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2022 Fiscal Year Research-status Report

遺伝子変異検出から予後予測へつなぐ画像生検の開発

Research Project

Project/Area Number 20K08084
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

有村 秀孝  九州大学, 医学研究院, 教授 (20287353)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 田中 謙太郎  九州大学, 医学研究院, 准教授 (00536849)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywords画像不変量 / 画像生検法 / ベッチ数特徴量 / EGFRサブタイプ分類 / 再発予測
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、臨床応用に向けた画像生検法の改良研究を行うことで、非小細胞肺がん(NSCLC)のEGFR変異に対応する画像不変特徴量を明らかにし、非侵襲的画像生検法を開発することである。さらに、EGFR-TKI投与後の予後を治療前の画像から予測する方法を開発する。
2022年度はNSCLCの上皮成長因子受容体(EGFR)Del19およびL858R変異のサブタイプのトポロジー特性を明らかにするために、3次元(3D)トポロジー不変ベッチ数(BN)を用いた新しいレディオゲノミクス法を開発した。3DBNモデルの実現可能性を、擬似3次元BN(p3DBN)、2次元BN(2DBN)、CTおよびウェーブレット分解(WD)画像に基づく従来のレディオミクスモデルと比較検討した。M分類とS分類において、3DBNを用いた手法が最も良い正確度を示した。EGFR Del19/L858R変異のサブタイプの特徴と放射線医学的な関連を示した3DBN特徴は,従来の特徴と比較してサブタイプ分類の精度を向上させることができた。
さらに、定位切除放射線治療(SABR)による治療前のI期NSCLC患者の治療計画CT画像において、局所再発(LRR)と遠隔転移(DM)に関連するトポロジカルシグネチャーの予測可能性を研究した。従来のウェーブレットベースの特徴量(WF)、トポロジーベースの特徴量(原画:BF、反転画像:iBF)、およびそれらを組み合わせた特徴量(BWF、iBWF)の再発予測能を比較した。LRRについては、iBF、iBWF、WFが統計的に有意な差を示し(P<0.05)、iBFで最も高いnLPCが得られた。DMについては、iBWFが有意差を示し、最も高いnLPCが得られた。iBFは、SABRを受ける前のステージI NSCLC患者のLRRとDMの予測を改善する可能性を示した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は以下の2つの英語論文を出版できたため、概ね順調である。
(1)3次元トポロジー不変ベッチ数を用いた肺がんのEGFRサブタイプ分類において新しいレディオゲノミクス法を明らかにし、英語論文を出版した。(Ninomiya K, Arimura H, et al. Three-dimensional topological radiogenomics of epidermal growth factor receptor Del19 and L858R mutation subtypes on computed tomography images of lung cancer patients. Computer Methods and Programs in Biomedicine 2023, 2023年4月7日採択. IF=7.0)
(2)定位切除放射線治療(SABR)による治療前のI期NSCLC患者の治療計画CT画像において、局所再発(LRR)と遠隔転移(DM)に関連するトポロジカルシグネチャーの予測可能性に関する英語論文を出版した。(Kodama T, Arimura H, et al. Relapse predictability of topological signature on pretreatment planning CT images of stage I non-small cell lung cancer patients before treatment with stereotactic ablative radiotherapy. Thorac Cancer. 2022;13(15):2117-2126. IF=3.2)

Strategy for Future Research Activity

今後は、腫瘍細胞成長モデルの微分方程式を数学的に解析する手法を開発することで、腫瘍細胞成長モデルを用いた肺癌のEGFR-TKI治療の予後予測法の研究を行う。

Causes of Carryover

2023年度にオープンアクセスの英語論文の掲載料と国内外の出張旅費に使用するため。

  • Research Products

    (8 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] マラヤ大学(マレーシア)

    • Country Name
      MALAYSIA
    • Counterpart Institution
      マラヤ大学
  • [Journal Article] Three-dimensional topological radiogenomics of epidermal growth factor receptor Del19 and L858R mutation subtypes on computed tomography images of lung cancer patients2023

    • Author(s)
      Ninomiya Kenta、Arimura Hidetaka、Tanaka Kentaro、Chan Wai Yee、Kabata Yutaro、Mizuno Shinichi、Gowdh Nadia Fareeda Muhammad、Yaakup Nur Adura、Liam Chong-Kin、Chai Chee-Shee、Ng Kwan Hoong
    • Journal Title

      Computer Methods and Programs in Biomedicine

      Volume: Epub ahead of print Pages: 107544~107544

    • DOI

      10.1016/j.cmpb.2023.107544

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Topology-based radiomic features for prediction of parotid gland cancer malignancy grade in magnetic resonance images2023

    • Author(s)
      Ikushima Kojiro、Arimura Hidetaka、Yasumatsu Ryuji、Kamezawa Hidemi、Ninomiya Kenta
    • Journal Title

      Magnetic Resonance Materials in Physics, Biology and Medicine

      Volume: Epub ahead of print Pages: 1-11

    • DOI

      10.1007/s10334-023-01084-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recurrence prediction with local binary pattern-based dosiomics in patients with head and neck squamous cell carcinoma2022

    • Author(s)
      Kamezawa Hidemi、Arimura Hidetaka
    • Journal Title

      Physical and Engineering Sciences in Medicine

      Volume: 46 Pages: 99~107

    • DOI

      10.1007/s13246-022-01201-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dual segmentation models for poorly and well-differentiated hepatocellular carcinoma using two-step transfer deep learning on dynamic contrast-enhanced CT images2022

    • Author(s)
      Nagami Noriyuki、Arimura Hidetaka、Nojiri Junichi、Yunhao Cui、Ninomiya Kenta、Ogata Manabu、Oishi Mitsutoshi、Ohira Keiichi、Kitamura Shigetoshi、Irie Hiroyuki
    • Journal Title

      Physical and Engineering Sciences in Medicine

      Volume: 46 Pages: 83~97

    • DOI

      10.1007/s13246-022-01202-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Relapse predictability of topological signature on pretreatment planning <scp>CT</scp> images of stage I non‐small cell lung cancer patients before treatment with stereotactic ablative radiotherapy2022

    • Author(s)
      Kodama Takumi、Arimura Hidetaka、Shirakawa Yuko、Ninomiya Kenta、Yoshitake Tadamasa、Shioyama Yoshiyuki
    • Journal Title

      Thoracic Cancer

      Volume: 13 Pages: 2117~2126

    • DOI

      10.1111/1759-7714.14483

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Topological prediction models for relapse of stage I patients with non-small cell lung cancer prior to stereotactic ablative radiotherapy2023

    • Author(s)
      Takumi Kodama, Hidetaka Arimura, Yuko Shirakawa, Kenta Ninomiya, Tadamasa Yoshitake, Yoshiyuki Shioyama
    • Organizer
      SPIE Medical Imaging 2023, San Diego
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] http://www.shs.kyushu-u.ac.jp/~arimura/

URL: 

Published: 2023-12-25  

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