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2022 Fiscal Year Research-status Report

Development of statistical analysis methods for visualizing nonlinear activity of large-scale neural populations

Research Project

Project/Area Number 20K11709
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

島崎 秀昭  京都大学, 情報学研究科, 准教授 (50587409)

Project Period (FY) 2020-04-01 – 2024-03-31
Keywords状態空間モデル / イジングモデル / 神経スパイクデータ
Outline of Annual Research Achievements

本研究は,脳が有する外界のモデルを実験データから明らかにするための基盤的な統計解析技術として,時間変動する神経細胞集団の発火頻度と相関構造を逐次推定する技術として我々がこれまでに構築した【状態空間-イジングモデル】を発展させ,より大規模・非線形な神経細胞集団活動の解析を可能にする技術を開発することを目的としている.
3年目にあたる本年度は,キネティック・イジングモデルを用いた状態空間モデルの推定精度および計算時間等の定量的検証を行った.また,キネティック・イジングモデルの古典的モデルである非対称Sherrington-Kirkpatrickモデルに対する秩序・無秩序相転移およびパターン生成等の基礎的特徴について理論的な研究を行い,厳密解を得る等の成果を得た.これらに加えて,従来型の状態空間-イジングモデルの実データへの適用も行った.特に,本年度出版された論文(Shomali, Ahmadabadi, Rasuli, Shimazaki. Communications Biology, 2023)の中で,Allen Instituteが提供する覚醒下のマウスの第一次視覚野神経細胞集団から記録した3つの神経細胞集団のスパイク時系列データに本手法を適用することで,視覚刺激等の影響で変動する発火頻度の影響を取り除いた上で,強い負の3次相関が見出せることを示した.これにより,当該論文の主張を強く補完することができた.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

キネティック・イジングモデルを用いた脳の巨視的な状態量の定量化に向けた実データ解析の研究および関連研究のサーベイを進める.

Strategy for Future Research Activity

キネティック・イジングモデルを用いた脳の巨視的な状態量の定量化に向けた実データ解析の研究および関連研究のサーベイを進める.

Causes of Carryover

自身の異動に伴い短期支援員の継続雇用ができなかったため.来年度は,短期支援員および開発環境整備に使用する.

  • Research Products

    (9 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results)

  • [Int'l Joint Research] Basque Center for Applied Mathematics/IKERBASQUE(スペイン)

    • Country Name
      SPAIN
    • Counterpart Institution
      Basque Center for Applied Mathematics/IKERBASQUE
  • [Int'l Joint Research] IPM/University of Tehran/University of Guilan(イラン)

    • Country Name
      IRAN
    • Counterpart Institution
      IPM/University of Tehran/University of Guilan
  • [Journal Article] Uncovering hidden network architecture from spiking activities using an exact statistical input-output relation of neurons2023

    • Author(s)
      Shomali Safura Rashid、Rasuli Seyyed Nader、Ahmadabadi Majid Nili、Shimazaki Hideaki
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 6 Pages: 1, 18

    • DOI

      10.1038/s42003-023-04511-z

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Winter Workshop on Mechanism of Brain and Mind 20232023

    • Author(s)
      Ken Ishihara, Hideaki Shimazaki
    • Organizer
      Mechanism of Brain and Mind
  • [Presentation] State-space analysis for neural population dynamics2022

    • Author(s)
      Hideaki Shimazaki, Ken Ishihara, Ulises Rodriguez Dominguez, Sai Sumedh Hindupur, Miguel Aguilera, S. Amin Moosavi, Magalie Tatischeff, Jimmy Gaudreault, Christian Donner
    • Organizer
      NEURO2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The state-space kinetic Ising model for nonequilibrium neuronal dynamics2022

    • Author(s)
      Ken Ishihara, Hideaki Shimazaki
    • Organizer
      NEURO2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Consciousness and the thermodynamics of the Bayesian brain.2022

    • Author(s)
      Hideaki Shimazaki
    • Organizer
      International Symposium on Artificial Intelligence and Brain Science 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 神経細胞集団活動の数理とデータ解析2022

    • Author(s)
      島崎秀昭
    • Organizer
      日本応用数理学会
    • Invited
  • [Presentation] 脳の認識のダイナミクスと時間遅れ2022

    • Author(s)
      島崎秀昭
    • Organizer
      2022年度 RIMS 共同研究(公開型)「時間遅れ系と数理科学:理論と応用の新たな展開に向けて」
    • Invited

URL: 

Published: 2023-12-25  

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