膵・胆道癌における染色体不安定性を標的とした革新的診断・免疫治療法の開発

2021 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 20K09047
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 林 洋毅 東北大学, 医学系研究科, 大学院非常勤講師 (30422124)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 畠 達夫 東北大学, 医学系研究科, 大学院非常勤講師 (30806237) ; 青木 修一 東北大学, 大学病院, 助教 (30844451)
• Project Period (FY): 2020-04-01 – 2023-03-31
• Keywords: 胆管癌

Outline of Annual Research Achievements

近年の大規模な全ゲノム・エクソームシーケンスの解析や免疫チェックポイント阻害剤の隆盛に伴い、key drugの少ない胆道癌についても新規治療への光明が見出されるようになった。ゲノムプロファイルに基づくIDH阻害剤やFGFR阻害剤の安全性・有効性が蓄積されるに伴い、限定的なpopulationであるが、分子標的治療の奏功により治療成績の向上が期待される症例が増加していくものと思われる。
胆管癌については、肝内胆管癌、胆嚢癌、肝外胆管癌のそれぞれが異なる遺伝子変異プロファイルを有し、前述のごとく、肝内胆管癌についてはIDH1遺伝子やFGFR融合遺伝子が分子標的治療候補となりうるものの、胆道癌で最も多い肝外胆管癌はこれらの遺伝子異常おの頻度が相対的に低いとされ、分子標的治療薬の適応となる症例は極めて限定的である。これらの課題を克服するべく、癌種特異的な遺伝子異常を標的とするこれまでの診断・治療のアプローチとは異なる、本研究では悪性形質転換を引き起こした、いわゆる“癌化”した細胞特有に生じるテロメア異常に着目した。
現在、ハイスループット解析を可能とすべく、「デジタルPCRをさらにデジタル化する」というコンセプトのもと、テロメア融合DNAを高感度に検出するため、特に膵癌でクロモスリプシスの好発部位と報告されている18番染色体に着目して、サブテロメア領域のプライマーとプローブの条件設定、PCR反応条件などについて詳細な条件検討を行っているところである。サブテロメア領域は反復配列が多く、高感度を担保しつつPCRの再現性を確認するため、ポジコンとネガコンのプラスミド作製も同時進行で行っている。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

サブテロメア領域には反復配列が多く、再現性を持って特異的な増幅を得るための条件検討にやや時間を要している状況である。また、NCBIデータベースも時折配列のupdateを行っているようで、いくつかのprimer/probeを再設定する必要性が生じた。

Strategy for Future Research Activity

複数の染色体末端を標的としたマルチプレックス解析を行うと再現性がさらに低下することが明らかとなり、染色体末端を1ペアごとに解析を行う方針とする。前年度に言及したごとく、膵癌でchromothripsisの好発部位とされる18番染色体に標的を絞って、可及的速やかに反応系を確立させ、多検体解析に移行する予定である。