情報の提供を該当する自治体に依頼する方針に切り替え、NESID情報を一部利用し、SFTS患者情報の入手を可能にする。さらに、野生動物の出没情報、環境情報等も加味して、地域に限定的ではあるが、リスクマップを完成させる予定である。
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| Causes of Carryover |
本年度もCOVID-19感染拡大の影響で予定した追加調査が実施できなかったため、補足データを取ることができなかった。また、NECIDの情報が研究期間内に利用できず、解析を進めることができなかった。
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[Journal Article] Kobayashi D, Kuwata R, Kimura T, Faizah AN, Higa Y, Hayashi T, Sawabe K, Isawa H. Detection of quaranjavirus-like sequences from Haemaphysalis hystricis ticks collected in Japan2022
Author(s)
Kobayashi D, Kuwata R, Kimura T, Faizah AN, Higa Y, Hayashi T, Sawabe K, Isawa H
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Journal Title
Japanese Journal of Infectious Diseases
Volume: 75
Pages: 195-198
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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