2023 Fiscal Year Research-status Report
Radiogenomicsのための動的心臓形状・ゲノム・生活習慣情報モデリング
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20K19924
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
宮内 翔子 九州大学, システム情報科学研究院, 助教 (40828555)
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2020-04-01 – 2025-03-31
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| Keywords | 心臓MRI / 遺伝子情報 / 虚血性心疾患診断支援システム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
拍動による形状変形を伴う心臓を対象として，動的な3次元形状情報とゲノム情報および生活習慣の関連性について分析することで，radiogenomicsのための相関モデルの構築を目指し，研究を進めている．
2021年度までに，UK Biobankから取得した4次元の心臓MRI情報を低次元空間に圧縮し，心臓の動的形状情報として抽出するための深層学習モデルを構築した．2022年度は，これらを用いて，心臓の動的形状情報とメタデータを入力とする，虚血性心疾患診断支援システムの構築を行った．本支援システムは，生成モデルとMultilayer perceptronを組み合わせることで構築されており，疾患の診断に寄与している心臓の解剖学的特徴を，圧縮前の元の空間で可視化することが可能である．200名分のデータセットを用いた実験を通して，心臓の動的情報もしくは生活習慣情報等の患者メタデータのみを入力として用いる場合よりも，２つの情報を同時に入力した場合に診断精度が向上することを確認した．この研究成果は，国内の研究会にて発表済みである．さらに，構築したシステムを，ゲノム情報も入力として扱えるよう拡張し，ゲノム情報を入力情報として追加することで，診断精度が向上することを確認した．本研究成果は，2023年度の国際学会にて発表済みである．
2023年度は，ゲノム情報を入力とするネットワークのさらなる診断精度向上のために，新しいシステムの構造について検討を行い，その成果を国内学会で発表した．また，循環器内科医と連携しつつ，入力として扱う患者情報についても再検討を行い，データセットの再作成を行った．さらに，心臓のより詳細な動きの変化を捉えるため，動的形状情報の時間分解能を高めるためのネットワークを構築し，この研究成果を国際学会のワークショップで発表した．
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
研究成果の発表を，国際学会，国際学会のワークショップ，国内学会で計3件実施できたため．
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は，これまでに構築したネットワークのさらなる精度向上を目指し，循環器内科医と連携しつつ，システムに入力する新たなメタデータおよびネットワーク構造の検討を引き続き行う予定である．また，研究成果を論文としてまとめることを目指す．
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| Causes of Carryover |
ライフイベントにより研究を中断したため．
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